summer school
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国防科技大学 数学系 张弘
第一部分：文献检索与下载
一、背景
国产搜索引擎: 百度，搜狗，雅虎 …
文献下载
当前文献下载的囧境
出版集团利润
springer两大出版集团的净利润率远远超过bmw、苹果和谷歌，达到了惊人的35%以上。2017年elsevier收入24.78亿英镑，净利润9.13亿英镑。
课程内容
课程目的
解决文献检索和文献下载难题。
主要内容:
linux 入门
docker 入门
google scholar 使用技巧
二、linux入门
简介 linux (linux is not unix)
内核是操作系统最基本的部分。它是为众多应用程序提供对计算机硬件的安全访问的一部分软件，这种访问是有限的，并且内核决定一个程序在什么时候对某部分硬件操作多长时间。
linux 内核最初由芬兰人林纳斯·托瓦兹(linus torvalds)在赫尔辛基大学上学时出于个人爱好而编写的。
linux 系统是一套免费使用和自由传播的类 unix 操作系统，是一个基于 posix 和 unix 的多用户、多任务、支持多线程和多 cpu 的操作系统。
linux 能运行主要的 unix 工具软件、应用程序和网络协议。它支持 32 位和 64 位硬件。linux 继承了 unix 以网络为核心的设计思想，是一个性能稳定的多用户网络操作系统。
linux 发行版
linux 的发行版说简单点就是将 linux 内核与应用软件做一个打包。
市面上较知名的发行版有：ubuntu、redhat、centos、debian、fedora、suse、opensuse、arch linux、solusos 等
ubuntu 安装
虚拟机 (virtual machine)
虚拟机(virtual machine)指通过软件模拟的具有完整硬件系统功能的、运行在一个完全隔离环境中的完整计算机系统。
常见的虚拟机软件
vmware：功能强大被视为虚拟机应用程序的行业标准。
virtual box：sun oracle出品的开源、轻量级虚拟机平台。
如何使用ubuntu系统
linux常用命令
ls: 展示linux 系统目录结构
树状目录
在 linux 或 unix 操作系统中，所有的文件和目录都被组织成以一个根节点/开始的倒置的树状结构。
两个特殊的目录:
当前目录，可以使用一个点. 来表示
另一个是当前目录的上一级目录，也叫父目录，可以使用两个点 .. 来表示。
如果一个目录或文件名以一个点 . 开始，表示这个目录或文件是一个隐藏目录或文件
cd: 切换目录;
pwd, mkdir, rmdir, cp, rm, mv
绝对路径：
路径的写法，由根目录 / 写起，例如： /usr/share/doc 这个目录。
相对路径：
路径的写法，不是由 / 写起，例如由 /usr/share/doc 要到 /usr/share/man 底下时，可以写成： cd ../man
ssh: 远程登录, ssh ubuntu@***
linux下常用的终端编辑器
nano
emacs
linux 入门教材：
三、docker 入门
docker 是一个开源的应用容器引擎，基于 go 语言，并遵从apache2.0协议开源。
docker 可以让开发者打包他们的应用以及依赖包到一个轻量级、可移植的容器中，然后发布到任何流行的 linux 机器上，也可以实现虚拟化。
容器是完全使用沙箱机制，相互之间不会有任何接口(类似 iphone 的 app),更重要的是容器性能开销极低。
docker 架构
docker 使用客户端-服务器 (c/s) 架构模式，使用远程api来管理和创建docker容器。
docker 容器通过 docker 镜像来创建。
容器与镜像的关系类似于面向对象编程中的对象与类。
docker    | oop
——– | —
容器 | 对象
镜像    | 类
组件 | 作用
——– | —
docker 镜像(images)    | docker 镜像是用于创建 docker 容器的模板。
docker 容器(container) | 容器是独立运行的一个或一组应用。
docker 客户端(client) | docker 客户端通过命令行或者其他工具使用docker api 与 docker 的守护进程通信。
docker 主机(host)    |  一个物理或者虚拟的机器用于执行 docker 守护进程和容器。
docker 仓库(registry) | docker 仓库用来保存镜像，可以理解为代码控制中的代码仓库。
docker hub 提供了庞大的镜像集合供使用。
docker 安装
docker 安装: sudo apt-get install docker.io
启动docker后台服务:sudo service docker start
测试运行: sudo docker run hello-world
docker 镜像使用
列出镜像列表
‘sudo docker imges’
选项说明
repository：表示镜像的仓库源
tag：镜像的标签
image id：镜像id
created：镜像创建时间
size：镜像大小
同一仓库源可以有多个 tag，代表这个仓库源的不同个版本，如ubuntu仓库源里，有15.10、14.04等多个不同的版本，我们使用 repository:tag 来定义不同的镜像。
使用版本为15.10的ubuntu系统镜像来运行容器时，命令如下：
