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  • Gephi

    2019-09-27 05:52:43
    https://gephi.org/users/supported-graph-formats/csv-format/ http://www.tuicool.com/articles/fAf2Ibm https://www.udemy.com/gephi/ 转载于:https://www.cnblogs.com/huangshiyu13/p/6626239.html

    https://gephi.org/users/supported-graph-formats/csv-format/

    http://www.tuicool.com/articles/fAf2Ibm

    https://www.udemy.com/gephi/

    转载于:https://www.cnblogs.com/huangshiyu13/p/6626239.html

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  • gephi

    千次阅读 2013-09-19 22:49:25
    备忘:gephi中导出社区分类数据的方法!  2013-07-25 22:51:00| 分类: 默认分类 |字号 订阅 软件gephi中导出社区分类数据的方法 首先导入网络,在统计栏目计算好modularity参数及图形;然后导出...

    备忘:gephi中导出社区分类数据的方法!  

    2013-07-25 22:51:00|  分类: 默认分类 |字号 订阅

    软件gephi中导出社区分类数据的方法

    首先导入网络,在统计栏目计算好modularity参数及图形;然后导出相关数据。

    具体方法为下图所示:

    菜单:window/Data Table/Nodes/Modularity Class 选择 Export table 选择 保存为csv文件即可。

    备忘:gephi中导出社区分类数据的方法! - COMPLEX - 复杂天下

     

    在matlab中可以将两列矩阵绘制出来,图形会较gephi要清晰一些。

    >> plot(A(:,1),A(:,2),'*')

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  • Gephi 入门使用

    万次阅读 多人点赞 2018-04-08 18:13:28
    第一部分: Gephi 的安装与基本使用 1.安装 Gephi 下载地址: https://gephi.github.io/users/download/,下载后安装即可,如果能够正常打开 Gephi,跳过下面提示。 提示:如果安装完后出现“cannot find java...

    第一部分: Gephi 的安装与基本使用

    1.安装 Gephi

    下载地址: https://gephi.github.io/users/download/,下载后安装即可,如果能够正常打开 Gephi,跳过下面提示。
    提示:如果安装完后出现“cannot find java 1.6 or higer”,解决方法如下,点击链接 http://www.itmop.com/soft/downinfo/7809.html,下载安装,安装jdk之后便可正常打开 Gephi。

    2.基本使用

    (1)文件导入

    点击菜单栏中的“文件” —“打开” 后即可输入选择的文件,支持的文件类型有很多,可以在“文件类型” 中选择,输入文件后产生一个输入报告,报告中有关于节点和边的信息等。点击输入报告中的“确定” 后,产生一个初始图像。若要从数据库中导入,则选择“文件” —“输入数据” —“边名单” 。若要随机生成一个随机图,则选择“文件” —“生成” —“随机图” ,可以输入点数和连线的概率。
    (2)可视化操作
    可以滚动鼠标滑轮,对图像进行放大缩小,点击鼠标右键可以将图形进行拖动。
    (3)布局/流程
    可以选择下拉框中的 12 种布局方式,前六种是主要布局工具,后面六种是辅助布局工具。选择一种布局算法,点击运行即可看到布局效果。最常用的是力导向算法(Force Atlas 和 Forceatlas 2)、圆形布局和胡一凡布局。
    布局算法
    (4)统计
    图的特征可在统计功能模块中计算得到,其模块如左图。单击左图中标记区域,可计算相应的图的特征数值,如要查看详细内容,可单击“问号”图标 产生相应的报告。
    统计
    (5)排序
    排序模块如下图,基本功能在图中标示。
    这里写图片描述
    (6)分割
    分割也是一种归类,把值相同的节点或边用不同的颜色标示出来,还可把值相同的节点组合成一个节点。
    (7)过滤
    在作图过程中经常需要把一些值相同的节点或边选择出来,此时需要用到过滤工具,通过过滤功能实现选择或者将符合条件的节点和边过滤出来。
    (8)预览
    预览是输出控制的环节,在预览界面可以对前面编辑的图形做最后的美化,包括图形外观样式的选择和显示细节的调整,之后便可导出图形。

