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  • linux下后台运行MATLAB

    2021-04-22 02:42:26
    Running Matlab Remotely (Under Linux)Usually, it is most effective and convenient to run Matlab locally, in particular for interactive work, but there are a number of reasons why you might want to run...

    Running Matlab Remotely (Under Linux)

    Usually, it is most effective and convenient to run Matlab locally, in particular for interactive work, but there are a number of reasons why you might want to run Matlab remotely across a network. For instance, your local machine may not have Matlab installed at all, or your local machine may not have sufficient memory for your task. In these cases, you can consider accessing another computer by remote login and running Matlab there. This concept only makes sense under Unix/Linux on the remote machine; Windows or Macintosh do not allow for remote access (as far as I know). Hence, for any new windows to be opened, also your local system needs to be Unix/Linux. However, the performance of such remote windows may be so slow that you will want to avoid them anyway and rather run Matlab purely inside your login shell; naturally, this precludes any graphical output and restricts this use to numerical tasks only.

    So, we want to start Matlab (i) without its desktop and (ii) without any graphics (including the splash screen); this can be accomplished by saying matlab -nodisplay . You could also use matlab -nodisplay -nojvm , which additionally does not start the JVM. In both cases, attempts to open plot and similar windows might be simply ignored or attempts to open the documentation windows might result in various error messages.

    The above is the most restrictive way in which to start Matlab. If in fact your local machine is Linux, you could use matlab -nodesktop -nosplash , which (i) does not start the desktop and (ii) suppresses the splash screen (the small window with Matlab's logo and version number that usually pops up briefly). But this way of starting Matlab does start the JVM and you have access to the HelpBrowser as well as to plot windows, if you later so desire (and are willing to wait for those to open, which might take a while depending on your network connection).

    Running Matlab in the Background (Under Linux)

    The idea of running a job in the background means that a software runs without any user interaction and additionally does not block your login shell. As remote access, this makes only sense under Unix/Linux. It applies both on your local machine, but might be particularly useful on a remote login; as in the previous section, this will be most useful for purely numerical (i.e., non-graphical) jobs. nohup /matlab -nojvm -nodisplay < driver.m >& driver.log &

    Here, the backslash in /matlab circumvents any possible alias you might have for Matlab (just to be on the safe side) and the options -nojvm -nodisplay suppress the starting of the JVM (and the startup of the desktop) and the opening of any windows. The final ampersand ("&") actually puts the command into the background, i.e., gives you the command-line prompt in your shell back. Aside from entering any usual commands now, you could in particular log out, without hanging or killing your job, because of the standard Unix/Linux command nohup before the call to Matlab. The file driver.m that must be present in the current directory is a Matlab script file (not: function file) that lists the commands to be executed by your job; if your job is actually performed by a function, this script file can simply be a single line that calls your function.

    For the remaining elements in the command-line above, I am assuming you are using the csh or tcsh shell; in other shells, the redirections may be slightly different. The "< " redirects stdin (namely from file driver.m ) into Matlab. For the background run not to hang, there must not be any screen output, so the ">& " redirects both stdout and stderr to the file driver.log ; this file must not exist initially. Again, the redirection commands may be different in other shells and slight variations are possible (such as overwriting an existing log file).

    无论是linux unix,用 nohup sh 'full command line' 都可以启动程序并让程序在后台运行,独立于终端。

    由于nohup启动的时候不会有图形界面,如果是matlab,建议不要用图形界面选项,执行什么命令预先写在m文件里面,如:

    nohup sh 'matlab -nodesktop < /data/user/myCommand.m'

    这里的

    用不用"&"在linux里面不重要。在linux里面,还有更加简便的方法。并且还有图形界面

    1)可以用screen命令,一般的2.6.12以上的内核都支持。

    screen matlab &

    这个时候,可以继续用matlab,退出终端用exit就可以了。

    如果没有 &。可以到终端,按ctrl-a 挂起,用命令bg将matlab转到后台,注意,这个时候不要忘记最重要的一步,千万人按一键或多按一个回车,然后用exit。要不然,一旦你结束sreen,matlab也就结束了。

