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  • DNA序列分析

    2011-12-03 23:46:54
    关于DNA序列分析;生物爱好者,学生物的学生或是老师都可以参考
  • DNA序列分析软件

    2013-04-22 08:46:57
    DNA序列分析软件,直接安装,Windows版本。
  • bioedit DNA序列分析

    2012-11-12 17:24:30
    DNA测序后用来分析序列用 bioedit DNA序列分析
  • DNA序列分析工具,可以进行DNA序列的统计分析,引物设计等等。
  • DNA序列分析软件 DNAssit 3.10 可用于64位windows,DNAssist可不仅仅是对测序结果的。它处理我们平常需要的一些关于DNA,RNA和蛋白质的基本数据,对表达非常有帮助。这里用一个例子来说明它的功能。主要演示①对测序...
  • 这是一篇非常好的范围 ,介绍了DNA序列分析及特征基因提取方法研究
  • Jnomics是云规模DNA序列分析工具的集合
  • DNA序列分析在无脊椎动物分类中的应用,周剑君,王丹丽,本文介绍了无脊椎动物线粒体和核糖体中用于分类的常见基因,并概述了其在无脊椎动物分类中的应用,提出了种及种级以上的分类适合
  • 第三节 DNA序列分析;1.Sanger双脱氧链终止法原理;2 具体操作; 假如有一个DNA, 互补序列是GATCCGAT, 我们试着做一下;3技术路线;4.双脱氧终止法测序反应体系;Sanger法DNA测序的试剂;This figure shows the structure ...
  • SnapGene 中文视频学习教程 教学 资料分子生物学DNA序列分析

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  • 一、 安装RODBC库1、进入R语言的GUI界面(RGUI.EXE),在菜单栏选择“程序包/安装程序包2、在弹出的窗口里往下拉,选择RODBC如图,点击确定3、在ODBC数据源管理器里将需要的数据库添加进去,这里笔者使用的是SQL ...

    一、 安装RODBC库

    1、进入R语言的GUI界面(RGUI.EXE),在菜单栏选择“程序包/安装程序包

    2、在弹出的窗口里往下拉,选择RODBC如图,点击确定

    3、在ODBC数据源管理器里将需要的数据库添加进去,这里笔者使用的是SQL Server2008,驱动程序选择Native Client10.0

    3、在R语言窗口输入连接语句

    > library(RODBC)

    **这里是载入RODBC库

    > channel

    **连接刚才添加进数据源的“MyTest”数据库

    **ch

    **表示用户名为user,密码是****,如果没有设置,可以直接忽略

    > data(USArrests)

    **将“USArrests”表写进数据库里(这个表是R自带的)

    > sqlSave(channel,USArrests,rownames = "state",addPK = TRUE)

    **将数据流保存,这时候打开SQL Server就可以看到新建的USArrests表了

    > rm(USArrests)

    > sqlTables(channel)

    **给出数据库中的表

    > sqlFetch(channel,"USArrests",rownames = "state")

    **输出USArrests表中的内容

    > sqlQuery(channel,"select * from USArrests")

    **调用SELECT查询语句并返回结果(如图)

    > sqlDrop(channel,"USArrests")

    **删除表

    > odbcClose(channel)

    **最后要记得关闭连接

    当然,通过这个办法也可以读取Excel、Access表中的内容,具体方法类似,这里不再重复

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  • Sequencher_v4.1.4 DNA 序列分析的工业标准软件 Sequencher 是 DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速 Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越...
    Sequencher_v4.1.4 DNA 序列分析的工业标准软件
    Sequencher 是 DNA 序列分析的工业标准软件。它可以和所有的自动序列分析仪一同工作,并且因为它的极速 Contig 组装、很短的学习曲线、用户友好的编辑工具,以及卓越的技术支持闻名




    Mutation.Surveyor.v2.2.rar基因变异(SNP)、基因突变(Mutation) 检测软件
    MutationSurveyor是美国SoftGenetics公司开发的基因变异(SNP)、基因突变(Mutation) 检测软件。它可和标准序列比较, 快速找出a样本(或病人检体)序列图谱中所有的基因变异点.
    MutationSurveyor用来实现高通量、高灵敏度和高准确率的基因变异和基因突变检测, 如纯合子变异(Homozygote), 杂合子变异(Heterozygote), 插入/缺失(Indel)、移码突变以及杂合子插入/缺失(Heterozygous Insertion and Deletion)。它具有优异的准确性及敏感度,可以接收大部分的定序图谱档案,如Applied BioSystems, Beckman Coulter或MegaBACE系统的输出数据,应a用在研发、诊断、分析DNA特异性上都是最佳的工具。
    MutationSurveyor在突变检测领域运用了两项世界首创技术:反相关曲线技术和准确识别插入/缺失杂合子突变技术。目前该软件已被全世界数百家知名机构使用,在《Sciences》和《Nature》上已经出现了10篇应用MutationSurveyor研究 DNA 碱基突变学术报告。其中四篇文章分别被《Sciences》杂志评为当年全球十大科技突破中的一项。
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    InteLigand.LigandScout.v2.03.Linux 1CD