sudo docker run -t -i ubuntu:15.10 /bin/bash
查找镜像
我们可以从 docker hub 网站来搜索镜像，docker hub 网址为： https://hub.docker.com/
我们也可以使用 docker search 命令来搜索镜像。比如我们需要一个httpd的镜像来作为我们的web服务。我们可以通过 docker search 命令搜索 httpd 来寻找适合我们的镜像。
sudo docker search httpd
获取镜像
sudo docker pull ubuntu:15.10
创建镜像
1.从已经创建的容器中更新镜像，并且提交这个镜像
2.使用 dockerfile 指令来创建一个新的镜像
更新镜像
更新镜像之前，我们需要使用镜像来创建一个容器
docker run -t -i ubuntu:15.10 /bin/bash
docker commit -m="message: update" -a="author" containerid zhhzhc/ubuntu:v2
docker images查看
docker 容器应用举例
在docker容器中运行一个 python web应用
docker pull training/webapp  # 载入镜像
docker run -d -p training/webapp python app.py
-d:让容器在后台运行。
-p:将容器内部使用的网络端口映射到我们使用的主机上。
查看 web 应用容器
sudo docker ps
查看端口，通过浏览器访问应用
通过 -p 参数来设置不一样的端口
docker run -d -p 5000:5000 training/webapp python app.py
google mirror
sudo docker-compose -d
docker-compose.yaml文件内容为：
version: "2"
services:
google_mirror:
image: jim3ma/google-mirror
container_name: google-mirror
ports:
- "80:80"
sudo docker run -d -p 80:80 jim3ma/google-mirror
思考使用其他的镜像？
`sudo docker run -d -p 12345:12345 oddrationale/docker-SS -s 0.0.0.0 -p 12345 -k 12345 -m aes-256-cfb
四、google 使用技巧
intitle: 搜索的范围局限在标题上，只对网页的标题进行搜索并且配对，最后将结果返回给用户。 intitle: scientific computing
google会检索所有的网页，只要出现 scientific 或者 computing 其中的一个就会被匹配
allintitle:  标题包含所有关键词。allintitle: scientific computing
site: 把搜索限制在站点域名之内。scientific computing site: arxiv.org
"":  精确匹配双引号中的关键词
其它： inurl, intext, inanchor, filetype:pdf
google scholar 使用技巧
文献引用
作者信息订阅，关键词订阅
五、文献与图书下载
sci-hub
简介: sci-hub是一个线上数据库，其上提供62,000,000篇科学学术论文和文章。网站通过“.edu”代理服务器访问相关页面，也就是借用各个学校的权限，将之集成，实现文献免费下载。网站每天会上传新的论文文章，通过输入文献的链接或者doi或者pubmed号可以下载几乎所有sci论文。
作者: 哈萨克斯坦软件开发暨神经技术研究生亚历珊卓·艾尔巴金(alexandra elbakyan)建立，在2011年9月5日正式上线
镜像: sci-hub站点的本体由于受到了各大出版垄断集团的打击，经常无法访问，国内有一个网站会列出大陆地区可以正常访问的站点。www.sci-hub.tw
图书下载: 2013年开始，sci-hub与俄罗斯的教育书籍和档案数据库创世纪图书馆(library genesis - libgen)合作，在其开发的网站gen.lib.rus.es可以下载大部分英文书籍。
使用方法
可以采用论文标题，doi以及url网址等方式进行检索下载，其中最有效的方式是url网址，其次是doi (digital object identifier)，最后才是论文标题。
在出版社域名后加.sci-hub.tw下载文献。
https://www.springer.com.sci-hub.tw/gp/book/9783642640988
sci-hub是一个很好的文献下载工具，但是它并不是很好的文献检索工具，直接输入作者或者关键字是没用的，输入卷期号也并不能得到相关文献，因此，推荐大家将google scholar和sci-hub结合起来使用，采用google scholar进行检索，得到相关文献的url网址之后，再采用sci-hub来免费下载文献
六、数学新闻订阅
the cam/na digest are collections of articles on topics related to computational and applied mathematics and those who practice it

