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  • 并行计算加速比

    万次阅读 2016-05-30 00:40:34
    并行计算加速比计算

    为了定量知道并行程序的执行速度相对于串行程序的执行速度加快了多少,首先定义以下参数:令p是并行系统中的处理器数量;W指问题规模,或者给定问题的计算量,Ws指程序中的串行部分,程序中的并行部分为WpW=Ws+Wp;f=Ws/W为串行部分的比例;TsTp分别为串行、并行部分的执行时间;S为加速比,E为效率。


    Amdahl定律

    特点:要求实时性,因此时间是关键因素,而计算负载是确定的。适用于固定计算负载。
    对于固定的问题规模,通过增加处理器,减少平均的计算负载,来提升运算速度

    S=Ws+WpWs+Wp/p

    归一化之后得到,
    S=p1+f(p1)

    这意味着,随着处理器数目的不断增加,整个系统所能达到的最大加速比是有上界的,为1f

    如果考虑到并行计算时的通信、同步和归约的操作所花费的额外开销时间Wo,则

    S=1f+Wo/W

    Gustafson定律

    特点:精度是关键因素,而计算时间不变,由此需要不断增加处理器,增大计算量。适用于可扩放问题。

    S=Ws+pWpWs+Wp

    归一化后,
    S=pf(p1)

    这意味着,加速比与处理器数量成比例线性增加,同样如果考虑到额外开销,则得到
    S=pf(p1)1+Wo/W

    Sun、Ni定律

    特点:在存储空间允许的情况下,满足规定的时间要求,尽量增大计算量。

    S=fw+(1f)G(p)Wfw+(1f)G(p)W/p

    其中G(p)表示存储容量增加p倍后增加的计算量,归一化后,
    S=f+(1f)G(p)f+(1f)G(p)/p

    可以发现当G(p)=1时,它变成Amdahl定律的表达式,当G(p)=p时,它变成Gustafson定律的表达式,当G(p)>p时,表示计算负载比存储空间增加得快,此时的加速比前面两个定律得到的结论都快。

    加速比的经验公式为

    p/logpSp

    一般作为可并行部分占比高的以及额外开销较少的,有望达到线性加速。

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  • 3、 比较以上三种算法的运行时间,计算加速比。2 实验设计2.1 生成方阵为方便,本实验的方阵不采取手动输入的方式,而是使用随机数来生成矩阵元素。我定义了一个全局方阵变量——int p[100][100...

    以下内容为本人并行计算课程的期末作业,有不足的地方,请多多指教!

    实验目的

    本实验的目的主要有以下三点:

    1 实现方阵行列式的计算。

    2 实现方阵行列式的并行计算,分别基于 OpenMP MPI

    3 比较以上三种算法的运行时间,算加速比。

    实验设计

    2.生成方阵

    为方便,本实验的方阵不采取手动输入的方式,而是使用随机数来生成矩阵元素。

    定义了一个全局方阵变——int p[100][100]在创建方阵时,方阵的阶数N(N<100)外部输入。然后用两层for循环来给方阵 p左上角 N×N个位置赋值。具体实现如下

    /*
     * 定义矩阵阶数N
     */
    
    int N;
    
    /*
     * 定义一个全局矩阵
     */
    
    int p[100][100];
    
    /*
     * 用随机数生成矩阵
     */
    
    void create(){
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
    	{
    		for(j=0;j<N;j++)
    	
    	     {
               int a=rand()%15;//产生随机数,并赋给数组
    	       p[i][j]=a;
    		 }
    	}
    }


    2.打印矩阵

    将生成的矩阵输出,以便验算其计算行列式的正确性。具体实现如下:

    /*
     * 输出矩阵
     */
    
    void print()
    {
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
        {
    		for(j=0;j<N;j++)
    			printf("%d ",p[i][j]);
    		printf("\n");
    	}
    }

    2.计算矩阵行列式

    计算矩阵行列式的方法有很多,本实验选择的方法是:行列式按行展开法。行列式等于它任一行的各元素与其对应的代数余子式乘积之和。代数余子式:A(ij)=-1)^(i+j)M(ij).  (ij)为下标。某个元素的余子式等于原行列式划去该元素所在的行和列。本实验采取按第一行展开的方法。即:将高阶的行列式按第一行展开,一直重复展开行为,直到阶数为 1。上述过程可用递归完成。

    2.3.递归实现代码

    根据上面的理论,我们容易得出如下的实现方法:

