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  • 如何在linux下安装r语言
    2021-05-13 12:50:59

    R for Linux 安装指南

    1、下载

    wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.1.tar.gz

    2、解压:

    tar -zxvf R-3.2.1.tar.gz

    cd R-3.2.1

    3、安装必备软件

    sudo yum install readline-devel

    sudo yum install libXt-devel

    sudo yum install gcc-gfortran

    sudo yum install gcc gcc-c++

    sudo yum groupinstall "Development Tools"

    sudo yum install gcc gcc-c++ gcc-gfortran readline-devel make texinfo

    sudo yum install libX11-devel libX11-devel.* libICE-devel.* libSM-devel.* libdmx-devel.*

    sudo yum install libx* xorg-x11* libFS* libX* tetex mesa-libGLU-devel libjpeg-devel

    sudo yum install libpng-devel cairo-devel pango-devel -y

    4、相关配置

    ./configure --prefix=/usr/R-3.2.1 --enable-R-shlib --with-readline=yes --with-cairo=yes --with-libpng=yes --with-x=no --disable-nls

    5、安装

    make&& make install

    6、配置环境变量

    vi /root/.bash_profile

    PATH=$PATH:/usr/R-3.2.1/bin

    source /root/.bash_profile

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  • 安装环境:centos、R3.0.11、终端下载:#cd /usr/local/#wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz (终端输入)2、解压文件:#tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz#cd R-3.0.13、安装文件#yum ...

    安装环境:

    centos、R3.0.1

    1、在终端下下载:

    #cd /usr/local/

    #wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz  (终端下输入)

    2、解压文件:

    #tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz

    #cd R-3.0.1

    3、安装文件

    #yum install gcc-gfortran

    #yum install glibc-headers

    #yum install gcc-c++

    #yum install readline-devel

    #yum install libXt-devel

    #./configure  --enable-R-shlib --prefix=/usr/local/R-3.0.1

    #make

    #make install

    4、配置环境变量

    cd  到etc/profile 。

    编辑文件 vim profile

    增加

    export R_HOME=/usr/local/R-3.0.1

    export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

    保存并退出。

    然后

    #source profile

    重新启动操作系统

    5、測试:创建脚本(t.R)

    能够在当前环境下输入

    #R

    l1dy6x90ze

    watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvc25jaGVuanQ=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/Center" alt="">

    OK,安装完毕了。或者

    在某一个目录下创建一个R文件xx.R

    输入内容

    #!/path/to/Rscript    #第一行

    x

    y

    model

    summary(model)

    6、測试:运行脚本

    在终端Rscript  xx.R #结果直接输出到终端

    7、安装R语言包

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    上面是一个样例,若是你不知道包的版本,我有一个办法:

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/包名          比方包名是xlsx

    然后目录下会下载一个网页就是包名网页,里面有包的版本。然后复制你要的版本又一次下载

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    然后在下载的包的文件夹下运行  R CMD INSTALL xlsx_0.5.5.tar.gz

    当然包之间会有依赖性,提示安装错误通常是依赖的包还没安装。能够先将依赖的包给安装好

    展开全文
  • 在linux下安装R语言程序,我找到以下几个版本:前言:我的系统是openSuse11.3,可以通过版本二,而其他版本则没有成功。目录其中文翻译网址:关键字:一键式安装主要步骤:找到我的版本11.3,点击install。结果:我...

    在linux下安装R语言程序,我找到以下几个版本:

    前言:我的系统是openSuse11.3,可以通过版本二,而其他版本则没有成功。

    目录

    其中文翻译网址:

    关键字:

    一键式安装

    主要步骤:

    找到我的版本11.3,点击install。

    结果:

    我下载到了两个文件R-patched-devel.ymp

    和R-patched.ymp在目录 download中。

    之后我不知道该如何操作?安装网页上的教程,点击install之后应该会自动执行Yast的,但是它没有。而在点击该文件时,倒是会调用Yast

    结论:

    未果

    关键字:

    使用命令行安装

    主要步骤:

    (1) 切换到超级用户

    (2) 命令行(添加软件源)

    zypper ar -f

    http://download.opensuse.org/repositories/devel\:languages\:R\:patched/openSUSE_11.3

    R-patched

    (3)

    Suse下安装(文件名)

    zypper install R-patched R-patched-devel

    will install R and all dependencies.

    结果:

    命令提示符:见附录哈。

    结论:

    成功。在终端输入R,会得到提示信息,表明安装成功了。

    参考网址:官方网址

    关键字:R-2.12.2.tar.gz

    主要步骤:

    (1) 解压缩

    (2) ./configure

    (3) Make

    结果:

    第(2)步出错:configure: error: No F77 compiler

    found,意思是找不到可用的fortran编译器。

    尝试解决fortran编译器问题:

    但是根据提示操作,suse linux识别不了命令patch。

    参考网址:记不得了。还提供了一种方案安装fortran编译器。打开系统的yast,在package search中查找fortran,结果我找到了gcc-fortran4.5.但是在提示下安装之后,没什么效果。./configure还是通不过。我不知道编译器安装到哪里了。

    参考网址,没有。我自己下载了一个fortran编译器,名字为:gcc-fortran-4.1.0-25.i586.rpm。然后使用命令rpm –ivh

    gcc-fortran-4.1.0-25.i586 结果还是出错了:error: Failed dependencies:

    gcc = 4.1.0-25 is needed by gcc-fortran-4.1.0-25.i586

    结论:

