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  • 目的:探讨CBL在病理生理教学中的重要性。 方法:将2015级本科临床学生218名,分为CBL组和对照组,每组109名。 CBL组由CBL教,而对照组由常规教学模式教。 通过问卷调查和阶段测试评估教学效果。 结果:CBL组在...
  • 医学图像处理——影像组的建模过程

    千次阅读 多人点赞 2019-08-15 22:16:07
    这篇文章说一下怎么分析医学影像图像,并...现在的影像组更加需要严格的统计学意义,需要临床意义上的总结分析才能够发文章。 第二次补充。 最近发现有个叫pyradiomic的python包可以用来提取各种组特征,挺方便的。

    这篇文章说一下怎么分析医学影像图像,并利用统计学和机器学习建模,实现预后等回归学习。这篇文章会不断的修改,因为我也会不断的学习,不断的添加和改正文章中的内容。
    医学影像已经是非常火的一个方向了,对于医学图像的处理有很多不同的领域,也有很多不同的方法。随着人工智能的发展,很多的人工智能算法已经在医学图像的处理中取得非常不错的进展。比如说深度学习中,Unet对HE染色和IHC染色图像的细胞核分割,CT或者MR图像的肿瘤分割等。在深度学习没有火起来的时候,对医学影像的处理更多的是基于从图像中提取特征,然后在通过机器学习对特征进行建模,实现分类(预后好坏等)。我下面就从流程上说说如何进行图像数据的评估,如何对图像进行特征提取,如何建模等。
    首先是图像的获取。一般的影像图像有,CT,X光,MR等。病理图像(HE,WSI,ICH等)是用显微镜拍的,虽然也可以按照类似的方法来做,但这里不涉及病理图像。我们一般都是用肿瘤的CT或者MR,一个是因为这种预测更有意义:对临床上对肿瘤的治疗很大程度上是根据肿瘤的分级和分期来指定治疗方案的,而且对肿瘤的准确预后也对治疗决策的指定有着非常大的影响。传统的分级分期和预后的方法大多数是根据一些临床检测的指标,比如说各种体内成分的含量,有无转移,有无浸润,肿瘤大小,肿瘤边缘的情况等等等等。这些指标都是比较传统医学的指标,一个是预测不是准确,一个是主观性太强,很依赖医生的经验(比如说有无浸润的判断,肿瘤边缘是否清晰等)。一个是这个工作几乎只有计算机可以做。因为这类影像图像灰度级别差距很小,虽然可以通过窗宽窗位来进行观察,但人眼还是有很大的局限。计算机的辅助还是很有必要的。
    所以图像一般都是医学里面对患者的真实数据资料,一个是公开数据库的资料。如今医学影像的研究已经很普及,网上也有很多公开的数据库,很多机构也举行了类似的比赛,想要下载资料的话应该开始比较容易的。
    图像拿到以后,我们还需要一点处理。一般来说,我们都会划定我们需要提取体征的区间。也就是我们所说的ROI。我们都看过CT或者MR的图片,我们会发现图片上并不是所有区域都是肿瘤或者不正常的组织,很大一部分是正常的。所以我们就要把病灶圈出来
    在这里插入图片描述
    类似这样子,把肿瘤区域画出来,我们把绿色的线叫做roi。如果是CT这样的的断层扫描图像,那我们就有不同的处理方式。一个是每一张图片都画ROI,然后对所有层的图片进行提取。一种是挑一张具有代表性的层(可以是肿瘤最大的一层),画ROI。ROI的储存形式有很多种,不懂的格式有不同的存储方式。ROI一般都是医生画的,公开的数据库里面很多都会带有ROI。如果不对图像进行画ROI,直接进行处理这种方式现在几乎不会做这么做了,我个人也认为不画ROI是非常不可取的,因为提取的时候涉及了太多的非肿瘤区域,得出的结果也不可信。
    接着我们就是对图像进行特征提取。特征有很多种,有我们一般的形态特征(就是肿瘤的大小等),一阶灰度特征(灰度直方图等),灰度共生矩阵等,小波特征等。这些特征总得加起来数量也会非常可观。形态特征可以提取10多到几十个,一阶特征也可以有很多个,小波各种参数加起来可以几百到上万个。
    在特征方面,其实也有挺多问题的,比如说图像本身就有很多不同。不同机型,不同参数拍出来的图片其实是有很大的区别的,如果我们不做标准化,我们收集到的图像本来就不在一个维度,所以这个就会造成很多的差异,但这个好像并没有很好的解决方法。现在报道的好像没有很统一好用的标准化方法。
    特征提取出来后,一般是要进行ICC检验的。(具体可以维基百科查一下,或者看我的另一篇博文)
    ICC后选出ICC值较高的特征(一般都要大于0.75,大于0.9最好),我们就要进行降维了。降维的方法和建模方法一样,多的数不清。我们可以用统计学的方式,比如说我们可以算每个特征的KM曲线,选取相关性高的特征。也可以做C-index。同时,我们也可以用机器学习的方法降维,降维方法也有很多种,比如常用的lasso,岭回归,MRMR等等。一般特征数量不超过样本数的10%。比如说有200个样本,那么特征数就不要超过20个。在建模完成后也可以用AIC评估模型。一般是在能取得好的回归效果的前提下,特征数越少越好,多了会过拟合。
    在选取了特征后,一般都要进行特征的归一化,这样子可以均衡特征的权重,不会使得一些特征值很大的特征占据过大的权重,而小值的特征占据过小的权重。
    然后就是建模和调参了。模型可以选取很多种,lasso啊,svm啊,cox回归啊之类的。总是就是都试一遍,看看那个效果好。还有就是对模型的调参,这个就不细说。
    最后的就是结果的conclusion了。这个是非常重要的。一般的工科生都会在这里吃亏。工科并不注重结果的意义,只是求出来一个好的结果就收工。但是如果是想要发表临床相关的文章,就要对结果进行详尽的分析。分析才是文章的大头。
    分析的方法多种多样,评估的方式,图表也是多种多样,这里也不细说,详细的去看看一些相关文献吧。
    以后会不定时修改这篇文章。查漏补缺。
    欢迎指正。
    第一次补充。
    这种形式的影像组学已经出现了几年,现在更多的成为临床医生用来发文章的方向。虽然研究很多,但是并没有一套能够在CT图像甚至是单病种的CT图像通用的方法和特征。建模方法简单,临床意义明确,成为了水文章的好方向。现在的影像组学更加需要严格的统计学意义,需要临床意义上的总结分析才能够发文章。
    第二次补充。
    最近发现有个叫pyradiomic的python包可以用来提取各种组学特征,挺方便的。

