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  • 在linux下安装R语言以及包

    万次阅读 2014-12-26 16:01:41
    安装环境: centos8 +R3.0.1 在linux下安装R语言以及包

    安装环境:

    centos8 +R3.0.1

    1、在终端下下载:  

    wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz  (终端下输入)

    2、解压文件:

    tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz
    cd R-3.0.1

    3、安装文件

    yum install gcc-gfortran

    yum install glibc-headers
    yum install gcc-c++


    yum install readline-devel
    yum install libXt-devel

    ./configure  --enable-R-shlib --prefix=/usr/R-3.0.1
    make
    make install

    4、配置环境变量

    cd  到\home\用户名\文件夹下 ,ls -a查看所以文件以及隐藏文件,存在一个.bash_profile的文件

    编辑文件 gedit  .bash_profile

    加入

    PATH=$PATH:/home/work/R/bin
    注销下

    可以查看$PATH里面有没有新增的路径

    5、测试:创建脚本(t.R)

    在某一个文件夹下创建一个R文件xx.R

    输入内容

    #!/path/to/Rscript    #第一行
    x<-c(1,2,3)    #R语言代码
    y<-c(102,299,301)
    model<-lm(y~x)
    summary(model)

    6、测试:执行脚本

    在终端Rscript  xx.R #结果直接输出到终端

    7、安装R语言包

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    上面是一个例子,若是你不知道包的版本号,我有一个办法:

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/包名          比如包名是xlsx

    然后文件夹下会下载一个网页就是包名网页,里面有包的版本号,然后复制你要的版本号重新下载

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    然后在下载的包的目录下执行  R CMD INSTALL xlsx_0.5.5.tar.gz

    当然包之间会有依赖性,提示安装错误一般是依赖的包还没安装,可以先将依赖的包给安装好



    主要参考http://banu.blog.163.com/blog/static/231464820133335440975/

    http://blog.itpub.net/21711990/viewspace-1114418/

    http://www.cnblogs.com/niocai/archive/2011/11/04/2236458.html

    http://blog.sina.com.cn/s/blog_4bc742520102uy6j.html

    展开全文
  • 在Linux下安装R语言软件

    千次阅读 2015-06-23 17:18:56
    1、终端下载: #cd /usr/local/ #wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz  (终端输入) 2、解压文件: #tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz #cd R-3.0.1 3、安装


    安装环境:

    centos、R3.0.1

    1、在终端下下载:  

    #cd /usr/local/

    #wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.0.1.tar.gz  (终端下输入)

    2、解压文件:

    #tar -zxvf R-3.0.1.tar.gz
    #cd R-3.0.1

    3、安装文件

    #yum install gcc-gfortran

    #yum install glibc-headers

    #yum install gcc-c++


    #yum install readline-devel
    #yum install libXt-devel

    #./configure  --enable-R-shlib --prefix=/usr/local/R-3.0.1
    #make
    #make install

    4、配置环境变量

    cd  到etc/profile ,

    编辑文件 vim profile

    加入

    export R_HOME=/usr/local/R-3.0.1

    export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

    保存并退出,

    然后

    #source profile

    重启操作系统

    5、测试:创建脚本(t.R)

    可以在当前环境下输入
    #R

    OK,安装完成了,或者
    在某一个文件夹下创建一个R文件xx.R

    输入内容

    #!/path/to/Rscript    #第一行
    x<-c(1,2,3)    #R语言代码
    y<-c(102,299,301)
    model<-lm(y~x)
    summary(model)

    6、测试:执行脚本

    在终端Rscript  xx.R #结果直接输出到终端

    7、安装R语言包

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    上面是一个例子,若是你不知道包的版本号,我有一个办法:

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/包名          比如包名是xlsx

    然后文件夹下会下载一个网页就是包名网页,里面有包的版本号,然后复制你要的版本号重新下载

    wget http://cran.at.r-project.org/src/contrib/Archive/xlsx/xlsx_0.5.5.tar.gz

    然后在下载的包的目录下执行  R CMD INSTALL xlsx_0.5.5.tar.gz

    当然包之间会有依赖性,提示安装错误一般是依赖的包还没安装,可以先将依赖的包给安装好


    展开全文
  • 在Linux下安装R语言包的时候出现问题:make XXX:permission denied 最近做因果推断相关的研究,发现因果推断中许多代码的实现甚至是数据集的模拟都是使用的R语言,迫不得已我也开始学习R的使用。 进行因果推重...

