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  • 大绒鼠是横断山区的固有种。利用大绒鼠40个个体设计出12对微卫星引物,...筛选出的12对引物中Emj 2~43和Emj 2~54属于高度多态性座位,其余10对均为中度多态性座位,这些微卫星引物的筛选可用于今后更进一步的种群研究。
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  • tcga癌症亚型获取 Java 5已将通用多态性... 通用多态性(也称为参数多态性 )通常与可能预先存在的亚型多态性正交。 一个简单的例子是collections API List<? extends Number> c = new ArrayList<Integer...

    tcga癌症亚型获取

    Java 5已将通用多态性引入Java生态系统。 即使我们都知道由于泛型类型擦除及其后果而引起的无数警告,这还是对Java语言的重要补充。 通用多态性(也称为参数多态性 )通常与可能预先存在的亚型多态性正交。 一个简单的例子是collections API

    List<? extends Number> c = new ArrayList<Integer>();

    在上面的示例中,子类型ArrayList被分配给超类型List的变量。 同时,使用Integer类型对ArrayList进行参数化,可以将其分配给兼容的参数超类型? extends Number ? extends Number 在通用多态性的情况下,这种子类型多态性的用法也称为协方差 ,尽管当然也可以在非通用上下文中实现协方差。

    具有通用多态性的协方差

    协方差对于泛型很重要。 它允许创建复杂的类型系统。 简单的示例涉及将协方差与通用方法结合使用:

    <E extends Serializable> void serialize(
        Collection<E> collection) {}

    上面的示例接受任何Collection类型,可以在调用站点使用诸如ListArrayListSet等类型对它进行子类型化。 同时,仅要求调用站点上的泛型类型参数是Serializable的子类型。 即它可以是List<Integer>ArrayList<String>等。

    将亚型多态性与通用多态性相关联

    于是人们常常被引诱去关联两种正交类型的多态性。 这种相关性的一个简单示例是将IntegerListStringSet专门IntegerList

    class IntegerList extends ArrayList<Integer> {}
    class StringSet extends HashSet<String> {}

    这是很容易看到明确的类型的数量会爆炸,如果你开始跨越亚型和泛型类型层次的笛卡尔积,希望通过创建之类的东西更精确地专门IntegerArrayListIntegerAbstractListIntegerLinkedList等。

    使相关性通用

    从上面可以看出,这种关联通常会从类型层次结构中删除通用性,尽管并不需要这样做。 在以下更一般的示例中可以看出:

    // AnyContainer can contain AnyObject
    class AnyContainer<E extends AnyObject> {}
    class AnyObject {}
    
    // PhysicalContainer contains only PhysicalObjects
    class PhysicalContainer<E extends PhysicalObject>
      extends AnyContainer<E> {}
    class PhysicalObject extends AnyObject {}
    
    // FruitContainer contains only Fruit,
    // which in turn are PhysicalObjects
    class FruitContainer<E extends Fruit>
      extends PhysicalContainer<E> {}
    class Fruit extends PhysicalObject {}

    上面的示例是一个典型的示例,其中API设计者被诱使子类型多态性( Fruit extends PhysicalObject extends AnyObject )与泛型多态性( <E> )相关联,同时保持泛型,从而允许在FruitContainer添加其他子类型。 AnyObjectAnyObject应该知道其自己的子类型时,这会变得更加有趣。 这可以通过递归泛型参数来实现。 让我们修复前面的示例

    // AnyContainer can contain AnyObject
    class AnyContainer<E extends AnyObject<E>> {}
    class AnyObject<O extends AnyObject<O>> {}
    
    // PhysicalContainer contains only PhysicalObjects
    class PhysicalContainer<E extends PhysicalObject<E>>
      extends AnyContainer<E> {}
    class PhysicalObject<O extends PhysicalObject<O>>
      extends AnyObject<O> {}
    
    // FruitContainer contains only Fruit,
    // which in turn are PhysicalObjects
    class FruitContainer<E extends Fruit<E>>
      extends PhysicalContainer<E> {}
    class Fruit<O extends Fruit<O>>
      extends PhysicalObject<O> {}

    这里有趣的部分不再是容器,而是AnyObject类型层次结构,该结构将子类型多态与自身类型上的通用多态相关联! 这也可以通过java.lang.Enum完成:

    public class Enum<E extends Enum<E>>
    implements Comparable<E> {
      public final int compareTo(E other) { ... }
      public final Class<E> getDeclaringClass() { ... }
    }
    
    enum MyEnum {}
    
    // Which is syntactic sugar for:
    final class MyEnum extends Enum<MyEnum> {}

    危险所在?