    第二部分 : Gephi 可视化步骤

    1.Les Miserables 样例可视化步骤

    以 Gephi 自带样例“Les Miserables” 为例, 可视化步骤如下:
    (1)打开 Gephi 软件,在弹出的欢迎窗口中选择“样例——Les Miserables.gexf”,选择“Directed”,单击“确定”,可以看到如下图样式的图像, 因为网络图是随机生成的,所以每次打开看到的图形可能会有些不一样。
    打开样例
    输入报告
    最后结果
    (2) 利用鼠标可以完成一些基本的操作。 例如,按住右键移动图形,滚动滑轮放大缩小图形视图。然后选择“流程”模块,点击“选择一个流程”,选择“ForceAtlas” ,将斥力强度由 200 调为 10000,再点击“运行”,运行结果如下图所示。
    运行结果
    (3)选择“排序”模块,在“选择一个等级参数”中选择“度”,点“运行”,在此模块左下角有“结果列表”按钮,点击之后会显示排序结果,例如 Valjean有 36 条联系,为所有节点中联系最多的节点,运行结果如下图所示。
    样例排序
    (4)在“统计”模块中选择“边概述”下的“平均路径长度”,点击“运行”,选择“有向”,点击“确定”之后会生成一个报表,关闭即可。返回“排序”模块,选择“Betweeness Centrality”并运行,再选择此模块工具栏中的“钻石”图标,将最小值设为 10,最大值设为 50,运行后如下图所示。
    样例统计
    (5)此时图形中的大节点会遮挡住小节点,返回“流程”模块,在“由尺寸调整”后打勾,则图中的所有节点不会有遮挡或重叠的情况。图像的下方有工具栏,点击 T 字状的图标可以显示标签,并可以利用工具栏调节线条的粗细,字体及大小等。
    样例调整字体
    (6)点击“统计”模块“模块化”后的“运行”,再选择“分割”模块,点击“刷新”按钮,并选择“Modularity Class”点击“应用”。选择“滤波”模块,点“边”前面的加号将其展开,选择“边的权重”,鼠标左键点住不放将其拖到下方的“查
    询框”下,并将滑条拖至“2”处,点击“滤波”,运行结果如下图所示。
    样例过滤
    感觉很丑、很别扭
    (7)点击“预览”,在预设置中的“显示标签”后打勾并刷新,显示结果如下。
    结果展示
    此时可将可视化的结果输出,点击左下角的“SVG/PDF/PNG”,可输出此三种格式。选择菜单栏中“文件”下的“保存”则可将结果保存。

    2.总结:

    可视化一般要经过以下几个主要步骤:
    (1)打开文档或生成一个随机图;
    (2)利用“排序、流程、统计、分割、滤波”五个主要工具对图形进行可视化,可视化的顺序一般也是按照排序、流程、统计、分割、滤波的顺序进行的;
    (3)对结果进行预览,输出并保存

    第三部分: 用 Gephi 计算网络指标并进行可视化

    以分析浏览网站间的链接关系为例,计算其网络指标,并进行可视化,实验步骤如下:
    (1) 通过浏览网站获取数据首先需要安装一个 Gephi 的 Http 代理插件,通过代理 Gephi 可以自动分析浏览网站之间的链接关系。代理插件名称为 Http gragh,插件下载地址: https://gephi.org/plugins/#/plugin/http-graph,下载的文件是一个以 nbm 为后缀的 gephi 插件文件,在 gephi 的主界面的工具—插件中,选择下载好的插件,然后按照提示安装即可。
    (2) 安装成功后,在文件—生成—可以看到 http gephi。然后需要配置浏览器的代理服务器设置,设置为与 http graph 的 proxylistening 端口设置的一样就可以了,默认是 8088。
    HTTP gephi
    端口
    以 chrome 浏览器为例。 在 chrome 浏览器的“设置” 里选择“高级设置” 中的“更改代理服务器设置”
    选择“局域网(LAN 设置)”,在“为 LAN 使用代理服务器” 前打勾
    设置代理
    点击“高级”,将端口改为 8088 后点“确定”。
    代理
    注意:这时候浏览器访问使用了代理,如果没有启用gephi的HTTP Graphi插件功能,则不能访问网站
    未启用
    启用插件之后就会显示
    启用之后浏览器
    (3)打开浏览器,本浏览器以 360 导航为首页, 启动 Gephi,选择文件—生成—HTTP Graph,就会有图形出现,说明配置已生效,滚动滑轮并适当调大标签字体,则会生成下图所示的图像。
    启用之后gephi
    (4)再打开百度首页,输入 Gephi 并查询,则会生成新的的节点和边,根据访问的网页,会生成相应的节点,访问的网页越多生成的节点也越多。
    打开网页
    (5)可以利用“统计”模块中的功能计算所需要的网络指标,我这里使用了模块化和统计里的变得权重。
    (6)在排序模块中选择“度”,调整颜色,将节点的最大尺寸调为0到 50,在点击边,可对边的颜色进行美化,点击“预览” —“刷新”,即可得到如下图所示的图像。
    最终结果
    (7)输出并保存文件即可
    可以看出我访问的网站是从本地代理发出,主要访问两个网站:百度和csdn。