    2)基于2.6.18以上内核

    起先自己一直这么用的,所以也就没有上心。以为linux原本就可以独立终端运行。刚才有看了一下,发现是2.6.16以后的新功能,就是2.6.18以后更加完善了。就是VM机制。当然,需要多核计算机支持。

    一 个终端在缺省时将试图用VM运行你的程序。ssh name@server以后,可以直接在linux主机上打开matlab,然后可以看到图形界面,你可以完成你要得工作,需要等待的时候。在终端,按 ctrl-z回到终端命令行,用bg命令置于后台。然后,用exit退出终端。这个时候,你会发现matlab还在你的电脑上运行。不过这个只是图形界 面。并且没有实质性的作用。就是x winserver在你的电脑上的一个 VM界面而已。

    另外一点,你的tty输出将存在主机的你的目录下。matlab的屏幕输出就看不见了。所以,务必将结果用标准输出,写入文件。

    3)matlab server. 这个针对性比较强,你的电脑需要安装matlabserver支持相关的工具箱,然后可以让server上的其他电脑替你完成你的运算。server的特 殊命令集在工具箱里都有定义,一般的运算和你在本地没有区别。关于server的问题,如果感兴趣很高兴再讨论。

    例子 如下

    /usr/bin/nohup /usr/local/matlab/bin/matlab -c /root/matlab_for_linux/crack/lic_standalone.dat -nodisplay < /usr/local/matlab/work/music_recommend_code_ver4.0/test.m 1> running.log 2>running.err &

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  • 这里以常用的Matlab为例,简单介绍在linux下如何用bash运行Matlab程序。第一步:将程序文件上传至服务器上传至服务器有两种方法,一是用U盘或其他物理介质拷贝至服务器中,该方法较为简单,只需要完成简单的挂载...

    购置服务器后,应安装相应的科学计算软件。对于有显示器的服务器,用户可以方便的使用图形界面操作软件。而对于常见的远程登录方式,或是无显示设备的服务器而言,一般采用bash命令操作软件。这里以常用的Matlab为例,简单介绍在linux下如何用bash运行Matlab程序。

    第一步:将程序文件上传至服务器

    上传至服务器有两种方法,一是用U盘或其他物理介质拷贝至服务器中,该方法较为简单,只需要完成简单的挂载操作即可,此处不再赘述。另一种则是利用ssh上传文件,为方便起见,推荐使用WinSCP进行文件的上传和下载。需要注意的是,若无法顺利登录服务器,请检查软件高级选项中的“隧道”选项卡中是否勾选并正确配置了ssh信息。

    第二步:切换工作目录

    该步骤仅需要运行cd命令切换至工作目录即可,注意该工作目录指的是程序所在目录。

    第三步:启动Matlab,运行程序

    在bash窗口下,Matlab不能显示图形界面,此时需要使用启动选项启动Matlab并执行程序。以运行当前目录下的example.m为例

    输入

    1matlab -nodesktop -nosplash -r example

    或者

    1matlab -nojvm -nosplash -r example

    亦或是

    1matlab -nodisplay -r example

    均可执行程序,并在bash窗口中观察到程序输出(含打印输出语句),该窗口与Matlab内建立命令行相同。

    值得注意的是,如果使用参数

    1-nodisplay -r

    运行程序,当程序中有figure()命令时会出错,可以使用如下语句限制图形的显示:

    1figure('visible','off');

    并使用如下命令将图形输出到文件:

    1print('-deps','example.eps');

    或者

    1hgsave('example.fig');