    枚举和我们的自定义之间的细微差别AnyObject层次是事实MyEnum通过被终止的两个正交分型技术递归自相关final 另一方面,除非将AnyObject子类型也AnyObject为最终类型,否则不应将其删除。 一个例子:

    // "Dangerous"
    class Apple extends Fruit<Apple> {}
    
    // "Safe"
    final class Apple extends Fruit<Apple> {}

    为什么final如此重要,或者换句话说,为什么在终止递归自相关(例如Apple之前)时必须小心AnyObject子类型? 这很简单。 让我们假设以下内容:

    class AnyObject<O extends AnyObject<O>>
      implements Comparable<O> {
    
      @Override
      public int compareTo(O other) { ... }
      public AnyContainer<O> container() { ... }
    }

    上述关于AnyObject.compareTo()约定意味着, AnyObject任何子类型都只能与同一子类型进行比较。 以下是不可能的:

    Fruit<?> fruit = // ...
    Vegetable<?> vegetable = // ...
    
    // Compilation error!
    fruit.compareTo(vegetable);

    层次结构中当前唯一可比较的类型是Apple:

    Apple a1 = new Apple();
    Apple a2 = new Apple();
    
    a1.compareTo(a2);

    但是,如果我们想添加GoldenDeliciousGala苹果怎么办?

    class GoldenDelicious extends Apple {}
    class Gala extends Apple {}

    我们现在可以比较它们!

    GoldenDelicious g1 = new GoldenDelicious();
    Gala g2 = new Gala();
    
    g1.compareTo(g2);

    这不是AnyObject作者的AnyObject

    这同样适用于container()方法。 允许子类型协变地专门化AnyContainer类型,这很好:

    class Fruit<O extends Fruit<O>>
      extends PhysicalObject<O> {
    
      @Override
      public FruitContainer<O> container() { ... }
    }

    但是, GoldenDeliciousGalacontainer()方法会GoldenDelicious

    GoldenDelicious g = new GoldenDelicious();
    FruitContainer<Apple> c = g.container();

    是的,它将返回一个Apple容器,而不是AnyObject设计人员想要的GoldenDelicious容器。

    子类型多态和泛型多态跨越正交类型轴。 使它们相互关联可能是类型系统中的设计气味。 使它们在同一类型上关联是危险的,因为很难正确处理。 用户将尝试终止基本类型的子类型上的递归泛型类型定义。 终止的原因是具有递归自绑定的基本类型很难使用的事实。 但是终止通常会出错,因为它只能在final类上执行,而不能在常规类或接口上执行。

    换句话说,如果您认为需要基于通用基本类型的递归泛型类型定义,请仔细考虑,如果确实需要,并且您的类型用户可以在final类中正确终止递归泛型类型定义。

    参考:来自JACG ,SQL和JOOQ博客的JCG合作伙伴 Lukas Eder提出的将子类型多态与通用多态相关联的危险

    翻译自: https://www.javacodegeeks.com/2013/07/the-dangers-of-correlating-subtype-polymorphism-with-generic-polymorphism.html

    tcga癌症亚型获取

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  • Java面向对象:多态性

    2019-09-16 20:37:20
    对象的多态性向上转型:程序会自动完成——子类向父类转换,相当于从子类中调取父类成员,筛选父类 父类对象 = 子类实例;向下转型:强制类型转换子类 子类对象 = (子类)父类实例 classA{ publicvoidtell1(){...

    多态性

    1. 方法的重载与重写

    2. 对象的多态性

      向上转型:程序会自动完成——子类向父类转换,相当于从子类中调取父类成员,筛选

      父类 父类对象 = 子类实例;

      向下转型:强制类型转换

      子类 子类对象 = (子类)父类实例

    class A{
    	public void tell1() {
    		System.err.println("A--tell1");
    	}
    	public void tell2(){
    		System.out.println("A--tell2");
    	}
    }
    
    class B extends A{
    	
    	//对tell1重写
    	public void tell1() {
    		System.out.println("B--tell1");
    	}
    	public void tell3(){
    		System.out.println("B--tell3");
    		}
    	}
    
    
    public class test3 {
    
    	public static void main(String[] args) {
    		// TODO Auto-generated method stub
    	//向上转型——子类向父类转换,相当于从子类中调取父类成员,筛选
    	A a = new B();
    	a.tell1();//B(子类)中的tell1重写了A(父类)中的tell1,所以打印"B--tell1"
    	a.tell2();
    	