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    Life.Sciences.Clinical.Genomics.Assimilation.Module.v3.2 1CD(用于进行临床医学基因组研究的分析软件。


    Life.Sciences.Clinical.Genomics.HL7.CDA.Builder.v3.2 1CD     它们分别用于序列识别,特定基因构建等功能)


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    Simpleware.ScanIP.ScanFE.ScanCAD.v3.1.WinNT_2K 1CD(口腔外科医学分析软件)


    Tripos.Muse.v1.3 1CD(全新药物设计) 


    Tripos.SYBYL-X.v2.0.0.11273.Windows-ISO 1CD(分子模拟软件)


    Tripos.SYBYL-X.v2.0.0.11273.Linux32_64-ISO 1DVD


    Tripos.SYBYL-X.ORCHESTRAR.Databases.v0808.231-ISO 1DVD


    Tripos.SYBYL-X.PRODAT.Database.v0808.231-ISO 1DVD


    Tripos.Sybyl.v7.3.Unix-ISO 4CD+1DVD


    Tripos.Sybyl.v8.0.SP6.Update.Only.Linux & Irix 1CD


    Tripos.Sybyl.v8.0.Linux & Irix-ISO 1CD+2DVD(SYBYL软件包,Tripos出品的专业分子模拟平台,涵盖了分子模拟与显示、定量构效


                                                 关系和ADME、药效团模型、生物信息学、基于结构的药物设计、化学信息学和数据库、


                                                 组合化学和分子多样性、NMR数据处理、化合物实体提供等多种与药物研究和开发相关的


                                                 方向,为用户提供全面的药物设计和生物化学研究的解决方案)
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  • dnaman dna序列分析软件

    2009-11-13 19:25:00
    关于dna系列分析的一个比较好的软件,小而简单
  • DNA 序列片段的分类问题中, 所遇到的每一个DNA 片段都由少则近百多则上千万的A、T、C、G 构成的字符串, 指标的度量没有明确的数量表示, 只有次序关系, 如果将该字符串对应于由一个数量作为分量的向量表示, 则不仅...
  • 背景:多序列比对(MSA)算法是比较和分析DNA序列的传统方法。 但是,对于大的DNA序列,这些算法需要较长的计算时间。 目的:在这里我们将提出一种新的数值方法来快速表征和比较DNA序列。 方法:基于新的二维(2D)...
  • DNA序列数据是一类重要的生物数据,也是...介绍了DNA序列数据特性,并对DNA序列分析技术的研究现状以及进展进行了综述,给出了DNA序列数据分析的热点问题,包括DNA序列的数据存储方式和基于DNA生物特性的分析模型等.
  • DNAssit用于分析DNA序列

    2013-05-05 01:27:05
    分析DNA序列
  • 一款DNA序列比对的软件,可用于DNA序列分析、比对,酶切位点的查找等。
  • 几种DNA序列分析方法的比较,肖静,朱义胜,本文在对DNA序列数值化的基础上,对DNA序列进行了直接傅立叶变换,自相关函数法的谱分析,和Wigner-Ville分布方法的时频分析,从中得到
  • DNA序列的分类模型

    2011-08-17 22:13:16
    自己写的DNA序列分析,定义了综合指标,用了RBF和fisher,聚类。我感觉就冲这原创性,可以值这个分数。你说你下载了,交上去,肯定是可以过关的,是不?》
  • DNA序列分割作为DNA序列分析中的一部分正受到越来越多人的关注,引入数据挖掘技术是提高DNA序列分割有效性的一个重要途径。全面综述了目前数据挖掘技术在DNA序列分割中的应用,最后指出了尚待解决的问题。
  • 基于K字的DNA序列相似性分析
  • 人类基因组计划中的DNA序列图谱是生命科学和基因工程中的伟大成就,要解译隐藏在基因组中的生物信息还有一段很长的路要走,这是因为DNA序列的结构很难分析和识别,作者提出一种用于DNA序列结构分析的特征抽取方法,...
  • 针对传统方法在分析DNA序列相似性方面的不足, 提出了一种新的基于信息量的DNA序列相似性分析算法, 该方法将DNA序列视为基于符号集{A, C, G, T}的信号序列, 全部待比较的DNA序列组合成一个以字符A、C、G、T为属性值的...
  • DNA序列

    2018-08-03 09:37:15
    一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因...

    题目描述

    一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

    给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

    输入描述:

    输入一个string型基因序列,和int型子串的长度

    输出描述:

    找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

    输入:

    AACTGTGCACGACCTGA
    5

    输出:

    GCACG

    代码如下:

    a = input()
    n = int(input())
    m = len(a)
    res = 0
    re = []
    for i in range(m - n + 1):
        buff = a[i:i+n].count("G")+a[i:i+n].count("C")
        if res < buff:
            res = buff
            re = a[i:i+n]
    print(re)

     

    展开全文
  • 此处利用子串–互补串匹配技术通过对DNA序列已通过统计测量的方法对DNA数据进行处理,对结果进行对比分析,将测量数据转换为可视图,对批量复杂DNA序列的提取特征数据进行可视化分析。通过结果图示,可以看到选择的...

空空如也

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dna序列分析