    附录 Linux下有关Matlab启动项的说明

    语法

    1

    2matlab

    matlab option1 ... optionN

    matlab option1 ... optionN 指使用指定的启动选项启动 MATLAB。

    启动选项

    选项

    结果

    -nodesktop

    运行JVM软件而不打开Matlab桌面,但help界面、preferences界面等仍可通过cmdline调出。此时Matlab不会在cmd history记录本次执行的命令

    -nodisplay

    启动JVM软件而不启动Matlab桌面,它会覆盖DISPLAY环境变量,即JVM启动但不能显示

    -nojvm

    启动Matlab而不启动JVM软件,不能运行需要Java软件的功能(例如桌面工具和图形显示)

    -nosplash

    不显示启动时的log画面

    -r statement

    执行指定的statement,指定为程序源码或指定为脚本或函数的名称。若statement为代码,需使用双引号将字符串引起。若statement为函数或脚本的名称,请勿指定文件扩展名,也不要使用引号。

    -logfile filename

    将命令行窗口输出(包括错误报告)复制到指定为字符串的filename中。

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  • 保持matlab进程在Linux服务器后台运行

    千次阅读 2020-04-23 05:04:02
    由于疫情而远程办公的缘故,笔者最近经常用到Linux服务器。...这款软件集成有SSH 会话功能和X11 server,可以很方便地加载图形界面,如图所示。 笔者使用服务器时,首先本地电脑打开MobaXterm的一...

    本文主要分为两部分,分别为matlab命令行启动和Linux服务器后台运行,后者可用于各种后台运行程序,如matlab、python等。

    由于疫情而远程办公的缘故,笔者最近经常用到Linux服务器。利用SSH协议可很方便地通过自己的笔记本远程访问服务器,从而进行操作。有很多商业软件可满足从个人电脑的windows平台访问远程Linux服务器,笔者正在使用的是MobaXterm。这款软件集成有SSH 会话功能和X11 server,可以很方便地加载图形界面,如下图所示。

    笔者使用服务器时,首先在本地电脑打开MobaXterm的一个SSH会话,连接到服务器后,就是一个终端界面。笔者常用服务器上安装的matlab进行数值计算,在终端输入matlab后,即出现matlab的窗口界面,与windows的完全一样,可正常使用。

    然而这样使用matlab需要始终保持SSH会话,也即本地电脑需要一直连接服务器,不能关机也不能断网。如果因某种原因SSH连接失败,则服务器正在运行的程序也会中断,辛苦跑了许久的仿真就白费了;此外,程序运行过程中会一直占据终端,从而导致无法做别的事。

    解决这一问题,可以从两个方面考虑:第一,尝试使用命令行方式运行matlab,而不打开图形化界面;第二,尝试让matlab的运行脱离SSH连接产生的终端而独立出来,当关闭与服务器的SSH连接后,服务器端仍然保持matlab的运行。

    • 1. matlab命令行方式运行

    • 1.1. 命令行运行方法

    文献1中详细介绍了命令行运行matlab的方法,这里引用其关键内容,并添加笔者的经验。在命令行下执行如下语句可获得matlab的帮助文档

    $ matlab -help

    需要注意的命令有

                                 [-display Xdisplay | -nodisplay]

                                 [--noFigureWindows]

                                 [-nosplash]

                                 [-desktop | -nodesktop | -nojvm]

                                 [-batch MATLAB_command | -r MATLAB_command]

                                 [-logfile log]

    -display Xdisplay - Send X commands to X server display, Xdisplay. Linux only.
    -nodisplay - Do not display any X commands. The MATLAB desktop will not be started. However, unless -nojvm is also provided the Java virtual machine will be started.
    -noFigureWindows- Disables the display of figure windows in MATLAB.
    -nosplash- Do not display the splash screen during startup.
    -desktop - Allow the MATLAB desktop to be started by a process without a controlling terminal. This is usually a required command line argument when attempting to start MATLAB from a window manager menu or desktop icon.
    -nodesktop - Do not start the MATLAB desktop. Use the current terminal for commands. The Java virtual machine will be started.
    -nojvm- Shut off all Java support by not starting the Java virtual machine. In particular the MATLAB desktop will not be started.
    -batch MATLAB_command- Start MATLAB and execute the MATLAB command(s) with no desktop and certain interactive capabilities disabled. Terminates upon successful completion of the  command and returns exit code 0. Upon failure, MATLAB terminates with a non-zero exit. Cannot be combined with -r.
    -r MATLAB_command- Start MATLAB and execute the MATLAB_command. Cannot be combined with -batch.
    -logfile log - Make a copy of any output to the command window in file log. This includes all crash reports.

