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密度聚类
2018-06-28 23:02:17密度聚类,本质上就是基于一种密度的概念来进行聚类。而密度的定义本质上也是来自于两点的距离,所以其实对于聚类的算法来看,大家本质上都差不多,谁也别笑话谁。下面我们来总结介绍一种叫做DBSCAN的密度算法。 ...引言
其实对于所有的聚类问题,都有一个核心点,那就是以什么样的规则来划分两个点是不是同一类。密度聚类,本质上就是基于一种密度的概念来进行聚类。而密度的定义本质上也是来自于两点的距离,所以其实对于聚类的算法来看,大家本质上都差不多,谁也别笑话谁。下面我们来总结介绍一种叫做DBSCAN的密度算法。
DBSCAN
DBSCAN 的全称是 Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise
单词里面有个noise,这就说明我们的算法是能抗噪声的,并且我们的算法是可以在空间中聚类为任意形状的聚类的,这点是一些其他的聚类算法不具备的性质,如下所示:
具有这样的性能,就是因为我们的算法引入了“邻域”(其参数为)的概念来刻画样本的紧密程度的算法。下面我们来介绍一下这个算法,在具体算法之前,我们先看几个定义,非常简单,但是可能比较绕,懂了这几个定义,下面的算法就是小菜一碟了。
基于密度的几个概念
邻域:
对,其邻域是指样本集中与距离不大于的样本,即
核心对象:
对象的邻域中至少包含个样本,即,则称为核心对象。
密度直达:
若位于的邻域中,且是核心对象,则称由密度直达。
密度可达:
对与,存在样本序列且 且由密度直达,则称由密度可达。
其实这个概念本质上要求都是核心对象
密度相连:
对与,若存在使得与均由密度可达,则称由密度相连。
下图直观的表示了这几个概念
基于上面的概念,可以定义DBSCAN算法里面的簇的定义
簇: 由密度可达关系导出的最大的密度相连的样本集合。
因此实际上簇满足下面的两个条件:
连接性: 与密度相连
最大性: 且由密度可达
实际上就是核心对象以及与其密度可达的所有的点的集合
本质上相当于一些核心对象以及边界点组成了簇,簇中核心的点就是核心对象。
具体算法描述
实际上就是核心对象以及与其密度可达的所有的点的集合
输入
- 样本集
- 邻域参数
算法流程
- 找出所有的核心对象,放入集合中
- 初始化未访问的样本集合:
-
-
- 随机选取一个核心对象,初始化
-
-
- 从 中取出样本
- 是核心对象
- 另, 即获取核心对象邻域内的点
- 将内的点加入到中
-
-
-
- ,并且生成聚类簇
输出
簇划分
算法的优缺点
优点:
- 算法不需要指定聚类的数目,但是算法实际上需要另外两个参数,所以这个优点也是勉强。
- 可以聚成任意形状的类,就像开始的图所示
- 能够识别出噪声点
缺点:
- 对高维数据效果不算好
- 如果样本的密度不均, 效果会不理想
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密度聚类——python实现密度聚类(DBSCAN)
2019-03-19 19:41:00 -
密度聚类算法python详解_密度聚类python
2020-12-01 10:11:13本人在此就不搬运书上关于密度聚类的理论知识了,仅仅实现密度聚类的模板代码和调用skelarn的密度聚类算法。 有人好奇,为什么有sklearn库了还要自己去实现呢? 其实,库的代码是比自己写的高效且容易,但自己实现...广告关闭
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本人在此就不搬运书上关于密度聚类的理论知识了,仅仅实现密度聚类的模板代码和调用skelarn的密度聚类算法。 有人好奇,为什么有sklearn库了还要自己去实现呢? 其实,库的代码是比自己写的高效且容易,但自己实现代码会对自己对算法的理解更上一层楼。 #调用科学计算包与绘图包import numpy as npimport random...
版权声明:本文为博主原创文章,未经博主允许不得转载。 https:blog.csdn.nethaluoluo211articledetails78524599 本文主要内容:聚类算法的特点聚类算法样本间的属性(包括,有序属性、无序属性)度量标准聚类的常见算法,原型聚类(主要论述k均值聚类),层次聚类、密度聚类k均值聚类算法的python实现,以及聚类算法与em...
dbscan算法是一种很典型的密度聚类法,它与k-means等只能对凸样本集进行聚类的算法不同,它也可以处理非凸集。 关于dbscan算法的原理,笔者觉得下面这篇写的甚是清楚练达,推荐大家阅读:https:www.cnblogs.compinardp6208966.htmldbscan的主要优点有:1) 可以对任意形状的稠密数据集进行聚类,相对的,k-means之类...
任务需求:现有140w个某地区的ip和经纬度的对应表,根据每个ip的24块进行初步划分,再在每个区域越100-200个点进行细致聚类划分由于k值未知,采用密度的mean shift聚类方式。 0#目录:原理部分框架资源实践操作效果展示1#原理部分关于kmeans纯代码实现可以移步之前的一篇机器学习-聚类算法-k-均值聚类-python详解在...
问题是,许多聚类算法,如k-means和hierarchical agglomerative clustering,要求我们提前指定簇的数量。 在这个例子中,我们知道只有五个足球运动员,但在实际应用中,你可能并不知道数据集中有多少个人。 因此,我们需要使用基于密度或基于图的聚类算法,这样的算法不仅可以聚类数据点,还可以根据数据密度确定聚类...