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  • 医学信息复习

    千次阅读 多人点赞 2018-01-18 22:22:30
    解释以下名词及了解相关应用意义: ICD-10:根据疾病的某些特征,按照规则将疾病分类,并用编码的方法来表示的系统.目前全世界通用的第十次修订本. SNOMED:人类与兽类医学系统术语,是当今最完整、最富于表达力、最具...

    题型 选择题 名词解释 解析题
    解释以下名词及了解相关应用意义:
    ICD-10:根据疾病的某些特征,按照规则将疾病分类,并用编码的方法来表示的系统.目前全世界通用的第十次修订本.
    SNOMED:人类与兽类医学系统术语,是当今最完整、最富于表达力、最具弹性的医学词汇系统。SNOMED RT:是一个多维的,多层次的医学术语标准,能够利用计算机提取、交换和统计分析临床信息。
    SOAP:(subjective,objective,assessment,plan)组织结构化的社区医疗病历的标准。其中S(subjective)表示主观信息,如症状;O(objective)表示客观信息,如体征;A(assessment)表示诊断、评估,如疾病;P(plan)表示诊疗计划,如药物、手术。
    HIS:(hospital information system)医院信息系统。指利用计算机软硬件技术、网络通信技术等现代化手段,对医院及其所属各部门的人流,物流、财流进行综合管理,对在医疗活动各阶段中产生的数据进行收集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息,从而为医院的整体运行提供全面的,自动化的管理及各种服务的信息系统。
    CIS:(clinic information system)临床信息系统。指利用计算机软硬件技术、网络通信技术对病人临床医疗信息进行采集,存储、处理、访问和传输,支持医务人员医疗活动,提供医疗决策支持,以病人为中心,以提高医疗质量为目的的信息系统。
    LIS:(laboratory information system)实验室信息系统。是为管理检验医学中的信息而设计的信息管理系统,实现检验流程中的信息采集、存储、处理、传输、查询,并提供检验信息分析和支持实验室管理。
    NIS:(nursing informatics system)护理信息系统.是护理信息学最具体的落实,也是护理人员使用的主要工具,与护理工作息息相关。
    RIS: (Radioiogy information system, RIS)放射信息管理系统。是优化医院放射科工作流程管理的软件系统,一个典型的流程包括登记预约、就诊、产生影像、出片、报告、审核、发片等环节。
    PACS:(picture archiving and communication system)医学影像存储与传输系统,具有实用性、安全性、高效性、先进性、可拓展性、方便性、可操作性、高在线量的设计原则。
    DICOM:(digital imaging and communications in medicine):医学数字成像和通信标准。规定了各种医学影像的格式、内容、存储方法以及交换医学信息影像信息的协议,任何医疗器械或者软件,只要遵照DICOM标准,就能够相互自由交换信息。
    HL7:一种医疗卫生信息交换的标准,构建在通信开放互连模式的第七层应用层。全面细微的规定了医疗卫生机构可能使用的临床信息和管理信息的交换格式、触发事件、信息形态及交换法则。
    UMLS:(unified medical language system)统一的医学语言系统.从超过40多个不同的来源收集了超过331000个术语,并尝试与不同来源的同义词和相似术语联系。主要包含医学概念的元词汇和语言网络两部分。
    CDSS:(clinical decision support system)临床决策支持系统。是一类辅助临床工作人员、患者以及其他潜在用户智能化地获取或筛选临床医学数据和知识,进行专项问题的辅助判断,达到改善医疗服务和提高医疗质量目的的系统,而在患者的诊断过程中为临床医生提供不同程度知识和辅助作用的计算机系统。