    在帮助文档中可以看到与图形界面相关的几个参数是:nodisplay, nosplash, nodesktop, nojvm. 它们代表的含义上表解释的很清楚。

    由于Matlab的图形环境依赖JVM,如果不启动JVM,无法执行任何和图形界面相关的命令。若不执行任何X 命令,则无法执行imshow()等绘图函数。所以,我们如果需要在命令行下执行matlab程序,最好只添加:nodesktop nosplash两个参数。

    标红的为matlab两种命令行运行方式,-batch的方式直接默认不打开图形界面,也没有matlab交互界面,运行完程序后退出matlab,其运行方法为:

    进入需要运行的 .m 文件目录,在终端输入

    $ matlab -batch matlabfile

    其中,matlabfile为 .m 文件名,不带类型后缀 .m

    -r 的方式默认打开matlab,并运行程序,会出现matlab交互界面,运行完成后不退出matlab。若不想打开图形界面,则要配合其他参数使用,其运行方法为:

    $ matlab -nodesktop -nosplash -r matlabfile

    matlab运行时,可带参数[-logfile log],将终端输出结果拷贝到log文件中。

    若有函数参数传入,则为

    $ matlab -nodesktop -nosplash -r matlabfile(parameters)

    如下图所示(MAIN_SCRIPT为要运行的脚本)

    更加高级的用法是,用vim打开用户目录下的 .bashrc文件,并在其中添加:

    alias mrun="matlab -nodesktop -nosplash -logfile `date +%Y_%m_%d-%H_%M_%S`.log -r"

    其中,logfile `date +%Y_%m_%d-%H_%M_%S`.log 将log文件输出在以程序执行时间为文件名的log文件下。r参数表示运行matlab命令。之后执行m文件只需运行:

    $ mrun matlabfile

    若有实现函数参数传入调用,则为:

    $ mrun matlabfile(parameters)
     

    • 1.2. 添加matlab搜索路径

    采用命令行方式运行matlab,就失去手动添加搜索路径的机会了。因此,如果运行的程序需要调用其他文件夹的数据和函数时,就会出现问题。文献2给出了解决的办法,即可在需要运行的matlab程序(例如matlabfile)开头添加如下语句,以自动添加路径:

    addpath(genpath(pwd));

    其中,addpath的作用是将参数路径添加到搜索区,genpath是为了获取参数路径及其所有子文件夹,pwd是返回当前路径,也就是matlabfile所在的路径。这里采用的是添加相对路径的方法,更具可移植性,亦可添加绝对路径,不再赘述。

    注意,此时是把matlabfile的父文件夹下及其子文件夹均添加到搜索路径中了。

    另外,命令行方式运行matlab时,matlab程序仍会占用终端,且关闭终端后,程序会中止。

     

    • 1.3. 命令行下打开matlab文件进行编辑

    在matlab的运行环境下,打开文件编辑的操作为:

    >>open('matlabfile.m');

    其中,matlabfile.m为文件名。如此,即可像桌面模式一样,编辑文件了。

    此外,无论终端当前运行环境如何,都可以直接利用MobaXterm软件自带的编辑器功能,打开文件编辑,只需右键选中即可,如图所示。

     