    	//向下转型——强制类型转换,先发生向上转型,才能发生向下转型;
    	//通过父类筛选,之后将结果输出到另一个子类。~~像一个筛子。
    	A a1 = new B();//
    	B d = (B)a1;
    	d.tell1();//打印“B--tell1”
    	d.tell2();//
    	d.tell3();
    }
    }

    对象多态性的使用

    class A1{
    	public void tell1() {
    		System.out.println("A--tell1");
    	}
    }
    //继承自A1
    class B1 extends A1{
    	public void tell2() {
    		System.out.println("B--tell2");
    	}
    }
    //继承自A1
    class C1 extends A1{
    	public void tell3() {
    		System.out.println("C--tell3");
    	}
    }
    
    public class test3 {
    
    	public static void main(String[] args) {
    		// TODO Auto-generated method stub
    	        
    	        //由子类访问父类成员
    		say(new B1());//向上转型,程序自动完成
    		say(new C1());//向上转型,程序自动完成
    			
    }
    	public static void say(A1 a) {
    		a.tell1();
    	}
    	
    }

    instanceof关键字


    instanceof关键字判断一个对象到底是不是一个类的实例。返回boolean类型

    class A1{
    	public void tell1() {
    		System.out.println("A--tell1");
    	}
    }
    //继承自A1
    class B1 extends A1{
    	public void tell2() {
    		System.out.println("B--tell2");
    	}
    }
    //继承自A1
    class C1 extends A1{
    	public void tell3() {
    		System.out.println("C--tell3");
    	}
    }
    
    public class test3 {
    
    	public static void main(String[] args) {
    		// instanceof关键字判断一个对象到底是不是一个类的实例
    	A1 a = new A1();
    	System.out.println(a instanceof A1);//ture
    	B1 b = new B1();
    	System.out.println(b instanceof B1);//ture
    	System.out.println(b instanceof A1);//ture
    	a = b;//向上转型
    	System.out.println(a instanceof A1);//ture
    	System.out.println(a instanceof B1);//ture
    	}
    	
    }

    抽象类的应用


    接口的应用

    转载于:https://my.oschina.net/u/2413758/blog/484928

    展开全文
  • 为了构建高密度遗传图谱并精细定位该主效位点 ,用 2DS参考遗传图谱上的14对 SSR标记 ,研究了59个育性正常的普通小麦品种与XND126的DNA多态性 ,筛选到不同生态型多态性较高的品种共12个 ,每个品种多态性标记达 12~13...
  • 用从 100 个 10mers 随机引物中筛选出的 13 个具有特异多态性引物对黑子南瓜种质资源遗传多态性进行了 RAPD(Random amplified polymorphic DNA)分析。结果表明,RAPD 对中国南瓜种、印度南瓜种、美洲南瓜种及黑子...
  • SNP/单核苷酸多态性分析

    千次阅读 2018-10-19 11:02:00
    SNP/单核苷酸多态性分析 SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因。SNP在人类基因组中...

    SNP/单核苷酸多态性分析

    SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因。SNP在人类基因组中的发生频率比较高,大约平均每1000个碱基中就有一个多态位点。有些SNP位点还会影响基因的功能,导致生物性状改变甚至致病。单核苷酸多态性是研究人类家族和动植物品系遗传变异的重要依据,因此被广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面)和疾病相关基因的研究,在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。

     

    服务项目

     
     
     
    1.TaqMan探针法
    针对染色体上的不同SNP位点分别设计PCR引物和TaqMan探针,进行实时荧光PCR扩增。探针的5’-端和3’-端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。当溶液中存在PCR产物时,该探针与模板退火,即产生了适合于核酸外切酶活性的底物,从而将探针5’-端连接的荧光分子从探针上切割下来,破坏两荧光分子间的PRET,发出荧光。通常用于少量SNP位点分析(见图1)。

     

    图1 某SNP位点分析结果  A.纯合(G/G)  B.杂合(G/T)

     