    1. 信息学基础
    a) 信息概念:信息是对人有用的数据,这些数据将可能影响到人们的行为与决策
    b) 特性和属性是什么
    特性
    ⒈信息不是物质,信息是可以共享的。
    ⒉信息没有质量,然而信息的传递需要载体,没有载体的信息是不存在的。
    ⒊信息不是能量,它可以不遵守能量守恒定律,信息是可以暂时消失或永久消失的。
    ⒋信息是可以处理的,信息只有通过处理、发布、交流、使用才能体现它的真正的价值
    ⒌信息是可以通过不同的载体进行传输或存储的。
    ⒍信息有时候是有“时效性”及“针对性”的。
    ⒎信息是可以暂时消失或永久消失的

    c) 信息处理 香浓公式 会用公式解决实际问题,如计算DNA分子(4个碱基)的信息量等应用。

    2. 医学信息学概念:探讨生物学的、医学的或者更广义的健康数据的采集、存储、交互和展现的过程的科学;探讨如何利用信息科技来优化这些过程的科学;以及探讨如何利用这些数据实现数据信息和知识层次的各种应用的科学。
    3. 标准化的概念:标准化是为了在一定范围内获得最佳,对现实问题或潜在问题制定共同使用和重复使用的条款的活动。
    a) 标准的概念:标准是为了在一定的范围内获得最佳秩序,经协商一致制定并由公认机构批准,共同使用的和重复使用的一种规范性文件。
    b) 医学信息标准化的基础
    i. 医学信息的分类和编码(信息标准化)
    ii. 硬件和软件的标准化(信息处理标准化)
    c) 分类的概念:分类,即按照事物的特点、种类、等级或性质等分别进行综合归类。
    d) ICD分类的序化原理:ICD使用的疾病分类特性,可以归纳为四大类:病因、病理、部位、临床表现(包括症状、体征、分期、分型、性别、年龄、急慢性、发病时间等)。每一特性构成一个分类标准、形成一个分类轴心,所以ICD是一个多轴心的分类系统。
    e) ICD分类方法:
    1 三层分类:首先是类目,类目下分亚目,亚目下分细目。同一层次的分类都是围绕。一个轴心展开的(个别情况有两个轴心)。两个层次之间则是从属关系,例如亚目从属于类目,并继承类目的基本特性。
    2 双重分类(星号和剑号分类系统)
    3 ICD索引排列方法:

    f) 编码概念:编码,是将信息分类的结果用一种易于被计算机和人识别的符号体系表示出来的过程(是如何合理地把被处理对象数字化、字符化的过程)。
    g) ICD采用的代码方法:
    类目,是三位数编码,包括一个字母和两位数字;
    亚目,是四位数编码,包括一个字母、三位数字和一个小数点;
    细目,是五位数编码,包括一个字母、四位数字和一个小数点。
    h) ICD代码符号的含义

    i) ICD的具体应用(星号和剑号的区别)
    星号表明疾病的临床表现,剑号表示疾病的原因
    j) 什么是SNOMED,懂得Snomed的一些具体应用。(各种字母模块代表的意义,G的意义)
    SNOMED,人类与兽类医学系统术语,是由美国病理学会制订,广泛用于描述病理检验结果的医学系统术语。
    4. 医院信息系统
    a) HIS医院信息系统概念: 是指利用计算机软硬件技术、网络通讯技术等现代化手段,对医院及其所属各部门的人流、物流、财流进行综合管理,对在医疗活动个阶段中产生的数据进行采集、存储、处理、提取、传输、汇总、加工生成各种信息,从而为医院的整体运行提供全面的、自动的管理及各种服务的信息系统。
    b) HIS必备的字典包括哪些?
    1 药品字典
    2 治疗、护理项目编码字典
    3 医疗仪器、设备编码字典
    4 医疗收费项目编码字典
    5 国际疾病分类代码(ICD—10)
    6 病人标识编码字典
    7 医院职工编码字典
    8 医院科室、病区编码字典
    9 人事字典
    c) HIS数据流程图,知道医院内部的所以部门的详细流程 p91-92 93-94

