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  • 矩阵相似度的度量方法
    万次阅读 多人点赞
    2018-04-18 15:35:15

    这个问题我也问过一些数学系的同学……这里我写了三种方法来度量。但某种度量的好坏……有点见仁见智了。

    def mtx_similar1(arr1:np.ndarray, arr2:np.ndarray) ->float:
        '''
        计算矩阵相似度的一种方法。将矩阵展平成向量,计算向量的乘积除以模长。
        注意有展平操作。
        :param arr1:矩阵1
        :param arr2:矩阵2
        :return:实际是夹角的余弦值,ret = (cos+1)/2
        '''
        farr1 = arr1.ravel()
        farr2 = arr2.ravel()
        len1 = len(farr1)
        len2 = len(farr2)
        if len1 > len2:
            farr1 = farr1[:len2]
        else:
            farr2 = farr2[:len1]
    
        numer = np.sum(farr1 * farr2)
        denom = np.sqrt(np.sum(farr1**2) * np.sum(farr2**2))
        similar = numer / denom # 这实际是夹角的余弦值
        return  (similar+1) / 2     # 姑且把余弦函数当线性
    
    def mtx_similar2(arr1:np.ndarray, arr2:np.ndarray) ->float:
        '''
        计算对矩阵1的相似度。相减之后对元素取平方再求和。因为如果越相似那么为0的会越多。
        如果矩阵大小不一样会在左上角对齐,截取二者最小的相交范围。
        :param arr1:矩阵1
        :param arr2:矩阵2
        :return:相似度(0~1之间)
        '''
        if arr1.shape != arr2.shape:
            minx = min(arr1.shape[0],arr2.shape[0])
            miny = min(arr1.shape[1],arr2.shape[1])
            differ = arr1[:minx,:miny] - arr2[:minx,:miny]
        else:
            differ = arr1 - arr2
        numera = np.sum(differ**2)
        denom = np.sum(arr1**2)
        similar = 1 - (numera / denom)
        return similar
    
    
    def mtx_similar3(arr1:np.ndarray, arr2:np.ndarray) ->float:
        '''
        From CS231n: There are many ways to decide whether
        two matrices are similar; one of the simplest is the Frobenius norm. In case
        you haven't seen it before, the Frobenius norm of two matrices is the square
        root of the squared sum of differences of all elements; in other words, reshape
        the matrices into vectors and compute the Euclidean distance between them.
        difference = np.linalg.norm(dists - dists_one, ord='fro')
        :param arr1:矩阵1
        :param arr2:矩阵2
        :return:相似度(0~1之间)
        '''
        if arr1.shape != arr2.shape:
            minx = min(arr1.shape[0],arr2.shape[0])
            miny = min(arr1.shape[1],arr2.shape[1])
            differ = arr1[:minx,:miny] - arr2[:minx,:miny]
        else:
            differ = arr1 - arr2
        dist = np.linalg.norm(differ, ord='fro')
        len1 = np.linalg.norm(arr1)
        len2 = np.linalg.norm(arr2)     # 普通模长
        denom = (len1 + len2) / 2
        similar = 1 - (dist / denom)
        return similar
    
    def test_similar():
        arr1 = np.array([[1,-2,3,7],[-8,2,5,9]])
        arr2 = np.array([[1, -2, 3, 7], [-8, 2, 6, 9]])
        arr3 = np.array([[-2, 3, 7], [2, 7, 9]])
        arr4 = np.array([[4, -2, 3], [-8, 2, 7]])
        print('similar arr1&2:', mtx_similar1(arr1, arr2),
              mtx_similar2(arr1, arr2), mtx_similar3(arr1, arr2), sep=' ')
        print('similar arr2&3:', mtx_similar1(arr2, arr3),
              mtx_similar2(arr2, arr3), mtx_similar3(arr2, arr3), sep=' ')
        print('similar arr2&4:', mtx_similar1(arr2, arr4),
              mtx_similar2(arr2, arr4), mtx_similar3(arr2, arr4), sep=' ')
        print('similar arr4&4:', mtx_similar1(arr4, arr4),
              mtx_similar2(arr4, arr4), mtx_similar3(arr4, arr4), sep=' ')
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    D 矩阵相似