    /*
     * 计算行列式的函数
     */
    
    long long mydet(int  p [100][100],int n){
    	if(n==1)  //n=1返回矩阵的唯一数,停止递归
    		return p[0][0];
    	else{
    		long long sum=0;
    		for(int i=0;i<n;i++)
    		{
    			    int pp[100][100];//用于存放少一维的矩阵,为方便直接定义为100×100.
    			for(int j=1,j1=0;j<n;j++)//去掉第一行
    			{
    				for(int k=0,k1=0;k<n;k++)
    				{
    					if(k==i)
    						;//去掉对应的列
    					else
    					{
    
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];//pp为余子式	
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
    			if(i%2)
                    sum+=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    			else
    				sum+=p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    		}
    		return sum;
    	}
    }

    2.4  实现串行\OpenMP\MPI计算

    我这里的并行主要是放在第一次的按行展开那,具体实现看代码吧。

    2.4.1  串行代码

    /*************************************************************************
        > File Name: matrix_det.c
        > Author: surecheun
        > Mail: surecheun@163.com
        > Created Time: 2017年12月06日 星期三 17时28分00秒
     ************************************************************************/
    #include<stdlib.h>
    #include<stdio.h>
    #include<math.h>
    #include<time.h>
    #include<time.h>
    /*
     * 定义矩阵阶数N
     */
    
    int N;
    
    /*
     * 定义一个全局矩阵
     */
    
    int p[100][100];
    
    /*
     * 用随机数生成矩阵
     */
    
    void create(){
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
    	{
    		for(j=0;j<N;j++)
    	
    	     {
               int a=rand()%15;//产生随机数,并赋给数组
    	       p[i][j]=a;
    		 }
    	}
    }
          
    /*
     * 输出矩阵
     */
    
    void print()
    {
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
        {
    		for(j=0;j<N;j++)
    			printf("%d ",p[i][j]);
    		printf("\n");
    	}
    }
    
    /*
     * 计算行列式的函数
     */
    
    long long mydet(int  p [100][100],int n){
    	if(n==1)  //n=1返回矩阵的唯一数,停止递归
    		return p[0][0];
    	else{
    		long long sum=0;
    		for(int i=0;i<n;i++)
    		{
    			    int pp[100][100];//用于存放少一维的矩阵,为方便直接定义为100×100.
    			for(int j=1,j1=0;j<n;j++)//去掉第一行
    			{
    				for(int k=0,k1=0;k<n;k++)
    				{
    					if(k==i)
    						;//去掉对应的列
    					else
    					{
    
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];//pp为余子式	
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
    			if(i%2)
                    sum+=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    			else
    				sum+=p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    		}
    		return sum;
    	}
    }
    
    int main(){
    	printf("N= ");
    	scanf("%d",&N);
        while(N){       //如果输入N就可以继续算下去,这个设计主要为了方便获取时间数据来计算平均用时
    		create();
    		print();
    		clock_t start_t=clock();  //开始计时
    		printf("the sum of 串行 is %lld .\n",mydet(p,N));
    	         clock_t  end_t=clock();  //结束计时
    		double   runing_t =(double)(end_t-start_t)/CLOCKS_PER_SEC;
    		printf("the runing time of 串行 is %f s.",runing_t);  //输出时间
    		printf("\n");
    		printf("N= ");
    		scanf("%d",&N);
    	}
     
    	return 0;
    }
    

    2.4.2 OpenMP代码

    /*************************************************************************
        > File Name: matrix_det_omp.c
        > Author: surecheun
        > Mail: surecheun@163.com
        > Created Time: 2017年12月07日 星期四 17时23分51秒
     ************************************************************************/
    
    #include<stdlib.h>
    #include<stdio.h>
    #include<math.h>
    #include<vector>
    #include<time.h>
    #include<omp.h>
    
    /*
     * 定义线程数
     */
    #define n_threads 2
    
     /*
     *定义矩阵的阶数为全局变量
     */
    
    int N;
    
    /*
     * 定义一个全局矩阵
     */
    
    int p[100][100];
    
    /*
     * 用随机数生成矩阵
     */
    
    void create(){
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
    	{
    		for(j=0;j<N;j++)
    	
    	     {
               int a=rand()%15;//产生随机数,并赋给数组
    	       p[i][j]=a;
    	     }
    	}
    }
          
    /*
     * 输出矩阵
     */
    
    void print()
    {
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
        {
    		for(j=0;j<N;j++)
    			printf("%d ",p[i][j]);
    		printf("\n");
    	}
    }
    
    /*
     * 计算行列式的函数
     */
    
    long long mydet(int  p [100][100],int n){
    	if(n==1)  //n=1返回矩阵的唯一数,停止递归
    		return p[0][0];
    	else{
    		long long sum=0;
    		for(int i=0;i<n;i++)
    		{
    		    int pp[100][100];
    			for(int j=1,j1=0;j<n;j++)//去掉第一行
    			{
    				for(int k=0,k1=0;k<n;k++)
    				{
    					if(k==i)//去掉和改数相同的列
    						;
    					else
    					{
    