    d) HIS|规范中定义的HIS划分为几部分?临床诊疗、药品管理、经济管理、综合管理和统计分析、外部接口
    e) 信息系统开发方法步骤:
    方法:1 生命周期法、2 原型法、3 面向对象方法、4 利用软件包开发
    1步骤:系统规划、系统分析、系统设计、程序开发、系统实施、系统验收
    2步骤:确定用户的基本需求、建立初始原型、运行和修改原型、正式开发
    3步骤:系统调查和需求分析、面向对象分析(OOA)、面向对象设计(OOD)、面向对象编程(OOP)
    5. 临床信息系统
    a) 概念: 是指利用计算机软硬件技术、网络通讯技术对病人信息进行采集、存储、传输、处理、展示,为临床医护人员和医技科室的医疗工作服务,为提高医疗质量为目的的信息系统。
    b) CIS和HIS的区别: CIS以处理临床信息为主,服务对象是医院的医、教、研人员;HIS以处理人、财、物等信息为主,服务对象以医院各级管理人员为主。
    c) 电子病历概念EPR (EHR),它的意义?是基于一个特定系统的电子化病人记录, 该系统提供用户访问完整准确的数据、警示、提示和临床决策支持系统的能力。
    术语:CPR(计算机化的病人记录)、EPR(电子病人记录)、EMR(电子医疗记录)、EHR(电子健康记录)
    区别:1 时间长度方面,EPR和EMR是病人历次就诊、诊疗的信息,EHR则是个人的终身健康档案;2 应用范围方面,EPR和EMR是基于医疗活动,EHR则是基于个人的终身电子保健档案。(EHR是EMR的进一步延伸)
    意义:信息容易保存、信息容易检索及分析、信息容易规范、便于共享信息、便于信息的再利用、便于维护人们的合法权利。
    d) 临床路径:是由医院各种背景的专家,根据某种疾病或某种手术方法,制定一种大家同意认可的治疗模式,让病人由住院到出院都依次模式来接受治疗,并依据治疗结果来分析评估及总结每个病人的差异,以避免下一个病人住院时发生同样的失误,通过此种方式来控制医疗成本,维护并提高医疗质量。
    e) 挂号系统流程图
    6. NIS的概念: 护理信息系统,是指利用计算机软硬件技术、网络通讯技术,帮助护士对病人信息进行采集、管理,为病人提供全方位护理服务的信息系统。
    7. 电子病历
    a) SOAP的概念
    b) 病历组织信息的特点
    c) 电子病历的信息分析
    i. 来源: 1 病人与家属 2 实验室化验与检查 3 医务人员
    ii. 三个信息的组织特点 1 以时间为序 2 以信息源为基础 3 以问题为中心
    d) EPR( EHR)的基本结构,EPR实现的首要任务是什么?
    电子病历的结构有宏观和微观两种层次.
    e) 真正意义的EPR结构化指什么
    f) 数据的时间表达特点: 两种时间表示形式:相对时间和绝对时间。时间的使用时需要考虑的问题:时间形式的确定、时间精确度、时间约束、时序约束、时间记录。
    g) EPR的安全性包括什么内容,如何理解
    1 用户身份的确定 2 病历使用授权的设定 3 应负责任
    8. 图像与传输系统
    a) PACS的概念: 医学图像存档与通讯系统,是为了全面解决医疗图像设备产生的图像的获取、显示、存贮(zhu)、传送、信息处理和管理的综合应用系统。
    b) 医疗设备成像原理:
    1 X射线(人体器官和组织对X线的衰减不同,透射的X线的强度也不同)
    2 计算机X线断层扫描CT
    3 磁共振MR
    4 超声
    5 放射性核素
    6 医用红外
    7 内窥镜、显微、中医临床
    c) 数字图像精度与储存容量的关系
    d) 能说出几种常用图像处理的方法:
    图像恢复、图像增强、图像重建、三维成像、图像压缩、图像配准与融合、图像理解(边缘提取和图像分割)。
    e) DICOM的概念,DICOM信息模型。
    概念:DICOM(Digital Imaging and Communication of Medicine),“医学数字化图像通信/交流的共同规则”,是美国放射学会和美国电器制造商协会组织制定的专门用于医学图像的存储和传输的标准名称。信息模型:主要有四个层次,分别是患者、研究、系列和图像层次
    f) 数字图像存储NAS,SAN的意思
    NAS——网络附加存储,即将存储设备连接到现有的网络上,提供数据和文件服务。
    SAN——存储区域网络,即通过特定的互联方式连接的若干台存储服务器组成一个单独的数据网络,提供企业级的数据存储服务。
    与NAS相比,SAN有以下特点:SAN具有无限的扩展能力;SAN具有有更高的连接速度和处理能力。实现SAN的硬件基础设施是光纤通道。
    9. LIS
    a) LIS概念:实验室信息系统,是指利用计算机技术、网络技术,实现临床实验室的信息采集、存储、处理、传输、查询,并提供分析及诊断支持的计算机软件系统,也可称为临床检验分系统。
    10. 远程医疗
    a) 概念:是指通过计算机技术、通信技术与多媒体技术,同医疗技术相结合,为远地病人提供医疗服务,旨在提高偏僻地区的诊断与医疗水平、降低医疗开支、满足广大人民群众保健需求的一项全新的医疗服务。
    b) 远程医疗技术基础
    i. 各种通信技术优劣:
    通信技术:网络接口、网络协议、视频传输、音频传输、静态图像(片)传输、病历档案、骨干网络。
    ii. 视频会议技术:视频会议系统,又称会议电视系统,是指两个或两个以上不同地方的个人或群体,通过传输线路及多媒体设备,将声音、影像及文件资料互传,实现即时且互动的沟通,以实现会议目的的系统设备。
    iii. 信号采集压缩技术(流媒体技术):是把连续的影像和声音信息经过压缩处理后放上网站服务器,让用户一边下载一边观看、收听,而不要等整个压缩文件下载到自己的计算机上才可以观看的网络传输技术。
    iv. 什么是卫星VSAT通信系统:Very Small Aperture Terminal 甚小口径卫星终端站。利用 VSAT 此系统进行通信具有灵活性强、可靠性高、使用方便及小站可直接装在用户端等特点,利用VSAT用户数据终端可直接和计算机联网,完成数据传递、文件交换、图像传输等通信任务,从而摆脱了远距离通信地面中断站的问题。使用VSAT作为专用远距离通信系统是一种很好的选择。
    11. 社会医疗保险
    a) 社会医疗保险应用软件开发的基本要求
    b) MIMIS与HIS数据交换
    12. 中医药领域的信息处理
    a) 中医信息的特点和原理
    b) 其启发性 |(黑箱理论)
    13. HIS的技术支持和安全性
    a) C/S的概念:是软件系统体系结构,通过它可以充分利用两端硬件环境的优势,将任务合理分配到 Client端和Server端来实现,降低了系统的通讯开销。
    HIS的主流产品的开发设计大多采用基于分布式数据库的C/S体系结构,即服务器端安装数据库管理系统(DBMS),客户端安装功能各异的应用程序。
    b) 应用软件技术特性
    i. 一体化
    ii. 各种安全性的措施是什么
    14. 医学信息学发展
    a) 新技术和标准
    b) 中间件技术
    c) HL7的概念和应用
    i. HL7原理 P287-288
    ii. HL7消息的组成
    iii. 掌握HL7 v2.31标准书写消息 ,如PID.MSH的定义,他们的详细组成的含义等。
    iv. 能解释出HL7消息,(HL7实验)
    v. 中心法则:是指遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。也可以从DNA传递给DNA,即完成DNA的复制过程。这是所有有细胞结构的生物所遵循的法则。在某些病毒中的RNA自我复制(如烟草花叶病毒等)和在某些病毒中能以RNA为模板逆转录成DNA的过程(某些致癌病毒)是对中心法则的补充。
    15. 决策支持
    经典的医学决策支持系统
    在决策树ID3算法
    1.临床上腹部疼痛的诊断经验如下:如果右上腹疼痛,可能是胆囊炎(概率0.6)或者肝炎(概率0.2),也有可能是其它疾病。如果右下腹疼痛,可能是阑尾炎(概率0.3),宫外孕(概率0.2),或者卵巢囊肿(概率0.15),也有可能是其它疾病。如果出现高热,可能是阑尾炎中的急性阑尾炎(概率0.78),否则可能是慢性阑尾炎。(概率0.22)。按上述临床经验画出上腹部疼痛的诊断决策树。