    2.SNaPshot法

    该技术由美国应用生物公司(ABI)开发,是基于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰的颜色可得知掺入的碱基种类,从而确定该样本的基因型。对于PCR产物模板可通过多重PCR反应体系来获得。通常用于10-30个SNP位点分析(见图2)。

     

    图2 基因编码区9 个SNP 位点的SNaPshot 实验结果图谱

     

    3.HRM法
    高分辨率熔解曲线分析(HRM)是近几年兴起的SNP研究工具,它通过实时监测升温过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况,来判断是否存在SNP,而且不同SNP位点、是否是杂合子等都会影响熔解曲线的峰形,因此HRM分析能够有效区分不同SNP位点与不同基因型。这种检测方法不受突变碱基位点与类型的局限,无需序列特异性探针,在PCR结束后直接运行高分辨率熔解,即可完成对样品基因型的分析。该方法无需设计探针,操作简便、快速,成本低,结果准确,并且实现了真正的闭管操作(图3)。

    图3 某基因的SNP(G>A)进行HRM分析的结果。A图为熔解曲线,B图为差异图


    4.Mass Array法
    MassARRAY分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具,通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF-MS技术相结合,实现基因分型检测。基于MassARRAY平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高达40重的PCR反应和基因型检测,实验设计灵活,分型结果准确性高。根据应用需要,对数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时,MassARRAY具有最佳的性价比,特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证,或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。

    5.Illumina BeadXpress法
    采用Illumina公司的BeadXpress系统进行批量SNP位点检测,可以同时检测1-384个SNP位点,往往用于基因组芯片结果确认,适合高通量检测。微珠芯片具有高密度、高重复性、高灵敏度、低上样量、定制灵活等特点,极高的集成密度,从而获得极高的检测筛选速度,在高通量筛选时可显著降低成本。

    6.KASP基因分型技术
    KASP是竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR)的缩写,可在广泛的基因组DNA样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA样品),对SNPs和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。这项技术是基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以及检测InDels (Insertions and Deletions,插入和缺失)。

    送样要求

     
     
     
    细胞(≥106 )、组织(≥300mg)、血液(≥1ml)、基因组DNA(≥20μl,浓度≥50ng/μl)。

    提供结果

     
     
     
    检测SNP的原始数据、数据分析结果及书面报告。

    检测项目

     
     
     

    根据实验目的和通量的不同,阅微基因通过以下五种方式来提供SNP检测服务:

    技术优势

     
     
     
    经验丰富:国内最早应用SNaPshot方法的公司,10年经验,技术成熟,做过1000个以上案例

     

    服务全面:可以提供多种检测方法,可根据客户的样本量及位点数协助客户选择合适的实验方案

     

    结果准确:单个项目的检测结果都能保证不低于95%的检出率,如有特殊需求,可达到100%检出率

     

    技术先进:

    优化扩增体系,确保一次反应可以扩增出尽可能多的位点

    针对特殊结构位点,采用高效的DNA聚合酶,确保每个位点都有实验结果,确保客户数据的完整性

    可以针对口腔拭子、唾液等样本提取DNA

    可以提供基因分型等数据分析服务,包括HW平衡分析、聚类分析、品种鉴定、遗传图谱、关联分析、单体型分析等

    成功案例

     
     
     

