imageJ插件开发失败经验
 
我了解到的imageJ（java语言开发）的插件的开发方法有三个：
 ①编写c++程序，编译生成dll文件，然后通过java语言调用
 ②imageJ宏语言开发，算是imageJ的集成语言，调用imageJ的库
 ③java语言直接开发
 
网盘资料：（里面只有一个ij.jar以及一个imageJ的小部分中文教程，需要可以下载）
 链接：https://pan.baidu.com/s/1JK4vvdLP76QqjOVQof0yfg
 提取码：d94i
 
开发的思路
 
我实验的是第一种方法，也就是c++编译生成dll文件的那种，由于我所拥有的是matlab代码，要做成插件，然后在将matlab代码转成c++代码的时候发现太麻烦了，然后想走捷径，就想到了混合matlab与vs2019的混合编译，因为matlab也能生成dll文件，并且c++能够调用，并且在后续的实验中也发现了java程序也一样能够调用，但是结果就是能够实现，但是就是需要matlab的安装环境，也就是说需要安装matlab，不符合项目的要求，所以最后放弃了。
 
插件开发思路
 
创建一个class类（我使用的是Apache NetBeans IDE 12.4）
 
代码来自jni开发教程
 
创建一个Java工程
 
 把它放在你的文件夹里面，然后添加一个类
 
 输入以下代码
 
public class test_Plugin_four_ {
    public static native String sayHello(String name); 
    
    public static void main(String[] args) {
      System.load("F:\\310project\\HNwork\\plugin\\test_Plugin_four\\test_dll_four\\x64\\Debug\\test_dll_four.dll"); 
        System.out.println("Strat to work");
        String text = sayHello("xiaoming");
        System.out.println(text);
    }
 
其中加载dll库的句子可以先不加，不影响，主要是后面调用的。
 记得修改以下类名称就行，保存
 
 
生成c++头文件
 
windows + r 然后输入cmd
 
 然后进入到你创建的java文件的目录下
 
 然后编译java程序
 
javac test_hello.java
 
再编译生成头文件：
 
javah -jni test_hello
 
注意不要后缀class
 
 然后你的文件夹下面就会有c++的头文件了
 
 
创建c++ 项目
 
直接选空项目就行
 
 右键源文件，添加一个c++文件
 
 修改名称后确定
 
然后将刚刚生成的头文件复制到你创建的c++项目的文件夹下：
 
 然后添加以下代码：
 
#include "test_hello.h"

#ifdef __cplusplus
extern "C"
{
#endif
	/*
	* Class: com_study_jnilearn_HelloWorld
	* Method: sayHello
	* Signature: (Ljava/lang/String;)Ljava/lang/String;
	*/
	JNIEXPORT jstring JNICALL Java_test_1hello_sayHello(
		JNIEnv* env, jclass cls, jstring j_str)
	{
		const char* c_str = NULL;
		char buff[128] = { 0 };
		c_str = (*env).GetStringUTFChars(j_str, 0);
		if (c_str == NULL)
		{
			printf("out of memory.\n");
			return NULL;
		}
		(*env).ReleaseStringUTFChars(j_str, c_str);
		printf("Java Str:%s\n", c_str);

		//		sprintf_s(buff, "hello %s", c_str);
		printf("hello :%s\n", c_str);

		return (*env).NewStringUTF("Hello,I am xiaoming");
	}
#ifdef __cplusplus
}
#endif
 
然后你会发现一大堆错误，不要慌，我们首先将工程修改为x64工程，如下：
 
 然后再右击项目，点击属性，进入到属性页面：
 
 中间有个配置类型，修改为dll文件
 
 再将java的环境添加进去，点击vc++目录，包含目录，添加你的java环境
 
 按确认，应用然后错误就消失了，然后生成解决方案，你就会发现在你的c++项目的文件夹下就可以看见生成的dll文件了
 
 然后复制路径，和名称，写入你的java程序里面
 
 然后运行，出现
 
 那么恭喜你，已经成功第一步了。完成了Java和c++的通信，接下来就是生成插件了。
 
生成imageJ插件
 
在imageJ的菜单栏的那一项，点击plugin里面，你会发现有一个new，里面提供有imageJ插件开发的例程，例程里面有三个选项，具体选哪个，我们可以根据自己的需求来，我们在这里选择的是有界面的
 
