PKCS 全称是 Public-Key Cryptography Standards ，是由 RSA 实验室与其它安全系统开发商为促进公钥密码的发展而制订的一系列标准，PKCS 目前共发布过 15 个标准。 常用的有：
PKCS#7 Cryptographic Message Syntax Standard
PKCS#10 Certification Request Standard
PKCS#12 Personal Information Exchange Syntax Standard

X.509是常见通用的证书格式。所有的证书都符合为Public Key Infrastructure (PKI) 制定的 ITU-T X509 国际标准。

PKCS#7 常用的后缀是： .P7B .P7C .SPC
PKCS#12 常用的后缀有： .P12 .PFX
X.509 DER 编码(ASCII)的后缀是： .DER .CER .CRT
X.509 PAM 编码(Base64)的后缀是： .PEM .CER .CRT
.cer/.crt是用于存放证书，它是2进制形式存放的，不含私钥。
.pem跟crt/cer的区别是它以Ascii来表示。
pfx/p12用于存放个人证书/私钥，他通常包含保护密码，2进制方式
p10是证书请求
p7r是CA对证书请求的回复，只用于导入
p7b以树状展示证书链(certificate chain)，同时也支持单个证书，不含私钥。

一 用openssl创建CA证书的RSA密钥(PEM格式)：
openssl genrsa -des3 -out ca.key 1024

二用openssl创建CA证书(PEM格式,假如有效期为一年)：
openssl req -new -x509 -days 365 -key ca.key -out ca.crt -config openssl.cnf
openssl是可以生成DER格式的CA证书的，最好用IE将PEM格式的CA证书转换成DER格式的CA证书。

三 x509到pfx
pkcs12 -export –in keys/client1.crt -inkey keys/client1.key -out keys/client1.pfx

openssl pkcs12 -export -in Cert.pem -out Cert.p12 -inkey key.pem

http://www.cnblogs.com/millen/archive/2011/05/03/2035031.html

常见的数字证书格式

CER后缀的证书文件有两种编码：第一种是DER二进制编码，第二种是：ASE64编码(也就是.pem) 
p7b一般是证书链，里面包括1个到多个证书 
pfx是指以pkcs#12格式存储证书的公钥和相应私钥。 

在Security编程中，有几种典型的密码交换信息文件格式: 
DER-encoded certificate: .cer, .crt 
PEM-encoded message: .pem 
PKCS#12 Personal Information Exchange: .pfx, .p12 
PKCS#10 Certification Request: .p10 
PKCS#7 cert request response: .p7r 
PKCS#7 binary message: .p7b 

.cer/.crt是用于存放证书，它是二进制形式存放的，不含私钥。 
.pem跟crt/cer的区别是它以Ascii 来表示。 
pfx/p12用于存放个人证书/私钥，他通常包含保护密码，二进制方式 
p10是证书请求 
p7r是CA对证书请求的回复，只用于导入 
p7b以树状展示证书链(certificate chain)，同时也支持单个证书，不含私钥。 

其中，我介绍如何从p12/pfx文件中提取密钥对及其长度: 
1、首先，读取pfx/p12文件（需要提供保护密码） 
2、通过别名(Alias,注意，所有证书中的信息项都是通过Alias来提取的)提取你想要分析的证书链 
3、再将其转换为一个以X509证书结构体 
4、提取里面的项，如果那你的证书项放在第一位（单一证书），直接读取 x509Certs[0]（见下面的代码）这个X509Certificate对象 
5、 X509Certificate对象有很多方法，tain198127网友希望读取RSA密钥（公私钥）及其长度（见http://www.matrix.org.cn/thread.shtml?topicId=43786&forumId=55&#reply），那真是太Easy了， 
X509Certificate keyPairCert = x509Certs[0]; 
int iKeySize = X509CertUtil.getCertificateKeyLength(keyPairCert); 
System.out.println("证书密钥算法="+keyPairCert.getPublicKey().getAlgorithm()); 
System.out.println("证书密钥长度="+iKeySize); 
提取了他所需要的信息。 

X.509定义了两种证书：公钥证书和属性证书   
PKCS#7和PKCS#12使用的都是公钥证书   
PKCS＃7的SignedData的一种退化形式可以分发公钥证书和CRL   
一个SignedData可以包含多张公钥证书   
PKCS＃12可以包含公钥证书及其私钥，也可包含整个证书链   

PFX文件转换为JKS文件

使用JWSDP工具包中的工具

安装J2SE 1.5，下载并运行jdk-1_5_0_09-windows-i586-p.exe 下载并安装jave web service develop pack, jwsdp-2_0-windows-i586.exe 创建一个新的keystore文件，里面的别名取做TEMP

keytool -genkey -alias temp -keyalg RSA -keystore server.jks

准备好要导入的PFX文件，server.pfx，运行：

C:\Sun\jwsdp-2.0\xws-security\bin\pkcs12import.bat pkcs12import -file server.p12 -alias server -keystore server.jks

查看server.jks 里面的证书记录：

keytool -list -v -keystore server.jks

JKS文件转换为PFX文件

通过jks2pfx工具

请下载：JKS2PFX转换工具。将压缩包解开到 c:\jks2pfx 目录下， 运行以下命令:
JKS2PFX <导出文件名> [Java Runtime的目录]
备注：
KeyStore文件：指Tomcat保存SSL证书的文件
KeyStore密码：KeyStore文件对应的密码
Alias别名：　 生成证书CSR时，所起的Alias别名
导出文件名：　准备导出的文件名称 (不要带扩展名)
Java Runtime的目录(可选)： 指包含Java.exe和keytool.exe的目录，如：c:\progra~1\Java\jre1.5.0_06\bin

例如：
JKS2PFX server.jks 123456 tomcat exportfile c:\progra~1\Java\jre1.5.0_06\bin
该命令将server.jks中别名为tomcat的SSL证书导出，运行后将产生3个文件 exportfile.key、exportfile.crt、exportfile.pfx，exportfile.pfx可以导入到微软的IIS中，exportfile.key和exportfile.crt 可用于Apache或者OpenSSL兼容的系统。 可以用下面命令查看PFX文件内容：
openssl pkcs12 -info -in exportfile.pfx

PFX文件转换为X509证书文件和RSA密钥文件

通过Openssl命令行

openssl pkcs12 -in myssl.pfx -nodes -out server.pem

openssl rsa -in server.pem -out server.key

openssl x509 -in server.pem -out server.crt

总结: 

1)P12格式的证书是不能使用keytool工具导入到keystore中的 

2)The Sun's PKCS12 Keystore对从IE和其他的windows程序生成的pfx格式的证书支持不太好.