    未果,我不会在suse linux下安装fortran编译器。

    参考网址:

    关键字: rpm软件包

    主要步骤:

    既然是格式为rpm,那么按照rpm的一半步骤进行安装

    结果:

    找不到rpm格式的R安装包

    尝试解决:

    点击网页上提供的链接,错误类型404,网页无法访问。

    结论:

    未果

    附录:

    备注:1、(有下划线的地方是需要人工干预的地方,其他地方则是系统自动生成的):

    2、zengwei@linux-xed5:~/Project/program/R是我的当前目录

    正文:

    zengwei@linux-xed5:~/Project/program/R> su

    root (步骤一:切换到超级用户)

    Password:

    linux-xed5:/home/zengwei/Project/program/R # zypper ar

    -f (步骤二:添加软件源)

    http://download.opensuse.org/repositories/devel\:languages\:R\:patched/openSUSE_11.3

    R-patched

    Adding repository 'R-patched' [done]

    Repository 'R-patched' successfully added

    Enabled: Yes

    Autorefresh: Yes

    URI: http://download.opensuse.org/repositories/devel:languages:R:patched/openSUSE_11.3

    linux-xed5:/home/zengwei/Project/program/R # zypper install

    R-patched R-patched-devel (步骤三:安装软件)

    Retrieving repository 'R-patched' metadata [-]

    New repository or package signing key received:

    Key ID: A35CB059793371FE

    Key Name: devel:languages:R OBS Project

    Key Fingerprint:

    4BAAC60A1E50F188B7ACB3CDA35CB059793371FE

    Key Created: Wed 18 Nov 2009 07:40:30 PM CST

    Key Expires: Fri 27 Jan 2012 07:40:30 PM CST

    Repository: R-patched

    Do you want to reject the key, trust temporarily, or trust

    always? [r/t/a/?] (r): t

    Retrieving repository 'R-patched' metadata [done]

    Building repository 'R-patched' cache [done]

    Loading repository data...

    Reading installed packages...

    Resolving package dependencies...

    The following NEW packages are going to be installed:

    R-patched R-patched-devel tk

    3 new packages to install.

    Overall download size: 32.8 MiB. After the operation, additional

    61.1 MiB will be used.

    Continue? [y/n/?] (y): y

    Retrieving package tk-8.5.8-3.1.i586 (1/3), 1.4 MiB (3.9 MiB

    unpacked)

    Installing: tk-8.5.8-3.1 [done]

    Retrieving package R-patched-2.12.2-12.1.i586 (2/3), 31.2 MiB

    (56.7 MiB unpacked)

    Retrieving: R-patched-2.12.2-12.1.i586.rpm [done (56.5

    KiB/s)]

    Installing: R-patched-2.12.2-12.1 [done]

    Additional rpm output:

    warning:

    /var/cache/zypp/packages/R-patched/i586/R-patched-2.12.2-12.1.i586.rpm:

    Header V3 DSA/SHA1 Signature, key ID 793371fe: NOKEY

    Retrieving package R-patched-devel-2.12.2-12.1.i586 (3/3), 80.0

    KiB (388.0 KiB unpacked)

    Retrieving: R-patched-devel-2.12.2-12.1.i586.rpm [done (2.1

    KiB/s)]

    Installing: R-patched-devel-2.12.2-12.1 [done]

    Additional rpm output:

    warning:

    /var/cache/zypp/packages/R-patched/i586/R-patched-devel-2.12.2-12.1.i586.rpm:

    Header V3 DSA/SHA1 Signature, key ID 793371fe: NOKEY

    linux-xed5:/home/zengwei/Project/program/R

    # (完成)

    安装bioconductorR软件包

    终端输入R,进入R编辑环境

    输入:

    source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

    biocLite()

    展开全文
  • 在R下输入>install.packages("package_path",repos=NULL)​即可。此外可以参考一下内容Then Install BioConductor PackagesRight now, the easiestway to install BioConductor packages is using the biocLite....

    1.下载

    2.在R下输入

    >install.packages("package_path",repos=NULL)​

    即可。

    此外可以参考一下内容

    Then Install BioConductor PackagesRight now, the easiest

    way to install BioConductor packages is using the biocLite.R

    installation script. Here's how to use it: In an R

    command window, type the

    following:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXsource(">

    将包下载下来,在命令行下:>R CMD INSTALL -l 你要安装的目录

    *.gz(你的包的)

    我的方法是:把包下载到本地>install.packages("package_path",repos=NULL)

    Commands:INSTALL Install add-on packagesPlease use 'R CMD

    command --help' to obtain further information aboutthe usage of

    'command'.

    建议还是用这个稳妥些。source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")biocLite(c("pkg1",

    "pkg2")) #Where "pkg1" and "pkg2" are the names of

    the packages you would like to install.因为R

    package涉及到R本身版本高低,已安装的依赖包的版本的高低,辛苦down下来包包可能根本不匹配,也就用不了。biocLite脚本能够自动处理这些,保证安装的package可用。R

    CMD是很cool的命令。但犯linux的通病,复杂的依赖关系。而biocLite就非常像FC6

    linux下的yum,只要网路好,这种安装无疑是省体力的。

    以上内容来自http://www.cnblogs.com/xianghang123/archive/2011/12/06/2277644.html

    ​​

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