    描述

     给出两幅相同大小的黑白图像(用 0-1 矩阵)表示,求它们的相似度。
    说明:若两幅图像在相同位置上的像素点颜色相同,则称它们在该位置具有相同的像
    素点。两幅图像的相似度定义为相同像素点数占总像素点数的百分比。

    输入

    第一行包含一个整数 n,表示图像的行列数。1 <= n <= 100。
    之后 n 行,每行 n 个整数 0 或 1,表示第一幅黑白图像上各像素点的颜色。相邻两个
    数之间用单个空格隔开。
    之后 n 行,每行 n 个整数 0 或 1,表示第二幅黑白图像上各像素点的颜色。相邻两个
    数之间用单个空格隔开。

    输出

    一个实数,表示相似度(以百分比的形式给出),精确到小数点后两位。

    (无提示)

    代码如下:

    #include<stdio.h>
    int main()
    {
    	int n,i,j,s,a[100][100],b[100][100];
    	s=0;
    	scanf("%d",&n);
    	for(i=0;i<n;i++)
    		for(j=0;j<n;j++)
    			scanf("%d",&a[i][j]);
    	for(i=0;i<n;i++)
    		for(j=0;j<n;j++)
    			scanf("%d",&b[i][j]);
    	for(i=0;i<n;i++)
    		for(j=0;j<n;j++)
    		{
    			if(a[i][j]==b[i][j])
    				s++;
    		}
    	printf("%.2f",100.00*s/(n*n));
    	return 0;
    }

    运行结果如下:

    总结:运用了数组循环语句以及if语句的判断;

    是一个很有意思的小程序。

    ps:vc6.0

    展开全文
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    计算图片相似度

    均方误差、SSIM 结构相似性度量、cosine余弦距离、直方图、互信息、指纹

    import numpy as np
    import matplotlib.pyplot as plt
    
    from skimage import data, img_as_float
    from skimage.metrics import structural_similarity as ssim
    from skimage.metrics import mean_squared_error
    
    
    img = img_as_float(data.camera())
    rows, cols = img.shape
    
    noise = np.ones_like(img) * 0.2 * (img.max() - img.min())
    rng = np.random.default_rng()
    noise[rng.random(size=noise.shape) > 0.5] *= -1
    
    img_noise = img + noise
    img_const = img + abs(noise)
    
    fig, axes = plt.subplots(nrows=1, ncols=3, figsize=(10, 4),
                             sharex=True, sharey=True)
    ax = axes.ravel()
    
    mse_none = mean_squared_error(img, img)
    ssim_none = ssim(img, img, data_range=img.max() - img.min())
    
    mse_noise = mean_squared_error(img, img_noise)
    ssim_noise = ssim(img, img_noise,
                      data_range=img_noise.max() - img_noise.min())
    
    mse_const = mean_squared_error(img, img_const)
    ssim_const = ssim(img, img_const,
                      data_range=img_const.max() - img_const.min())
    
    ax[0].imshow(img, cmap=plt.cm.gray, vmin=0, vmax=1)
    ax[0].set_xlabel(f'MSE: {mse_none:.2f}, SSIM: {ssim_none:.2f}')
    ax[0].set_title('Original image')
    
    ax[1].imshow(img_noise, cmap=plt.cm.gray, vmin=0, vmax=1)
    ax[1].set_xlabel(f'MSE: {mse_noise:.2f}, SSIM: {ssim_noise:.2f}')
    ax[1].set_title('Image with noise')
    
    ax[2].imshow(img_const, cmap=plt.cm.gray, vmin=0, vmax=1)
    ax[2].set_xlabel(f'MSE: {mse_const:.2f}, SSIM: {ssim_const:.2f}')
    ax[2].set_title('Image plus constant')
    
    plt.tight_layout()
    plt.show()
    

    参考资料

    [1]. CSDN 计算两幅图像的相似度总结 https://blog.csdn.net/u010977034/article/details/82733137

    [2]. scikit-image v0.19.0 官方文档 https://scikit-image.org/docs/stable/api/skimage.metrics.html#skimage.metrics

    展开全文
  • B.float() A, B (tensor([[7., 2., 5., 6., 3., 8., 7., 3., 6., 6.]]), tensor([[4., 4., 8., 6., 2., 3., 2., 5., 3., 6.]])) 余弦相似度 AA = F.normalize(A, p=2, dim=1) BB = F.normalize(B, p=2, dim=1) AA, ...