    • 2. Linux后台运行方法

    matlab以命令行方式运行,仍会占用终端,并不解决问题,因此需要采用Linux后台运行方法。主要有5种方法,分别是nohup、setsid、disown、screen、"()"等,主要参见文献3、4和5。在此之前,需要明确的是,在Linux中“&”符号跟在命令后面时表示将该命令置为后台运行,不占据终端(见文献6)。例如:

    $ matlab -batch MAIN_SCRIPT &

    表明将matlab这一进程以命令行形式打开,并置于后台运行。此命令执行完毕后,matlab不占据终端,但终端会显示matlab的运行输出,且会受到SSH会话的影响。

    此时终端输入jobs可查询正在后台运行的程序,如

    笔者测试另一命令行方法 -r 并不能后台运行,原因可能跟交互式界面有关,这一点跟几个参考文献的内容相左。

    命令行运行matlab,输出端口成为了当前终端,所有打印结果均输出到当前终端。如果想要把结果打印到文件而非终端,则需要在1.1节的基础上,添加语句,即:

    $ matlab -batch matlabfile 1>running1.log 2>running1.err

    将标准输出流写入running1.log文件中,标准错误流写入running1.err文件中,这两个文件储存在当前目录下。具体可见文献3. 

    亦可将所有输出均放到同一个文件内,即:

    $ matlab -batch matlabfile >running1.log

    数字0,1,2的含义:
    0——stdin(standard input,标准输入),1——stdout(standard output,标准输出),2——stderr(standard error,标准错误

     

    这里尤其需要明确的是,只有在root权限下才可实现进程后台运行。以下参考文献4和5,总结这几种方法。

    • 2.1. nohup

    功能:将还未执行的程序置于后台运行。

    语句:

    # nohup command &

    如:

    nohup matlab -batch MAIN_SCRIPT >running.log &

    用nohup运行matlab的MAIN_SCRIPT.m文件之后,查询后台进程,如下

    父进程号PPID为1,说明此进程不受终端的影响,可以后台运行。以下几种方法与此类似。

    • 2.2. setsid

    功能:在新的会话中运行程序。

    语句:

    # setsid command

     

    • 2.3. disown

    功能:使某个已在前端运行的job忽略HUP信号,从而不会被终端关闭所影响。

    语句:

    # disown -h %NUM

    这里NUM是jobs的编号。

     

    • 2.4. screen

    功能:首先用screen语句建立新的虚拟会话,然后可在该会话下进行操作,以Ctrl + a + d 来安全退出。用screen -r 返回处于断开模式下的会话(并指定会话名)。

    语句:

    # screen -r SESSIONNAME

    这里SESSIONNAME是会话名称。

     

    • 2.5. ()

    功能:将一个或多个命令包含在括号内,就能让这些命令在子shell中运行。

    语句:

    # (command &)

     

    最后,介绍如何关闭正在运行的后台进程。

    命令1:

    $ kill -9 PID

    这里,PID是进程号

    命令2:

    $ Ctrl + z

    这里进程仅仅被暂停,而并未结束。

     

     

     

    参考文献:

    1. https://blog.csdn.net/sinat_33425327/article/details/79125745

    2. https://blog.csdn.net/enjoyyl/article/details/44830519

    3. https://blog.csdn.net/weixin_40098515/article/details/88535262

    4. https://www.tecmint.com/keep-remote-ssh-sessions-running-after-disconnection/

    5. https://blog.csdn.net/v1v1wang/article/details/6855552

    6. https://blog.csdn.net/liuyanfeier/article/details/62422742

     

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  • linux命令行运行matlab

    2021-04-23 09:46:20
    MATLAB中有专门的函数来计算这个数值,butter函数的...linux命令行运行matlabmatlab可以不启动图形界面运行,比如matlab -nodesktop -nosplash或者matlab -nodisplay或者matlab -nojvm -nosplashmatlab程序也可以...