    某医院客户有1000 以上样本,且只分析两个SNP位点,选用了Taqman-SNP 方法进行分型检测,散点图结果。

    Taqman-SNP 分型结果示例

    转载于:https://www.cnblogs.com/wangprince2017/p/9815213.html

    展开全文
  • 鸡IRF3基因外显子1的多态性与免疫指标的相关分析,王彦,兰茜,【目的】研究IRF3基因多态性与鸡免疫指标的相关性,为进一步提供筛选禽白血病分子标记提供参考依据。【方法】利用直接测序技术对17
  • 该工具使用在目标区域内测序的单核苷酸多态性(SNP)的等位基因比率(AR)。 当样品被具有不同基因型的DNA污染时,会获得意外的AR。 依次将其用于通过筛选测试检测污染物,然后进行污染物的鉴定和定量。 从基因组到...
  • 为寻找高产菌株的分子标记,尝试利用RAPD(random amplified polyanorphic DNA)技术,对青霉素生产菌株进行基因组多态性分析,分别以9株不同产量的产黄青霉菌基因组DNA为模版,筛选引物23条,并且对一条高产菌株特异...
  • 为保护野生翘嘴鳜(Sinipercachuatsi)的种质资源以及遗传育种,本研究从翘嘴鳜的EST文库中开发微卫星并筛选出22对具有多态性的微卫星标记,对来自陆水水库(赤壁)和沅江流域(常德、怀化)的3个野生群体进行了遗传多样性...
  • 采用OPA、OPC和OPM三组共60条随机引物对鲤亚目的七种名优鱼和一种杂交品种进行了随机扩增多态性DNA( RAPD)分析,对其中35个引物的扩增条带进行了统计,计算了它们之间的遗传相似率和遗传距离.在此基础上,利用UPGMA聚类...
  • CYP3A基因多态性对肾移植后高血压患者他克莫司血药浓度剂量比的影响,席兰艳,袁洪,目的 探讨CYP3A4*1G、CYP3A5*3基因多态性对肾移植后高血压患者他克莫司血药浓度/剂量比(C/D)的影响。方法 随机筛选肾移植后高...
  • 基于三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片的荧光检测法,研制了一种用于筛选能检测2型糖尿病的特定寡核苷酸探针。使用第4代(G4)聚(酰胺-胺)(PAMAM)树枝状大分子修饰的载玻片为...通过单核苷酸多态性和等位基因分析证明,该寡核苷
  • 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组...

    单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在人类基因组中广泛存在,平均每500~1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。

        SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。

        理论上讲,SNP既可能是二等位多态性,也可能是3个或4个等位多态性,但实际上,后两者非常少见,几乎可以忽略。因此,通常所说的SNP都是二等位多态性的。这种变异可能是转换(C T,在其互补链上则为G A),也可能是颠换(C A,G T,C G,A T)。转换的发生率总是明显高于其它几种变异,具有转换型变异的SNP约占2/3,其它几种变异的发生几率相似。Wang等的研究也证明了这一点。转换的几率之所以高,可能是因为CpG二核苷酸上的胞嘧啶残基是人类基因组中最易发生突变的位点,其中大多数是甲基化的,可自发地脱去氨基而形成胸腺嘧啶。

        在基因组DNA中,任何碱基均有可能发生变异,因此SNP既有可能在基因序列内,也有可能在基因以外的非编码序列上。总的来说,位于编码区内的SNP(coding SNP,cSNP)比较少,因为在外显子内,其变异率仅及周围序列的1/5。但它在遗传性疾病研究中却具有重要意义,因此cSNP的研究更受关注。

        从对生物的遗传性状的影响上来看,cSNP又可分为2种:一种是同义cSNP(synonymous cSNP),即SNP所致的编码序列的改变并不影响其所翻译的蛋白质的氨基酸序列,突变碱基与未突变碱基的含义相同;另一种是非同义cSNP(non-synonymous cSNP),指碱基序列的改变可使以其为蓝本翻译的蛋白质序列发生改变,从而影响了蛋白质的功能。这种改变常是导致生物性状改变的直接原因。cSNP中约有一半为非同义cSNP。