    条件概率

    一、 某地区肝癌发病率为0.0005,临床上已知甲胎蛋白是重要检查指标之一,假设肝癌病人的甲胎蛋白的阳性概率为95%,非肝癌病人的甲胎蛋白的阴性概率为90%,计算该地区人群甲胎蛋白为阳性时,患肝癌的概率是多少?
    设A={甲胎蛋白为阳性},B={是肝癌病人}
    P(A|B)=0.95;P(-A|-B)=0.9
    P(A|-B)=1-0.9=0.1;P(B)=0.0005
    P(-B)=0.9995;P(B|A)=( P(B)* P(A|B))/( P(A))=( P(B)* P(A|B))/( P(B)* P(A|B)+ P(-B)* P(A|-B))=0.0047
    2 如果知道DNA单链中有N个碱基,学会用香农公式计算其DNA的容量?

    3)问题:如果在一条信道带宽为3000Hz,信噪比为30dB,则最大传输数据速率理论上为多少?
    30=10Log10(S/N),得出S/N=1000
    C=3000Log2(1+1000)=29901.68=30kbps
    3 运用HL7手册(v2.31) 尝试解释以下的消息含义(每个字段的含义):

    MSH|^~\&|ADT1|MCM|LABADT|MCM|199807201126||ADT^A01|MSG00001|P|2.3|<cr>
    EVN|A01|199807201123|<cr>
    PID|1||PATID1234^5^M11||Jones^Sam^Houston||19670329|M||C|1200 N ELM STREET^^GREENVILLE^NC^27401-1020|GL|(919)379-1212|(919)271-3434||S||X454337 ^2^M10|123456789|987654^NC|<cr>
    NK1|1|JONES^BARBARA^K|WIFE||||CP^Contact person|<cr>
    PV1|1|I|2000^2012^01|E||||004777^LEBAUER^SARA^J.||TRMA||||ADM|A0|<cr>

    “ | ” 代表: 分隔符
    ADT代表: 入院出院转院;MCM:代表:位置名;LABADT: 代表 接受信息的系统名称
    199807201126 入院时间,1998年7月20日11点26分
    EVN 事件类型 .199807201123 就诊时间,1998年7月20日11点23分
    PID 病人基本资料;PATID1234^5^M11 就诊者ID; Jones^Sam^Houston 就诊者姓名;
    19670329 出生日期;M 性别;C 种族
    1200 N ELM STREET^^GREENVILLE^NC^27401-1020 就诊者地址
    X454337 ^2^M10 就诊者账号(919)379-1212 家庭电话号码
    (919)271-3434 商业电话号码123456789 SSN 号码—就诊者
    987654^NC 就诊者驾驶执照号码
    NK1 血缘关系JONES^BARBARA^K 妻子名字WIFE 关系
    PV1 病人就诊2000 护理部门2000^2012 病房号^01 01号
    004777 医生编号^LEBAUER^SARA^J. 医生姓名