    在Linux下安装R语言包的时候出现问题:make XXX:permission denied

    • 最近在做因果推断相关的研究,发现因果推断中许多代码的实现甚至是数据集的模拟都是使用的R语言,迫不得已我也开始学习R的使用。

    在进行因果推重一个benchmark数据集IHDP的模拟中,要使用到名为NPCI的R包。安装的时候报了如下错误(只提取错误中关键的部分):

    make xxx:permission denied
    

    分析:这个报错显然是make的时候权限不够。奇怪的是以前在python装包(即使是源码装包)的时候从未遇到过如此问题。
    解决方法

    • (1)刚开始想的是在安装包的源码中找到make语句,然后在make语句前加sudo。可问题是我没在源码中找到make语句,因此该方法失败。。。
    • (2)在进入R命令行前输入:
    sudo su
    

    这个命令是使shell里的全部命令都以sudo权限执行。在输入这个语句后,再进入R命令行,安装成功!
    疑问:

    • 以前使用python的pip的时候貌似没遇到过该问题。
    • 其次sudo里的R和普通模式下的R貌似不是一个环境,因为我sudo进的R后发现很多以前安装的包都需要重新安装。
    展开全文
  • Linux下安装R语言

    2014-04-22 19:30:46
    命令如下:sudo gedit /etc/apt/sources.list1、deb http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ precise/ 2、deb ...

    命令如下:
    sudo gedit  /etc/apt/sources.list
    1、deb http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/bin/linux/ubuntu/ precise/ 
    2、deb http://dk.archive.ubuntu.com/ubuntu hardy universe
    sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 51716619E084DAB9 


    sudo chmod -R 777 /usr/lib/R/etc/
    更新软件源:
    sudo apt-get update
    r-base-dev
    安装软件 sudo apt-get install r-base r-base-dev
    安装完以后输入  R 就可以进入R的命令端

    展开全文
  • 最近帮同学调试R语言程序,需要在Linux环境下安装R语言程序。我已经虚拟机里面安装了Ubuntu Linux操作系统,就这个环境进行安装。 由于我也是Linux菜鸟,就直接用root用户登录的,也不管什么权限问题了。 ...
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    千次阅读 2019-02-15 18:16:51
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  • 在R下输入>install.packages("package_path",repos=NULL)​即可。此外可以参考一下内容Then Install BioConductor PackagesRight now, the easiestway to install BioConductor packages is using the biocLite....
  • Linux系统安装R语言

    千次阅读 2018-01-15 23:42:02
    其实,ubuntu linux 系统利用其提供的apt-get命令可以方便的安装R语言。工具/原料 ubuntu5.10 方法/步骤 进入系统,打开终端。输入命令:sudo -s。回车,输入用户密码,将权限提升为root权限。Lin
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  • R for Linux 安装指南1、下载wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.1.tar.gz2、解压:tar -zxvf R-3.2.1.tar.gzcd R-3.2.13、安装必备软件sudo yum install readline-develsudo yum install ...
  • linux下安装R语言报错问题解决

    千次阅读 2019-01-24 18:54:33
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  • R语言Linux下R语言的下载与安装

    万次阅读 2016-01-11 14:49:42
    Linux下R语言的下载与安装 1、下载R语言 2、安装R语言
  • 背景介绍非Root权限的账户在linux安装R时,会遇到各种各样的问题,小编作为资深“踩坑”专家,今天就好好为大家“排排坑”!配置环境所需文件配置环境时,你可能用到的文件及下载地址有(可以直接用wget+下载地址...
  • Linux下yum安装R语言

    千次阅读 2017-11-06 13:47:09
    1、安装epel yum源 **1)安装** rpm -ivh http://mirror.utexas.edu/epel/6/x86_64/epel-release-6-8.noarch.rpm **2)查看** rpm -qa|grep epel **3)导入KEY** rpm --import /etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-EPEL-...
  • Linux环境下安装R语言

    2016-03-30 13:32:04
    Linux环境下安装R语言 1. 新建文件夹 mkdir software 2. 打开software 文件夹 cd software 3. 下载R压缩包 wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.4.tar.gz 4. 解压
  • Linux安装R语言环境

    2019-08-22 19:48:43
    Linux安装R语言环境 更新包列表 sudo apt-get update 安装R sudo apt install r-base 启动shell sudo -i R 到此安装成功 测试
  • linux下R安装Rstudio安装
  • R for Linux 安装指南1、下载wget http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/src/base/R-3/R-3.2.1.tar.gz2、解压:tar -zxvf R-3.2.1.tar.gzcd R-3.2.13、安装必备软件sudo yum install readline-develsudo yum install ...
  • 此文与笔者Hexo博客同步更新.前言由于网络安全、访问国外镜像网站速度较慢等原因,无法在线安装R包...方法1)下载所有R包到本地#linux 终端(或windows cmd窗口)2)将所有下载的R包相关信息写到配置文件#R 终端path wr...
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    2016-06-12 21:32:55
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  • linux下R语言离线安装依赖包

    千次阅读 2018-12-18 16:26:56
    linux下R语言离线安装依赖包 shell命令行执行 R CMD INSTALL package.tar.gz
  • linux环境下安装R语言

    2013-06-03 01:33:00
    sudo apt-get update sudo apt-get install r-base

空空如也

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如何在linux下安装r语言

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