        先形成的SNP在人群中常有更高的频率,后形成的SNP所占的比率较低。各地各民族人群中特定SNP并非一定都存在,其所占比率也不尽相同,但大约有85%应是共通的。

        SNP自身的特性决定了它更适合于对复杂性状与疾病的遗传解剖以及基于群体的基因识别等方面的研究:
    1、   SNP数量多,分布广泛。据估计,人类基因组中每1000个核苷酸就有一个SNP,人类30亿碱基中共有300万以上的SNPs。SNP 遍布于整个人类基因组中,根据SNP在基因中的位置,可分为基因编码区SNPs(Coding-region SNPs,cSNPs)、基因周边SNPs(Perigenic SNPs,pSNPs)以及基因间SNPs(Intergenic SNPs,iSNPs)等三类。
    2、  SNP适于快速、规模化筛查。组成DNA的碱基虽然有4种,但SNP一般只有两种碱基组成,所以它是一种二态的标记,即二等位基因(biallelic)。 由于SNP的二态性,非此即彼,在基因组筛选中SNPs往往只需+/-的分析,而不用分析片段的长度,这就利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。
    3、  SNP等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是:首先选择参考样本制作标准曲线,然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较,根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。
    4、  易于基因分型。SNPs 的二态性,也有利于对其进行基因分型。对SNP进行基因分型包括三方面的内容:(1)鉴别基因型所采用的化学反应,常用的技术手段包括:DNA分子杂交、引物延伸、等位基因特异的寡核苷酸连接反应、侧翼探针切割反应以及基于这些方法的变通技术;(2)完成这些化学反应所采用的模式,包括液相反应、固相支持物上进行的反应以及二者皆有的反应。(3)化学反应结束后,需要应用生物技术系统检测反应结果。
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  • 针对这些位点,以东北农业大学高、低脂系肉鸡第14世代群体和AA随机群体为试验材料,进行多态性与鸡生长和体组成性状的相关分析。结果表明,除了rs14087994位点,其余位点的多态性与第两个群体的VLDL存在显著或极显著...
  • 筛选长期居住北京地区无血缘关系的健康20~80岁汉族男性230人,应用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析法检测研究对象维生素D受体基因的Thj9I基因型,使用双能X线吸收测定法检测随机抽取的106例受试...
  • 猪α(1, 2)岩藻糖转移酶(FUT1)基因启动子区克隆及多态性分析,郑先瑞,王靖,本研究旨在克隆和分析猪α-(1,2)岩藻糖转移酶基因1(FUT1)的上游序列,为稳定遗传的功能多态位点的筛选和确定,以及开展FUT1基因的...
  • 以抗病材料Ryau96172I和感病材料Rutagus以及所需鉴定的番茄品种为试验材料,根据Mi-1.2和Mi- 1.1设计引物,利用改良SDS法提取番茄基因组DNA ,用锚定引物扩增多态性DNA分子标记法标记不同番茄品种。同时利用爪哇根结...
  • 默认情况下,删除最右边的属性对于所有用例而言都不会足够普遍 类型系统 如果Tuple3扩展了Tuple2 ,则对类型系统的影响将比上述情况差得。 例如,签出jOOQ API。 在jOOQ中,您可以放心地假设以下内容 : // ...
  • 采用RAPD技术,从42条引物中筛选出S5,S45,S48,S142等4条引物,对采自甘肃碧口、四川绵阳、四川竹峪、广西猫儿山、广西百色、广西北海、广西弄岗国家级自然保护区等7个种群共38个日本纺织娘(Mecopoda.nipoensisHaan.)...
  • 1.简介SSRMMD (Simple Sequence Repeat Molecular Marker Developer) 是用Perl语言编写的软件,可以从组装序列(FASTA格式,例如:基因组或转录组)中检测完美的SSR位点和候选的多态性SSR。该软件还包含了一个名为...
  • 为进一步研究野生软枣猕猴桃种质资源的遗传多样性,以软枣猕猴桃基因组DNA为模板,优化了SSR反应体系并确定了反应条件,筛选出了多态性较高的标记,从来自中华猕猴桃基因组的65对SSR引物初步筛选出15对有较好扩增带...
  • 为了揭示不同培养基分离的细菌种群的多样性差异及获得高效脱酚菌,采用单链构象多态性技术,以16SrRNA基因的V3区为靶对象,对3种不同培养基SJ(自制培养基)、LB(牛肉膏蛋白胨培养基)、YEB(酵母牛肉膏培养基)...
  •  我们在添加头部Tab的时候顺便要给他设置点击事件,根据转来控制什么时候菜单该打开,什么时候菜单该关闭,什么时候该要改变菜单布局。 // 当前tab点击的位置 protected int mCurrentPosition = - 1 ; /...
  • 以黄瓜雌性系D0420×强雄性系D06103的211株F2单株为作图群体,应用SSR分子标记进行多态性筛选,得到与黄瓜雌性性状相关的标记位点21个,分属4个连锁群,连锁群全长为98.5 cM,标记间平均距离4.9 cM,最短的连锁群0.5 cM( ...
  • 采用混合分离分析策略(bulked segregation analysis, BSA), 利用覆盖玉米全基因组的1 013个SSR标记对2个基因池进行多态性筛选, 共获得了16个与玉米分蘖相关联的位点. 这16个位点分布在玉米7条染色体上, 其中包括2,4...
  • 利用切枝水培和组织培养技术,对白杨派的毛新杨和青杨派的不同种源小叶杨进行了派间杂交和杂交子代的幼胚培养研究。...共采用120对杨树特异的SSR引物对杂交亲本毛新杨和小叶杨进行了多态性筛选,得到了

空空如也

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多态性筛选