 这个是官方提供的例程，我们加点控件啥的，如下，创建了三个控件，然后是点击step1 会加载我们生成的dll库，然后接收返回的值，作为log打印：
 
import static ij.IJ.log;
import static ij.IJ.showMessage;
import ij.process.*;
import ij.gui.*;
import java.awt.*;
import ij.plugin.frame.*;
import java.awt.event.ActionEvent;
import java.awt.event.ActionListener;
import javax.swing.JButton;
import static javax.swing.JFrame.EXIT_ON_CLOSE;
import javax.swing.JLabel;

public class test_hello extends PlugInFrame{
    Panel panel;
    
    public static native String sayHello(String name); 
    
    public test_hello() {
        super("test_Plugin_four_");
        panel = new Panel();
        panel.setLayout(new GridLayout(3,1,15,50));
                
        Button btn1 = new Button("Step 1");
        panel.add(btn1);
        btn1.addActionListener(new ActionListener(){
        public void actionPerformed(ActionEvent e){

        System.load("F:\\test_hello\\test_hello_dell\\x64\\Debug\\test_hello_dell.dll"); 
                
        log("star to work");
//                System.load("D:\\fiji-win64\\Fiji.app\\test_dll_four.dll"); 
        String text = sayHello("xiaoming");
        log (text);
                    }
                });
                
        Button btn2 = new Button("Step 2");
        panel.add(btn2);
                
        Button btn3 = new Button("Step 3");
        panel.add(btn3);
                
        add(panel);
        pack();
        GUI.center(this);
        setVisible(true);
    }
}
 
当我们把代码加进去，会发现有很多错误，如下：
 
 那是因为我们没有导入imageJ的包，当时为了尽快验证，所以就直接下了ij.jar文件然后导入就算了，没有进行太多的操作，懂的小伙伴可以自己试试。
 将ij.jar放在目录下面：
 
 然后在你的java项目下面添加进去就可以了
 
 右击Libraries然后选着Add jar,然后选择你ij.jar放置的目录下就行了，
 
 错误解决后，更改以下system.load()函数的路径就可以了。
 然后如下：
 
 
 就表明已经生成了插件，插件的位置在你的java目录下的dist文件里面：
 
 
将插件放入到你的imageJ的目录下的plugin里面就行了
 
 接着打开你的imageJ，在plugin下面能找到你的插件的名字了，运行效果如下：
 
 
 这样子插件就已经完成了，需要的话根据项目修改就可以了。
 
一些小知识
 
①网上的资料很多，其实真的也很杂，所以看到一个完整的教程不容易，所以需要不断的尝试。
 ②你创建的插件一定要带下划线_,你可以生成后再修改也行，但是这是imageJ里面规定的
 ③如果你的生成插件里面有package（java导包的语句），imageJ是不会识别到你的插件的，其实你按照流程走，不自己创建文件夹，是不需要要package语句的
 ④可以学习以下jni的相关知识，里面有很多包括native的一些说法，以及很多函数
 
最后
 
如果有大佬是做过我的那个方法的话，可以评论留下联系方式，我联系你，我讲一下我的那个思路和目前做到的步骤。
 （想法：Java既然能够调用c++生成的dll文件，而vs2019和matlab也是可以混合编程的，那么理论上这种方法做的插件应该是可以的，但是事实上也是，但是需要依赖matlab的环境，也就是说在计算机的环境里面添加matlab
 目前的步骤：Java调用没问题，插件也没问题，除了出不了matlab的窗口，但是可以调用matlab的引擎，但是还是那句话需要用到matlab的安装环境，其实尝试过将matlab的安装文件复制出来试一下调用了那些库，但是最后放弃了，因为初衷已经不一样了。
 ）

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
ImageJ 中编写插件
 
 
 
 
 
运行ImageJ ->plugins ->New ->plugin
 
 
 
 
 
加入以下源码
 
 
 