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];	//pp为代数余子式
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
    			if(i%2)
                                              sum+=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    			else
    				sum+=p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    		}
    		return sum;
    	}
    }
    
     
    int main(){
    	printf("N= ");
    	scanf("%d",&N);
        while(N){       //如果输入的N>0,则继续计算
    		create();  //创建矩阵
    		print();   //打印创建的矩阵
    		  double start1,finish1;
                        start1=omp_get_wtime();  //开始计算时间
                        long long sum=0;
                 omp_set_num_threads(n_threads);//设置线程数
               #pragma omp parallel for reduction(+:sum)//并行化
           for(int i=0;i<N;i++)
    		{
    		    int pp[100][100];
    			for(int j=1,j1=0;j<N;j++)//去掉第一行
    			{
    				for(int k=0,k1=0;k<N;k++)
    				{
    					if(k==i)//去掉和i相同的列
    						;
    					else
    					{
    
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];	//pp为余子式
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
    			if(i%2)
    				sum+=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,N-1);
    			else
    				sum+=p[0][i]*mydet(pp,N-1);
    		}
            printf("the sum of omp is %lld .\n",sum);//输出结果
    	    finish1=omp_get_wtime();   //结束计算时间
    		double   runing_t =finish1-start1;
    		printf("the runing time of opm is %f s.",runing_t);//输出时间
    		printf("\n");
    		printf("N= ");
    		scanf("%d",&N);
    	}
    	return 0;
    	}
    

    2.4.3 MPI实现代码

    /*************************************************************************
        > File Name: matrix_det_mpi.c
        > Author: surecheun
        > Mail: surecheun@163.com
        > Created Time: 2017年12月07日 星期四 16时24分03秒
     ************************************************************************/
    
    #include<stdlib.h>
    #include<stdio.h>
    #include<math.h>
    #include<time.h>
    #include<mpi.h>
    
    /*
     *定义矩阵的阶数为全局变量
     */
    
    int N;
    
    /*
     * 定义一个全局矩阵
     */
    
    int p[100][100];
    
    /*
     * 用随机数生成矩阵
     */
    
    void create(){
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
    	{
    		for(j=0;j<N;j++)
    	
    	     {
               int a=rand()%15;//产生随机数,并赋给数组
    	       p[i][j]=a;
    	     }
    	}
    }
          
    /*
     * 输出矩阵
     */
    
    void print()
    {
    	int i,j;
    	for(i=0;i<N;i++)
        {
    		for(j=0;j<N;j++)
    			printf("%d ",p[i][j]);
    		printf("\n");
    	}
    }
    
    /*
     * 计算行列式的函数
     */
    
    long long mydet(int  p [100][100],int n){
    	if(n==1)  //n=1返回矩阵的唯一数,停止递归
    		return p[0][0];
    	else{
    		long long sum=0;
    		for(int i=0;i<n;i++)
    		{
    		    int pp[100][100];
    			for(int j=1,j1=0;j<n;j++)//去掉第一行
    			{
    				for(int k=0,k1=0;k<n;k++)
    				{
    					if(k==i)
    						;
    					else
    					{
    
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];	
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
    			if(i%2)
                    sum+=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    			else
    				sum+=p[0][i]*mydet(pp,n-1);
    		}
    		return sum;
    	}
    }
    
    
    
    int main(int argc,char *argv[]){  
    	  scanf("%d",&N);
          int num_procs,my_rank;    
          double start = 0.0, stop = 0.0;  //记录时间的变量
          long long  per_procs = 0.0;  //记录每个进程算的和
          long long  result = 0.0;  //矩阵行列式结果
          MPI_Init(&argc, &argv);  
          MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &num_procs);  
          MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &my_rank);  
          if (my_rank == 0)
    	  {//0号线程创建矩阵
            create(); 
            print(); //打印创建的矩阵
           }  
         start = MPI_Wtime();   //开始计算时间
     