    引入包及生成数据

    ...
    from torch import cosine_similarity
    from scipy.stats import pearsonr
    from scipy.stats import spearmanr
    import pandas as pd
    
    A = torch.randint(10, (1,10))
    B = torch.randint(10, (1,10))
    A, B = A.float(), B.float()
    A, B
    
    (tensor([[7., 2., 5., 6., 3., 8., 7., 3., 6., 6.]]),
     tensor([[4., 4., 8., 6., 2., 3., 2., 5., 3., 6.]]))
    

    余弦相似度

    AA = F.normalize(A, p=2, dim=1)
    BB = F.normalize(B, p=2, dim=1)
    AA, BB
    
    (tensor([[0.3932, 0.1123, 0.2808, 0.3370, 0.1685, 0.4493, 0.3932, 0.1685, 0.3370,
              0.3370]]),
     tensor([[0.2703, 0.2703, 0.5406, 0.4054, 0.1351, 0.2027, 0.1351, 0.3379, 0.2027,
              0.4054]]))
    
    torch.mm(AA, BB.t())
    
    tensor([[0.8539]])
    
    cosine_similarity(A, B)
    
    tensor([0.8539])
    

    Pearson相似度

    AAA = F.normalize(A-A.mean(dim=1, keepdim=True), p=2, dim=1)
    BBB = F.normalize(B-B.mean(dim=1, keepdim=True), p=2, dim=1)
    AAA, BBB
    
    (tensor([[ 0.2829, -0.5492, -0.0499,  0.1165, -0.3828,  0.4494,  0.2829, -0.3828,
               0.1165,  0.1165]]),
     tensor([[-0.0514, -0.0514,  0.6336,  0.2911, -0.3939, -0.2226, -0.3939,  0.1199,
              -0.2226,  0.2911]]))
    
    torch.mm(AAA, BBB.t())
    
    tensor([[-0.0827]])
    
    pearsonr(A.squeeze().numpy(), B.squeeze().numpy())
    
    (-0.08265463405864518, 0.8204231681840923)
    

    Spearman相似度

    这里需要注意一下,自己实现的版本和官方实现的版本有一个细微的不同,就是比如有两个值并列第二,官方的版本会将它们的排名统一设为2.5,而不是一个2一个3

    A = torch.randint(5,100, (1,4))
    B = torch.randint(5, 100, (1,4))
    A, B = A.float(), B.float()
    A, B
    
    (tensor([[69., 68., 85., 44.]]), tensor([[29., 50., 17., 50.]]))
    

    可以看到B里面有两个50,所以要去掉重复值,来让自己算的和官方算的输出结果一致

    方案一

    B[0,1] = 55
    AAAA = (torch.argsort(torch.argsort(A))).float()
    BBBB = (torch.argsort(torch.argsort(B))).float()
    AAAA, BBBB
    
    (tensor([[2., 1., 3., 0.]]), tensor([[1., 3., 0., 2.]]))
    
    n = A.shape[1]
    1-(6*torch.sum((AAAA-BBBB)**2)/(n*(n**2-1)))
    
    tensor(-0.8000)
    

    方案二

    AAAA = F.normalize(AAAA-AAAA.mean(dim=1, keepdim=True), p=2, dim=1)
    BBBB = F.normalize(BBBB-BBBB.mean(dim=1, keepdim=True), p=2, dim=1)
    
    torch.mm(AAAA, BBBB.t())
    
    tensor([[-0.8000]])
    

    方案三

    spearmanr(A.numpy(), B.numpy(), axis=1)
    
    SpearmanrResult(correlation=-0.7999999999999999, pvalue=0.20000000000000007)
    

    方案四

    P = pd.DataFrame({'A':list(A.squeeze().numpy()), 'B':list(B.squeeze().numpy())})
    
    P.corr('spearman', )
    
    AB
    A1.0-0.8
    B-0.81.0
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