------------------------------------------------------
 
-- My_Plugin.java
 
 
 
import ij.*;
 
import ij.process.*;
 
import ij.gui.*;
 
import java.awt.*;
 
import ij.plugin.*;
 
import ij.plugin.frame.*;
 
 
 
public class My_Plugin implements PlugIn {
 
 
 
 public void run(String arg) {
 
 IJ.showMessage("My_Plugin","Hello world!");
 
 }
 
 
 
}
 
 
 
-------------------------------------------------------
 
 
 
Ctrl + R 运行
 
 
 
 
 
 
 
eclipse 中编写ImageJ 插件
 
 
 
运行eclipse ->File ->New ->Java Project ->项目名填 PP_PP ，选Use default JRE ->Next ->Libraries ->Add External JARs ->选择ImageJ 安装目录中的ij.jar ->Finish
 
 
 
新建PP_PP 源文件，加入以下代码：
 
 
 
 
 
---------------------------------------------------
 
-- PP_PP.java
 
 
 
import ij.*;
 
import ij.process.*;
 
import ij.gui.*;
 
import java.awt.*;
 
import ij.plugin.*;
 
import ij.plugin.frame.*;
 
 
 
public class PP_PP implements PlugIn {
 
 
 
 public void run(String arg) {
 
 IJ.showMessage("My_Plugin","Hello world!");
 
 }
 
 
 
}
 
 
 
-----------------------------------------------
 
 
 
保存(eclipse 是既保存既编译的) ->将生成的 PP_PP.class 文件复制到ImageJ 的plugins 目录。
 
 
 
 
 
运行ImageJ ->Plugins ->Compile and Run ->选择PP_PP.class
 
 
 
 
 
 
 
一种更方便的方法是把项目的输出目录设置成ImageJ 的Plugins 目录，这样就省去了复制PP_PP.class 的麻烦：
 
 
 
 
 
首选取消IDE 的自动清空输出目录（重要！不然ImageJ 的Plugins 目录会被清空!!!!）
 
 
 
 
 
选择项目属性 ->Java Compiler ->Building ->Configure Workspace Settings ->Enable project specific settings ->Output folder ->取消Scrub output folder when cleaning projects 这一项（重要！！）
 
 
 
 
 
 
 
Java Build Path ->Default output folder ->Browse ->在项目名上点一下 ->Create New Folder ->Advanced ->选择Link to folder in the system ->然后选ImageJ 的Plugin 目录
 
 
 
一路OK 后掉示要删除bin 目录，点确定删除掉。
 
 
 
 
 
 
 

 
ImageJ支持计算机全平台：ImageJ是用Java编写的，它允许它在32位和64位模式下在Linux，Mac OS X和Windows上运行。
 
开源：ImageJ及其 Java源代码 可在公共领域免费获得 。无需许可证。
 
用户社区：ImageJ拥有庞大且知识渊博的全球用户社区。超过1700名用户和开发人员订阅了 ImageJ邮件列表。
 
宏：使用宏自动执行任务并创建自定义工具 。使用命令记录器生成宏代码 并使用宏调试器对其进行 调试。 ImageJ网站上提供了300多个宏 。
 
插件：通过使用ImageJ的内置文本编辑器和Java编译器开发插件来扩展ImageJ。超过500个插件可用。
 
工具包：使用ImageJ作为图像处理工具包(类库)来开发 applet，servlet或应用程序。
 
速度：ImageJ是世界上最快的纯Java图像处理程序。它可以在0.1秒(*)内过滤2048x2048图像。那是每秒4000万像素！
 
数据类型：8位灰度或索引颜色，16位无符号整数，32位浮点和RGB颜色。
 
文件格式：打开并保存所有支持的数据类型，如TIFF(未压缩)或原始数据。打开并保存GIF，JPEG，BMP，PNG，PGM，FITS和ASCII。打开DICOM。使用URL打开TIFF，GIF，JPEG，DICOM和原始数据。使用插件打开并保存许多其他格式 。
 