    • 门诊挂号流程:
    1.初始化功能:
    – 包括建立医院工作环境参数、诊别、时间、科室名称及代号、号别、号类字典、专家名单、合同单位和医疗保障机构等名称;
    2.号表处理功能:
    – 号表建立、录入、修改和查询等功能;
    3.挂号处理功能:
    – 1)支持医保、公费、自费等多种身份的病人挂号;
    2)支持现金、刷卡等多种收费方式;
    3)支持窗口挂号、预约挂号、电话挂号、

    4.退号处理功能
    5.查询功能;
    – 能完成预约号、退号、病人、科室、医师的挂号状况、医师出诊时间、科室挂号现状等查询;
    6.门诊病案管理功能:
    1)门诊病案申请功能:根据门诊病人信息,申请提取病案;
    2)反映提供病案信息功能;
    3)回收、注销病案功能;
    7.门急诊挂号收费核算功能;
    – 能即时完成会计科目、收费项目和科室核算等;
    8.门急诊病人统计功能:
    能实现提供按科室、门诊工作量统计的功能
    9.系统维护功能:
    能实现病人基本信息、挂号费用等维护。


       全国医疗卫生信息技术职业技能培训与认证考试实用医学信息学模拟试卷   
      一、单项选择题(共30题,2分/题,合计60分)

      1、关于数据的正确概念是:( )

      A.数据是对人有用的信息 B.数据是信息的载体

      C.数据是特殊的一种物质 D.数据是一种特殊的能量

      2、信息系统的组成不包括下列哪一项:( )

      A.信源 B.载体 C.信宿 D.信道

      3、下列哪一项表示“国际医学信息学会” ( )

      A.CMIA B.IMIA C.WHO   D.ISO

      4、关于“标准”的正确概念是:( )

      A.是针对现存的潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度

      B.是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件。其宗旨是使该环境达到最佳有序度

      C.是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构

      D.是国际化的标准组织

      5、关于信息的正确概念是:( )

      A.信息是数据的素材 B.信息是数据的载体 

      C.信息是对人有用的数据 D.信息是一种特殊的物质

      6、关于“标准化”的正确概念是:( )

      A.是针对现存的潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,其宗旨是使该环境达到最佳有序度

      B.是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件。其宗旨是使该环境达到最佳有序度

      C.是负责为公共和常用事物的活动及结果划定和提供规则、指导原则的权威机构

      D.是国际化的标准组织

      7、在标准化遵循的原理中,下列各项中不正确的是:( )

      A.简化统一的原理 B.“一致同意”的原理

      C.定期修改的原理   D.自觉实行的原理 

      8、ICD的分类依据是疾病的主要特性,下列哪一特性不是分类依据:( )

      A.病因   B.病理 C.检验结果   D.部位

      9、ICD分类有3个层次,下列哪一项是“亚目”这一层次的基本特性( )

      A.是三位数编码,包括一个字母和两位数字。

      B.是四位数编码,包括一个字母、三位数字和一个小数点。

      C.是五位数编码,包括一个字母、四位数字和一个小数点

      D.双重分类(星号和剑号分类系统)

      10、关于SNOMED的结构特点,错误的是:( )

      A.具有11个独立的系统模块 B.术语按自然层次排列,并被分配5或6位代码

      C.术语之间互相无法连接 D.词条索引按照编码顺序排列
    BBBBC
    ADCBC

      11、HIS程序集成的常用方式是下列哪种( )

      A.数据集成 B.显示集成 C.功能集成 D.以上都是

      12、我国医院目前普遍采用的HIS体系结构是( )

      A.完全集中式(Mainfram) B.完全分布式(PC+Network)

      C.集中/分散式(Client/Server) D.多层结构

      13、卫生部2002年颁布的《医院信息系统基本功能规范》的外部接口,指下列哪一项( )

      A.医疗保险接口 B.社区卫生服务接口 C.远程医疗咨询接口 D.以上都是

      14、HIS必备的标准化数据字典不包括下列哪一种( )

      A.汉英字典 B.治疗、护理项目字典 C.国际疾病分类编码 D.医院职工编码字典

      15、下列哪项是Morris Collen关于医院信息系统的定义内容:( )

      A.是用计算机和通信设备收集、存储、处理和传输与医院相关的人流、物流、财流信息。

      B.是用计算机和通信设备收集、存储、处理和传输所有与医院相关的病人医疗信息和管理信息。

      C.是用计算机和通信设备收集、存储、处理和传输与图象相关的信息。

      D.是用计算机和通信设备收集、存储、处理和传输与临床实验室相关的信息。

      16、卫生部2002年颁布的《医院信息系统基本功能规范》的外部接口,不包括下列哪一项( )