          MPI_Bcast(&N, 1, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD);    //将矩阵大小广播给所有进程  
          for (int i = 0; i <N; i++)
    	  {  
          MPI_Bcast(p[i],N, MPI_INT, 0, MPI_COMM_WORLD);  
          }           //将矩阵广播给所有进程  
       
          for (int i = my_rank; i <N; i += num_procs){ //每个线程处理不同的行和列 
                long long sum_i=0;
    		    int pp[100][100];
    			for(int j=1,j1=0;j<N;j++)//去掉第一行
    			{
    		    	for(int k=0,k1=0;k<N;k++)
    				{
    					if(k==i)
    						;
    					else
    					{
    				     pp[j1][k1]=p[j][k];	
    					 k1++;
    					}
    				}
    			    j1++;
    			}
           if(i%2)
                    sum_i=(-1)*p[0][i]*mydet(pp,N-1);
          else
    		sum_i=p[0][i]*mydet(pp,N-1);
            per_procs += sum_i;  //记录每个进程的和
        }  
        MPI_Reduce(&per_procs, &result, 1, MPI_LONG_LONG_INT, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD);//在0号进程求总和  
        if (my_rank == 0){  
            printf("the sum of mpi is %lld .\n",result) ; 
            stop = MPI_Wtime();  //结束计算时间
            printf("the time of mpi is %f s\n", stop - start);  
            fflush(stdout);  
        }  
        MPI_Finalize();
        return 0;  
    }  
    
    

    4 实验结果

    4.1 正确性

    4.1.1串行

    结果分析,以 n=4为例,输出的矩阵为:

    13

    1

    12

    10

    8

    10

    1

    12

    9

    1

    2

    7

    5

    4

    8

    1




    输出结果为:3875

    和matlab计算结果一致!

    4.1.2 OpenMP

    结果分析,以 n=4为例,输出的矩阵为:

    5

    0

    8

    1

    1

    5

    11

    3

    2

    5

    1

    1

    0

    0

    14

    12







    输出结果为:-2710

    和matlab计算结果一致!

    4.1.3 MPI

    结果分析,以n=4为例,输出矩阵为:

    9

    1

    2

    7

    5

    4

    8

    1

    0

    6

    7

    1

    11

    8

    12

    9







    输出结果为:-202

    和matlab计算结果一致!

    4.2 加速比

    通过多次求平均,得到三种计算实现方法的计算时间(保留 3 位有效数字)如下:

     

    N(数)

    串行

     

    OpenMP

     

    MPI

     

    9

     

    0.0239s

     

    0.0117s

     

    0.0117s

     

    10

     

    0.195s

     

    0.105s

     

    0.100s







    柱状图如下:


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  • 转载于:https://www.cnblogs.com/chihaoyuIsnotHere/p/10552793.html

     

     

     

     

     

    转载于:https://www.cnblogs.com/chihaoyuIsnotHere/p/10552793.html

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  • Tp为使用p个处理器并行计算所花费的时间。 不能达到最佳效果(理论值)的原因: 1.不是每一部分的计算都能够并行优化 2.在并行化的过程在可能需要额外的计算或操作(如同步造成的开销) 3.进程间通信需要时间(这...

    一、加速比(speedup factor):S§=Ts/Tp
    Ts为最优顺序算法的执行时间;Tp为使用p个处理器并行计算所花费的时间。
    不能达到最佳效果(理论值)的原因:
    1.不是每一部分的计算都能够并行优化
    2.在并行化的过程在可能需要额外的计算或操作(如同步造成的开销)
    3.进程间通信需要时间(这常常是主要原因)

    二、系统效率(system efficiency)
    为了将处理器的数量纳入评估,对加速比进行改进:E§ = Ts/(p*Tp) = (S§/p)*100%绘制如下图形:
    在这里插入图片描述

    三、strong scaling & weak scaling
    1.strong scaling: 使问题规模保持不变,增加处理器数量,用于找到解该问题最合适的处理器数量。即所用时间尽可能短而又不产生太大的开销。绘制如下图形:
    在这里插入图片描述
    2.weak scaling: 让问题规模(计算量)随处理器数量增加而增加。理想情况:
    在这里插入图片描述
    strong scaling的结果较难达到,因为随着处理器数量的增加通信开销成比例上升;而weak scaling的结果较容易达到。

    四、时间复杂度分析
    在这里插入图片描述
    计算Tcomp 时只要考虑一台计算机或一个处理器的计算时间。

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  • 重建图像为2种和4种时,与重复执行多次单能CT并行重建相比,本文方法的重建过程加速比分别为1.88和3.24,其中最耗时反投影步骤加速比分别为1.90和3.66。实验和实际应用证明了该方法可有效提高双能CT重建的准确性和速度...
  • 并行计算的性能指标