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  • Gephi初体验

    千次阅读 2016-11-13 16:55:24
    Gephi

    话不多说,大家看看图就会操作

    导入数据

    • 文件->打开->选择文件

    这里写图片描述

    设置层级颜色区分

    • 统计->模块化

    这里写图片描述

    这里写图片描述

    这里写图片描述

    这时候我们要转战场了,调整外观,如下图

    选择节点->数值设定->Modularity Class(如果没有运行模块化则没有此选项)

    这里写图片描述

    选择布局

    ok,现在到了关键时刻,离成功不远了,选择一个展示布局,这里我们选择Yifan Hu,然后运行,就OK了。

    这里写图片描述

    这里写图片描述

    最终效果图

    这里写图片描述

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  • gephi 下载地址

    2018-08-17 10:38:22
    gephi 下载地址
  • gephi_0.8.2

    2018-05-12 21:15:04
    gephi_0.8.2
  • Gephi安装

    2019-10-01 22:57:08
    Gephi for mac https://gephi.org/users/download/ 在官网上下载gephi-0.9.1-macos.dmg双击拖到Application里面就好了,注意有的需要修改电脑的权限呢。 Gephi for win https://gephi.org/users/download/ 在...
  • Gephi简介

    万次阅读 2017-05-22 20:55:49
    第一章.Gephi简介  1.1 最简单的8个图形:  简单的节点连线图:  1.2 Gephi图形界面  主界面中的Data Laboratory界面,这里主要用来查看数据,注意:节点和边的数据是分开的。  就像GML文件中的节点...
  • Gephi使用教程

    2017-12-23 11:33:28
    Gephi教程主要介绍了Gephi的使用方法,简单易懂的软件各个部分的使用方法
  • 但是每每在打开gephi,导入数据再运行时,总还是在心里暗自赞叹gephi的绚烂之极,无与匹敌,当然,gephi也有自己的缺陷,但是gephi是一个在发展的、进步的、不断壮大的开源软件。纵使她曾经那般伤我,我仍是对其...
  • Gephi使用

    2020-08-03 17:06:05
    Gephi使用 1.导入数据,根据数据性质选择有向或者混合。 文件——打开——选中需要分析可视化的数据。 Gephi支持多种数据格式,常用gxef、gml和csv。分析绘图时点开概览,让我们需要用到的工具窗口显示出来。 2.布局...
  • gephi绘图工具

    2018-03-12 17:34:25
    gephi是一个网络结构绘图工具,可以度量社交网络结构属性
  • 1.安装Gephi 首先安装JRE,jre-8u121-windows-x64 然后安装Gephi软件,gephi-0.9.1-windows 链接地址(含有接下来所有需要处理的数据):  链接:https://pan.baidu.com/s/1HMfymQ7SgAQQT3pKsxhrrg 密码:487f...
  • Gephi入门简介

    2018-02-07 14:48:00
    介绍Gephi的可视化利器,帮助大家快速了解,有需要的话,会在以后更新。。
  • Gephi_1_Gephi安装与cannot find Java 1.8 or higher

    万次阅读 多人点赞 2019-05-05 12:25:52
    1.Gephi安装 1.下载地址:https://pan.baidu.com/s/1NwrMa7KOxzP-RwsHwQAOlQ ,提取码:p0sp,提取后按软件步骤提示安装即可。(版本为Gephi-0.9.2) 2.如果能够正常打开Gephi,congratulations,直接进入即可,后文...
  • Gephi Version 0.9.1

    2016-11-06 16:44:00
    Gephi is an open-source and multiplatform software distributed under the dual license CDDL 1.0 and GNU General Public License v3.
  • gephi练习数据

    热门讨论 2013-03-21 14:26:14
    Gephi学习时可以用到的一些很好的数据……
  • Windows安装gephi

    2020-10-17 09:24:35
    在安装gephi前需要确定已经配置了java环境。打开cmd,输入 java -version,回车。 我之前已经安装好了Java,所以我接下去就直接安装gephi了,没有安装的同学可以去搜一下,很多。 下载安装Gephi 第一步,下载Gephi...
  • Gephi中文教程

    2015-11-17 00:44:00
    Gephi中文教程,可以看一下,中文的,嗯,大概差不多了
  • Gephi教学视频二

    2018-02-07 14:49:52
    Gephi教学视频第二课,欢迎大家打赏了,以后会急需更新的!!
  • 继在园子里写的《Gephi可视化(一)——使用Gephi Toolkit创建Gephi应用》介绍了如何使用Gephi Toolkit工具集进行可视化编程后,本篇对Gephi Toolkit进行一个详尽的介绍,了解其工作原理以及与Gephi应用程序之间的...
  • gephi使用详细教程

    2018-07-11 17:31:13
    数据可视化软件Gephi的使用方法,如何导入数据并生成想要的图,都有非常详细的讲解和例子,并且含有可用于练习的数据资源

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