      A.Internet接口 B.医疗保险接口

      C.社区卫生服务接口 D.远程医疗咨询接口

      17、医嘱实现的流程为4个步骤,下列哪项是正确的( )

      A.录入 生成执行 确认 打印

      B.录入 确认 生成执行 打印

      C.录入 确认 打印 生成执行

      D.录入 打印 确认 生成执行

      18、在HIS体系结构中,发展方向是下列哪一种( )

      A.完全集中式(Mainframe) B.完全分布式(PC + Network)

      C.多层结构 D.集中/分散式(Client/Server)

      19、实现HIS的程序集成的信息交换标准是:( )

      A.HL7 B.EDIFACT C.DICOM D. 以上都是

      20、门急诊挂号子系统的初始化功能是指:( )

      A.挂号退号功能 B.按病人医生进行查询功能

      C.建立诊类、科室、号类等工作环境参数和字典 D.门诊病历管理功能
    DCDAB
    ABCDC
      21、不同程序的功能在一个HIS 中,能被授权的用户使用,该程序集成的方式:( )
    A.显示集成 B.数据集成 C.功能集成 D.以上都是

      22、HIS通常采用的网络是:( )

      A.局域网(LAN) B.广域网(WAN) C.城域网(MAN) D.互联网(Internet)

      23、在临床信息系统范畴,放射学信息系统通常表达为( )

      A.RIS B.LIS C.CIS D.HIS

      24、人工智能的工作原理包括:( )

      A.知识的表达 B.知识的获取 C.知识的推理 D.以上都是

      25、知识表达的概念是:( )

      A.从知识源发现、吸取、构造和组织知识,形成知识库的过程。

      B.知识的形式化和模式化,即知识符号化过程。

      C.利用计算机技术,进行知识思维求解问题过程。

      D.利用计算机技术,对知识进行人工移植或机器学习的过程。

      26、利用计算机技术,在知识表达基础上使用形式化的知识模型,进行机器思维,求解问题是指人工智能原理中的哪一部分( )

      A.知识的表达 B.知识的获取 C.知识的推理 D.人工智能

      27、临床决策支持系统(CDSS)组成要素是:( )

      A.医学知识 B.病人数据 C.具体病例建议 D.以上都是

      28、系统化整体护理的护理程序正确流程是:( )

      A.诊断—计划—估计—实施—评价 B.评价—估计—诊断—计划—实施

      C.诊断—估计—实施—计划—评价 D.估计—诊断—计划—实施—评价

      29、基于知识库的护理信息系统中,“护理诊断”是采用下述哪个标准:( )

      A.ICD-10 B.ICD-O C.NANDA D.NIC

      30、下列哪一项反映了护理信息的流程,是护理信息系统的框架:( )

      A.护理诊断 B.护理程序 C.护理计划 D.护理评价
    CAADB
    CDDCB
      二、多项选择题(共10题,3分/题,合计30分)

      1、信息系统的组成有:( )

      A.信源 B.载体 C.信宿 D.信道

      2、ICD代码中含有星“*”、剑“↓”的双重代码,下列哪几项的含义是正确的( )

      A.“↓”表示疾病原因,“”代表临床表现 B.“”表示疾病原因,“↓”代表临床表现

      C.“↓”在前, “”在后 D.“”在前, “↓”在后

      3、实现HIS程序集成的主要技术有( )

      A.通过应用编程接口直接连接方式 B.完全集中式

      C.完全分散式 D.使用标准消息协议,通过信息交换的方式

      4、医学信息学是一门交叉学科:( )

      A.供体学科是计算机科学 B.供体科学是医学科学

      C.受体学科是计算机科学 D.受体科学是医学科学

      5、HIS与CIS相互区别,下列哪几项是HIS特点( )

      A.以医院为中心 B.以病人为中心

      C.主要数据为人流、物流、财流数据 D.主要数据为病人医疗数据

      6、关于数据的正确概念是( )

      A.数据是信息的素材 B.数据是信息的载体

      C.数据是特殊的一种物质 D.数据是能量

      7、下述护理程序示意图实质上表明了( )

      估 计

      诊 断

      计 划

      实 施

      评 价

      A.系统化整体护理的概念 B.护理信息系统的流程

      C.护理信息系统的框架 D.护理发展各个阶段

      8、HIS程序集成的实现技术有哪几种( )

      A.通过应用程序接口 B.医疗保险接口

      C.使用标准消息协议 D.远程医疗接口

      9、关于ICD的分类法,正确的是( )

      A.ICD以疾病的检查结果为依据 B.ICD以疾病的四大特性作为分类依据

      C.ICD是单轴分类系统 D.ICD是多轴分类系统

      10、在标准化遵循的原理中,下列各项中正确的是:( ) 

      A.简化统一的原理 B.“毫无异议”的原理 C.实施价值原理   D.自觉实行的原理 
    ACD AC
    AD AD
    AC AB
    BC AC
    BD AC
      三、判断题(共10题,1分/题,合计10分)(对用“T”表示,错用“F”表示)

      1、ISO对数据的定义:“数据”是对客观存在的事实、概念或指令的一种可供加工处理的特殊的表达形式。( )

