Anaconda创建虚拟环境

每次新建工程时直接新建一个虚拟环境，可以有效避免与其他程序的依赖环境产生冲突

查看所有虚拟环境

打开控制台，输入conda --version查看conda是否安装正确并查看当前版本

控制台输入conda info --envs查看虚拟环境

可以看出当前只有一个base环境,acivate 环境名进入环境

可以看到前面多出了(base),输入deactivate退出环境

创建虚拟环境

conda create --name 环境名 python=版本号
输入conda create --name one_env python=3.6开始创建环境，如下图

这里按y确认，开始下载依赖包，完成显示如下图代表创建成功

查看创建的环境

可以看到多出了一个刚刚创建的环境

进入环境查看python版本为刚刚设置的3.6版本

不能将需要用的软件或者其他要用的东西装在base环境中；

创建一些独立的环境会比较方便我们做项目管理；

建议： base环境中不要安装任何的包，保持干净，除非你知道这个包会对原生的环境造成什么样的影响.

尽量用conda安装不同功能的软件各个env，免得它污染环境变量，使用某些软件，就激活某些env。

conda create -n genomescope2 #创建genomescope2小环境；

conda create -ndatabase python=3.7.3 #指定环境中需要带的python的版本;

需要注意两点：

=的前后不要有空格，否则命令无法被正常解析;

不输入python版本号，虚拟环境也能新建成功，但是没有python解释器，不能直接使用！

尝试创建虚拟环境

conda create -n cutadapt

报错！竟然报错了！！！

尝试登录别人的账号，发现一个问题，别人的是目录名字开头，但我的是bash，这很奇怪，当时就感觉是这个原因导致报错的

百度尝试解决问题

发现个人目录下没有.bash_profile这个文件！！！

百度后，使用两种方法结合解决了，首先cp了文件到个人目录先，然后在bash文件中，添加了命令，重启终端后，正常了。

再次尝试构建虚拟环境，成功！~

构建成功后，需要进行激活才可以使用

conda activate cutadapt

激活成功后，会在目录前面显示你的虚拟环境名称

查看所有的虚拟环境

conda env list

然后就可以进行软件的安装了

1. 为什么需要虚拟环境

在做项目时，有可能会遇到对于python中的A包，项目甲和项目乙所需的A包的版本不同，我们不可能在做项目甲时安装A包的一个版本，在做项目乙时又将A包更新到另一个版本。虚拟环境就是为了解决这样的冲突，我们创建一个虚拟环境env1，在虚拟环境env1中安装A包的一个版本，做项目甲；创建另一个虚拟环境env2，在其中安装A包的另一个版本做项目乙。

创建虚拟环境后，进入虚拟环境，系统中的各个文件夹在不同环境中仍然是共享的，只是不同环境中管理不同的包。

2.使用conda创建虚拟环境

创建虚拟环境前可以使用如下conda指令查看一些配置

• 检验是否安装及当前conda的版本

conda -V

• 查看安装了哪些包

conda list

• 检查更新conda

conda update conda

使用conda创建虚拟环境

• 创建一个虚拟环境，其中env_name是自定义的虚拟环境名字，python=x.x指定python版本

conda create -n env_name python=x.x

也可以在后面加上 --yes 参数，从而在安装过程中不需要另外确认是否要安装，效果如下，对于使用conda install pkg_name也相同

• 查看当前存在哪些虚拟环境

conda env list 或者 conda info -e

• 进入虚拟环境

conda activate en_name 或者 source activate env_name

• 进入虚拟环境后使用如下指令可以只在当前环境中安装删除包

conda install pkg_name 
conda uninstall pkg_name
pip install pkg_name
pip uninstall pkg_name

• 退出当前虚拟环境

conda deactivate 或者 source deactivate

• 删除虚拟环境

conda remove -n env_name --all

添加国内镜像源
使用conda默认的源来安装包速度非常慢，甚至失败，因此可以添加国内源来加快安装包的网速

在linux下，使用vim ~/.condarc 修改配置文件，若配置文件里面为空，直接将如下代码拷贝进去，若存在一些源，可以将其他源的链接按原先格式添加进去

# 中科大源
channels:
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
ssl_verify: true

# 清华源
channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
ssl_verify: true