图像显示：工具提供了用于缩放(1:32到32：1)和滚动图像。所有分析和处理功能均可在任何放大倍数下工作。
 
选择：创建矩形，椭圆形或不规则区域选择。创建线和点选择。编辑选择并使用棒工具自动创建它们。绘制，填充，清除，过滤或测量选择。保存选择并将其传输到其他图像。
 
图像增强：支持8位灰度和RGB彩色图像的平滑，锐化，边缘检测，中值滤波和阈值处理。交互式调整8,16和32位图像的亮度和对比度。
 
几何操作：裁剪，缩放，调整大小和旋转。垂直或水平翻转。
 
分析：测量选区或整个图像的面积，平均值，标准偏差，最小值和最大值。测量长度和角度。使用真实世界的测量单位，如毫米。使用密度标准进行校准。生成直方图和剖面图。
 
编辑：剪切，复制或粘贴图像或选择。使用AND，OR，XOR或“混合”模式粘贴。向图像添加文本，箭头，矩形，椭圆或多边形。
 
色彩处理：将32位彩色图像分割为RGB或HSV组件。将8位组件合并为彩色图像。将RGB图像转换为8位索引颜色。将伪彩色调色板应用于灰度图像。
 
栈：在单个窗口中显示相关图像的“堆栈”。使用单个命令处理整个堆栈。以堆栈形式打开图像文件夹。将堆栈保存为多图像TIFF文件。
 

  
 

 
文章目录
 
前言
一、ImageJ的下载
二、ImageJ的安装
三、给ImageJ添加自定义插件
四、ImageJ闪退怎么办

 
 
前言
 
该软件是一个使用Java语音编写的图像处理和分析软件。ImageJ基于插件架构体系设计，可以通过编写插件对其功能进行扩展
 
 
一、ImageJ的下载
 
这款软件是完完全全免费的！而且前人已经开发出了许许多多，针对不同需求的插件，可以直接安装调用。
 
但是，由于它基于Java，所以电脑上必须先配置Java环境，配置教程直接百度
 
选择需要的Java版本下载：java_downloads
 
 
那么在哪里可以下载ImageJ？
 
ImageJ：ImageJ_downloads
ImageJ的使用手册：Image_J_documentation
ImageJ网页版：网页版（用Chrome浏览器打开）网页版第一次加载会比较慢，要耐心等待
Fiji：Fiji_downloads
 
如果不想手动安装插件，此处推荐下载Fiji
 （说明：Fiji其实就是ImageJ，这个名字其实就是：Fiji is just ImageJ的首字母。Fiji和ImageJ的区别是：Fiji自动包含了各种有用的插件，而ImageJ需要手动安装插件）
 
 选择你需要的版本，下载好是一个288M的压缩包
 
如果官网下载失败，也可以尝试在GitHub或者CSDN上找资源
 
 
二、ImageJ的安装
 
怎么安装ImageJ？
 
ImageJ不需要安装，解压后有这样一个文件夹
 
 直接点击里边的ImageJ-win64.exe就可以运行
 
 出现这样一个标志即打开成功
 
 操作界面如上所示，出现此界面说明你安装成功
 
 
三、给ImageJ添加自定义插件
 
打开软件后，通过file→open或者直接拖动的方式开启图档。操作界面中的指令可以对其进行不同的处理。
 
如何将自己编写/下载的插件安装到ImageJ？
 为ImageJ编写的插件必须放在ImageJ安装目录的子目录“plugins”下，切必须命名为带有下划线的格式，例如：
 
 将其中的jar文件放在“plugins”目录下，软件会在启动时自动加载这样格式的文件，而后就可以在操作界面的“plugins”按钮下找到自定义的插件。
 
 这样就可以按照自定义的要求处理图像啦~
 
 
四、ImageJ闪退怎么办
 
1.ImageJ的存储路径下不要出现中文命名文件夹
 
 全英文为好，而且最好不要放在C盘
 
 
2.检查电脑中的Java环境是否配置好，或者Java版本是否过低。有以上情况均可能导致有问题。
 怎么检查Java环境？
 
打开电脑命令提示符
 
 在其中分别输入java -version；java；javac
 如果正常出现文字即配置正确
 
 
3.更多的问题可以去官方Troubleshooting里找答案
 
Windows installation：链接
 Troubleshooting：链接