      2、标准化:是指获得一致同意的,并由公认权威机构认可的文件,其宗旨是使该环境达到最佳有序度。( )

      3、标准:是指针对现存或潜在的问题,为公共的和常用的事物做出某些规定的活动,旨在使该环境达到最佳有序度。( )

      4、分类:指定一个对象或事物的类别或者(如多轴分类)类别集合的过程。( )

      5、编码:是某一领域内概念的序化和原理的序化。( )

      6、ICD-O:国际疾病分类第1版。是根据疾病的某些特征,按照规则将疾病分门别类,并用编码的方法来表示的系统。( )

      7、信息的传输需要能量 ,所以遵守守恒定律。( )

      8、信息不是物质,信息是可以共享的。( )

      9、ICD分类有三个层次:类目、亚目、细目,各围绕一个轴心。( )

      10、SNOMED的结构是将全部术语分入10个独立的系统模块(轴)。( )
    T F F F F
    F F T T F

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  • 医学影像组数据特征值介绍

    千次阅读 热门讨论 2019-05-31 11:19:49
    1.影像组中的特征值是什么含义? 2.如何对应到临床信息,这个课题应该计算哪些特征值? 3.如何验证这些特征值是正确的? 最新的pyradiomics可以计算的特征值包括以下几类: Radiomic Features This section ...

    在和临床一线医生合作中,遇到的最大问题就是:

    1.影像组学中的特征值是什么含义?

    2.如何对应到临床信息,这个课题应该计算哪些特征值?

    3.如何验证这些特征值是正确的?

    最新的pyradiomics可以计算的特征值包括以下几类:

    Radiomic Features

    This section contains the definitions of the various features that can be extracted using PyRadiomics. They are subdivided into the following classes:

    后文继续介绍上述这8类共120项特征值的含义。

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  • 这种情况最能发挥ROC曲线的意义,也能体现文章数据的科学性。但值得注意的是,有些文献在列出AUC时,同时说明了P值,但没有对应的统计值,这肯定是不合理的。诊断类文章常见配对试验设计,检验方法多为Z检验、q检验...

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    ROC曲线,即受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve),是以灵敏度为纵坐标,1-特异度为横坐标绘制而成的曲线,其在临床医学诊断类稿件中受到人们的广泛关注且应用逐渐深入。而稿件中的ROC曲线应用是否合理及数据逻辑能否行得通,还需认真分析。今天,小编就跟大家聊一聊ROC曲线在医学诊断类稿件中的应用。

    传统的诊断试验评价方法要求将试验结果分为2种,即阳性或阴性,然后再进行统计。而ROC曲线无此限制要求,即允许有中间状态,可以将试验结果划分为多个有序分类,如正常、大致正常、可疑、大致异常和异常五个等级再进行统计分析。那么,什么情况下可以应用ROC曲线?

    对诊断方法、技术的效能做出客观评价

    例如,评估超声和X线摄影对乳腺癌的诊断价值,以病理学确诊结果为金标准进行分析。这时的诊断结果即阳性或阴性,结果只有1个,不存在其他状态,绘制出来的ROC曲线表现为左上角有个折点。严格来说,这种情况下应用ROC曲线有“屈才”的感觉,而改用我们常见的四格表展示结果可能更为清晰、明了。因此,我们建议选择适宜的统计方法,避免“盲目”地追求“高级”。

    确定最佳的检测阈值

    如文献[1]所示,通过ROC曲线分别寻找到了血清CA125、CA199和CEA诊断卵巢癌时的最佳诊断点,并通过比较AUC得出单一诊断与联合诊断的价值大小(图1);这种情况最能发挥ROC曲线的意义,也能体现文章数据的科学性。但值得注意的是,有些文献在列出AUC时,同时说明了P值,但没有对应的统计值,这肯定是不合理的。诊断类文章常见配对试验设计,检验方法多为Z检验、q检验,因此,在列出P值时,应该给出对应的统计值,确保试验结果的客观、科学性。

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    最后,小编跟大家分享一些做ROC曲线的软件。首先,我们应该明确ROC曲线的绘制包括参数法和非参数法2种;非参数法没有条件限制,适用于任何诊断试验的ROC曲线绘制,常见的软件有SPSS、SAS,绘制出来的曲线为顶点较多的折线;参数法是假设患者和非患者的试验结果属于正态分布,常见于一些专业的ROC分析软件,如ROCKIT,绘制出来的是光滑的曲线。因此,ROC曲线类型与对应的软件也要合情合理哦!

    参考文献

    [1]赵瑞珩.ROC曲线评价血清CA125、CA199和CEA对卵巢癌的诊断价值[J].中国实验诊断学,2015(11):1954-1955.[2]冯广龙,姜慧杰.ROC曲线分析在医学影像学诊断中的价值[J].中华医学杂志,2015,95(3):231-233.
    [3] 王曼,徐春燕,施学忠.医学论文中ROC曲线应用错误例析[J].编辑学报,2019,31(2):46-48.

    编辑:魏婷 审校:郑淑

    临床医学研究与实践杂志社

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