    MATLAB中有专门的函数来计算这个数值,butter函数的阶次估计函数为buttord。接下来是小编为大家收集的linux命令行运行matlab,希望能帮到大家。

    linux命令行运行matlab

    matlab可以不启动图形界面运行,比如

    matlab -nodesktop -nosplash

    或者

    matlab -nodisplay

    或者

    matlab -nojvm -nosplash

    matlab程序也可以在命令行里直接运行,只需要使用 -r 选项。比如运行当前目录下的example.m

    matlab -nodesktop -nosplash -r example

    或者

    matlab -nojvm -nosplash -r example

    或者

    matlab -nodisplay -r example

    可以将如下命令加到~/.bashrc文件

    alias mrun='matlab -nodesktop -nosplash -r'

    这样下次(或者执行source ~/.bashrc)之后就可以直接

    mrun example

    来在命令行运行matlab文件。

    如果使用 -nodisplay -r 选项运行,当程序中有figure()命令时会出错,可以使用如下选项抑制图形的显示: ('visible','off');

    并使用如下命令将图形输出到文件: ('-deps','example.eps');

    或者

    hgsave('example.fig');

    有关matlab startup option 和 command line 运行

    在 UNIX 下

    -nodesktop 启动jvm(Jave Virtual Machine),不启动desktop,但help 界面,preferences界面等仍可通过cmdline 调出,即jvm启动但不启动desktop,可以启动其他显示;但是matlab不会在cmd history记录本次执行的命令

    -nodisplay 启动jvm,不启动desktop,不启动任何显示相关,忽略任何DISPLAY 环境变量;即jvm启动但不能显示

    -nojvm 不启动jvm,则与之相关的一切活动将无法进行,包括图形界面显示,help 界面,preferences界面等 即jvm不启动故不能显示

    -nosplash 只是不显示启动时的log画面,jvm,desktop等正常启动

    对UNIX 而言,推荐通过Desktop > Desktop Layout > Command Window > Only 设置只显示 command-line interface 而 不要用-nodesktop (why?)

    在Windows下

    对windows而言,-nodisplay 似乎无效,还是会显示desktop; -nojvm, -nodesktop 不显示desktop,但是会出现简洁的command-line 窗口,也就是说并不会完全没有图形界面,

    无法像linux一样,只在cmdline操作

    用Desktop > Desktop Layout > Command Window > Only 设置只显示 command-line interface 后,其他窗口并不会消失

    另外 :

    -r 运行matlab cmd命令,多条命令相互用分号或逗号隔开(空格不行),用双引号引起;一条命令可以不用双引号。 这多用在批处理模式下,所运行的文件必须在matlab的启动目录下或者在其搜索路径上,且不能带有路径名和后缀名,

    -logfile 保存cmdline输出到文件

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  • 在Linux下安装完matlab后,会/usr/local/bin/下生成matlab文件,可以使用matlab命令。 Usage: matlab [-h|-help] | [-n | -e] [-arch | v=variant | v=arch/variant] ...
  • 本文为转载,由 pretend_b 提供 ... 以下为正文: 后台运行matlab脚本文件的方法:nohup ...2.字符环境下运行matlab脚本文件, 脚本文件无图像的屏幕输出。 3.脚本文件需长时间运行,运行结果输出到文件。matl...
  • 代码中输出结果图下方 采用命令 print(‘dpng’,‘exp.png’) print(‘dpdf’,‘exp.pdf’) 结果图将展示.m文件所在的目录’
  • -lfun -o MainApp 这里要注意,有的人用gcc会出现undefined cout的错误,因为我们用的是C 语言,所以还是要用g 编译-L是指定动态链接库的目录 -l是制定库名字 接下来我们运行 [cpp] view plaincopy 。 /MainApp 会...
  • 不久前,学姐发给我一程序,我开虚拟机跑matlab算了一边,虽然我给了虚拟的XP512M的内存,还是慢的要命。足足等了30s才出来结果。这还是只算了一遍,如果是算两层循环,96*2遍的话,我去新街口溜达一圈再回来也算...

空空如也

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