文献检索
文献检索实例
检索词选取
文献检索步骤

文献检索实例
检索字段：篇名

检索实例：2010年以来，篇名为汽车尾气监测与治理技术的核心期刊有哪些？

解决方案：

确定检索词


汽车，机动车(上位词)
尾气，废气(同义词)
监测，治理


进行检索(高级检索)

   篇名 汽车 或含 机动车 精确

并且 篇名 尾气 或含 废气  精确

并且 篇名 监测 或含 治理  精确

发表时间 从 2010-01-01 到

检索词选取
 检索词的选取一般是对检索课题中的主题词分析其同义词、上位词、下位词、相关词。

  同义词是意义完全相同的词；

  上位词是概念上外延更广的词，如水是海水的上位词，液体是海水的上位词；

  下位词是概念上内涵更窄的词，如尾气污染、废气污染是大气污染的下位词；

  相关词是意义相关的词，如出口和外贸。
文献检索步骤

分析主题内容
确定检索时间范围
确定文献类型
确定检索评价要求
确定检索是否有特殊要求

资料收集于网络，如有侵权
请联系网站删除只供学习与交流
只供学习与交流
文献检索试题和答案
一、单项选择题
(
每小题
2
分，共
30
分，每小题仅有一项答案正确。请将正确答案的序
号填在括号内
)
1
．目录、文摘和索引属于下列哪类文献
?(
B
)
A
．一次文献
B
．二次文献
C
．三次文献
D
．零次文献
2
．下面哪种检索语言是后组式规范检索语言
?(
A
)
A
．单元词语言
B
．关键词语言
C
．标题词语言
D
．自由词语言
3
．下列对
MeSH
描述错误的是
( D )
。
A
．
MeSH
从
1960
年开始出版，每年再版一次
B
．
MeSH
中的主题词具有动态性
C
．倒置主题词是为了集中排列某一类主题词
D
．
MeSH
中的主题词可以一词多义
4
．图书馆为读者提供书刊外借服务的主要部门是
(
C
)
。
A
．自动化部
B
．参考咨询部
C
．书刊流通部
D
．采访编目部
5
．以下哪项不是常用的文献传递服务方式
?(
B
)
A
．电子邮件
B
．自助借阅
C
．特快专递
D
．
FTP E
传
6
．以下哪项不是
NetLibray
提供的检索运算符
?(
C
)
A
．
NOT
B
．引号
(
”
，
)
C
．？
D
．
*
7
．中国生物医学文献服务系统
(SinoMed)
中通配符使用正确的是
(
B
)
。
A
．肝炎
*
B
．肝炎％疫苗
C
．肝炎
*
疫苗
D
．肝炎％
8
．
PubMed
自动转换匹配检索的转换顺序正确的是
(
A
)
。
A
·
MeSH
表一期刊刊名表一短语表一作者索引
B
·
MeSH
表一短语表一期刊刊名表一作者索引
C
·短语表一
MeSH
表一作者索引一期刊刊名表
D
·短语表一
MeSH
表一期刊刊名表
j
作者索引
9
·
《中华医学会期刊电子版》的检索方法支持的检索方式有
(
C
)
。
A
·快速检索、高级检索、专业检索、二次检索、期刊检索