    千次阅读 2018-10-21 10:55:41
    加速比 S 等于并行计算的核数 p,则称该并行程序具有线性加速比(linear speedup)。实际上,我们不可能获得线性加速比,因为多个线程/进程总是会引入一些代价。 此外,定义 E = S/p 的值为并行程序的效率。一般...
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  • 大型铝电解槽的数值仿真采用有限元分析方法,伴随着有限元模型的大型化、...数值分析结果表明:基于ANP算法的有限元并行计算方法在面对铝电解槽这类复杂三维模型时能够取得良好的划分结果,进而得到较优的并行计算加速比
  • 提出一种蒙特卡洛方法并行计算高分子的单链性质,高分子链采用自回避行走方法生成初始...利用样本之间的独立性进行并行计算达到线性加速比,使蒙特卡洛模拟高分子链的并行计算时间缩短到科学计算可以接受的时间范围。
  • 为解决串行时域多分辨率(MRTD)散射... 通过增加中央处理器核数, 程序的并行加速比随之增大, 但单核运行效率却略有降低。随着粒子尺度参数的增大, 单核计算效率随之增加, 复折射率的改变并不会显著影响并行计算效率。
  • 同时,还提出了该算法在理想状况下加速比计算公式,分析了影响并行仿真计算效率的各个因素,并以某3872节点系统为例介绍了一种估计实现最大加速比所需处理器数目的方法。在Cluster1350集群系统上的算例表明,所提改进...
  • 完数的MPI并行程序设计-并行计算

    千次阅读 2016-11-19 15:22:12
    目录 1.问题描述... 2 ... 理论加速比分析... 3 3.基于MPI的并行算法实现... 3 3.1 代码及注释... 3 3.2 单机运行... 6 3.2.1 执行结果截图... 6 3.2.2 实验加速比分析... 7 3.3
  • 并行计算中的Amdahl与Gustafson定律

    千次阅读 2016-09-22 11:13:29
    加速比S(p)=1/(f+(1-f)/p) 当p充分大时,S(p)趋向于1/f,所以,并行处理器的数量在达到充分大时,已经不能有效改善总体的处理性能。   Gustafson定律: p个处理器并行计算量/1个处理器的串行计算量 Ws表示串行部分...
  • 完数的OpenMP并行程序设计-并行计算

    千次阅读 2016-11-19 15:17:59
    目录 1.问题描述... ... 理论加速比分析... 2 3.基于OpenMP的并行算法实现... 3 3.1 代码及注释(变量名 名字首字母 开头)... 3 3.2 执行结果截图... 4 3.3 实验加速比分析... 5 3.4 遇到的问题及解决
  • 实验结果表明,提出的并行计算框架在处理数据密集型和计算密集型的海洋数据的效率上优于原生的Hadoop云平台,可达到6~8倍的加速比。因此,提出的云平台框架可以有效提高海洋信息可视化的计算效率,对我国海洋事业的...
  • 每一次遇到问题和解决问题都是一种锻炼,一种尝试,从我们上并行计算课我懂得了很多电脑硬件和软件的知识,这些可能对于我们这个专业以后都是没有机会接触的,所以我觉得选择了并行计算与多核多线程技术这门课是非常...
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  • 每一次遇到问题和解决问题都是一种锻炼,一种尝试,从我们上并行计算课我懂得了很多电脑硬件和软件的知识,这些可能对于我们这个专业以后都是没有机会接触的,所以我觉得选择了并行计算与多核多线程技术这门课是非常...
  • 目录 1.问题描述... 2 2.算法设计... 2 ... 串行算法设计...... 使用Runnable接口实现并行的算法... 理论加速比分析... 3 3.使用Runnable接口的并行算法实现... 4 3.1 代码及注释... 4 3.2 执行结果截图... 6
  • 物探材料的解释是勘探方法。 重力测量数据的解释基于数据处理和反演。 将网格划分为数百万个单元时,计算任务繁重且耗时。 为了提高3D正向建模的效率,... 当进程数为2到8时,加速比为1.97到5。MPI并行算法非常有效。
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  • 我知道,由于过度使用,有时多核操作可能单核慢,但是,我试图做一个实际上由MATLAB加速的过程 .我有一个函数,可以对2D矩阵的每个像素进行一些数学运算 . 我使用3个嵌套循环来做到这一点 .def reconstruct2D...
  • 对应北大罗老师课件:PDC08.MPI.scalability以及书《MPI与OpenMP并行程序设计:C语言版》第七章 重要公式: 加速比通用公式 ...等效加速比度量:衡量在并行计算机上执行算法的可扩展性,帮助你选择在处...
  • 本书系统介绍涉及并行计算的体系结构、编程范例、算法与应用和标准等。覆盖了并行计算领域的传统问题,并且尽可能地采用与底层平台无关的体系结构和针对抽象模型来设计算法。书中选择MPI(Message Passing Interface)...

空空如也

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并行计算加速比计算