作者:vihar kurama机器之心编译参与:geek ai、路本文简要介绍了多种无监督学习算法的 python 实现,包括 k 均值聚类、层次聚类、t-sne 聚类、dbscan 聚类。 无监督学习是一类用于在数据中寻找模式的机器学习技术。 无监督学习算法使用的输入数据都是没有标注过的,这意味着数据只给出了输入变量(自变量 x)而没有...
一.前述密度聚类是一种能降噪的算法。 很多时候用在聚类形状不规则的情况下。 二.相关概念先看些抽象的概念(官方定义):1.? 对象o的是与o为中心,? 为半径的空间,参数? 是用户指定每个对象的领域半径值。 2.minpts(领域密度阀值):对象的? 的对象数量。 3.核心对象:如果对象o? 的对象数量至少包含minpts个对象...
密度聚类概念:? image?image算法流程: 1. 如果一个点的领域包括了多于m个点的对象,那么就把他作为一个核心对象。 2.寻找直接密度可达的对象 3. 没有更新时结束 包含过少对象的会被认为是噪声。 python实现:还是使用iris数据集:import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import pandas as pd import...
dbscan (density-based spatial clustering of applications with noise)是一种基于密度的聚类算法,基于密度的聚类寻找被低密度区域分离的高密度区域...容易产生“维数灾难”(聚类算法基于欧式距离的通病) dbscan 聚类 python 实现#coding=utf-8created on 20191012 11:42 @author:ewdager import numpy as...
dbscan能够在带有噪点的样本空间中发现任意形状的聚类并排除噪点。 dbscan算法不需要预先指定聚类数量,但对用户设定的参数非常敏感。 当空间聚类的密度不均匀、聚类间距差相差很大时,聚类质量较差。 dbscan算法基本概念:核心对象:如果给定对象的半径eps邻域内样本数量超过阈值min_samples,则称为核心对象...
然后把我们找到的rho和sigma都很大的点作为簇中心,再利用k-means或者dbscan算法进行聚类就能得到相对比较好的结果。 参考来源 聚类分析(五)基于密度的聚类算法 — dbscan聚类算法第三篇-密度聚类算法dbscan 聚类算法初探(五)dbscan,作者:peghoty 聚类算法第一篇-概览 sklearn.cluster.dbscan 【挖掘模型】...
和密度聚类的具体步骤。 在本次文章中,我们将通过一个小的数据案例,讲解如何基于python实现密度聚类的实战。 函数说明----在python的sklearn模块中,cluster子模块集成了常用的聚类算法,如k均值聚类、密度聚类和层次聚类等。 对于密度聚类而言,读者可以直接调用cluster子模块中的dbscan“类”,有关该“类”的...
接下来我可以继续分享python相关的知识点,主题包含数据可视化、数据分析和数据挖掘。 前言在第29期,我们分享了有关k均值聚类的项目实战,本期将介绍另一种聚类算法,那就是基于密度聚类的算法。 该算法的最大优点是可以将非球形簇实现恰到好处的聚类,如下图所示,即为一个非球形的典型图形:? 如上图所示,右上角...
物以类聚,人以群分,平常我们把人和物进行分类,今天来讲一讲如何通过dbscan用数据把样本进行聚类。 1. dbscan 定义dbscan (density-based spatial clustering of applications withnoise)是一种基于密度的聚类算法。 与k均值聚类和层次聚类不同,它将簇定义为密度相连的点的最大集合,能够把具有足够高密度的区域...
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python中的t-sne聚类实现,数据集是iris数据集:这里iris数据集具有四个特征(4d),它被变换并以二维图形表示。 类似地,t-sne模型可以应用于具有n个特征的数据集。 dbscan聚类 dbscan(density-based spatial clustering of applications withnoise,具有噪声的基于密度的聚类方法)是一种流行的聚类算法...
简要的说明: dbscan为一个密度聚类算法,无需指定聚类个数。 python的简单实例: 1 # coding:utf-8 2 from sklearn.cluster import dbscan 3 import numpy as np 4 importmatplotlib.pyplot as plt 5 from sklearn import metrics 6 from sklearn.datasetsimport make_blobs 7 from sklearn.preprocessing import ...
之前一直用r,现在开始学python之后就来尝试用python来实现kmeans。 之前用r来实现kmeans的博客:笔记︱多种常见聚类模型以及分群质量评估(聚类注意事项、使用技巧)聚类分析在客户细分中极为重要。 有三类比较常见的聚类模型,k-mean聚类、层次(系统)聚类、最大期望em算法。 在聚类模型建立过程中,一个比较关键...
在给定样本的情况下,聚类分析通过特征相似性或者距离的度量方法,将其自动划分到若干个类别中。 常用的聚类分析方法包括层次聚类法(hierarchical clustering)、k均值聚类(k-meansclustering)、模糊聚类(fuzzy clustering)以及密度聚类(density clustering)等。 本节我们仅对最常用的kmeans算法进行讲解。?...
重复2,直到高维球内的密度随着继续的球心滑动变化低于设定的阈值,算法结束具体的原理可以参考下面的地址,笔者读完觉得说的比较明了易懂:http:blog.csdn.netgoogle19890102articledetails51030884而在python中,机器学习包sklearn中封装有该算法,下面用一个简单的示例来演示如何在python中使用mean-shift聚类...
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26、python密度聚类方法(DBSCAN密度聚类)
2019-01-03 14:42:15密度聚类:只要临近区域的密度、对象、或者数据点的数目超过耨个阈值,就继续聚类,可以根据与周伟特点进行聚类 kmeans和分层聚类都是基于距离进行聚类,只能发现球状的簇,五发现其他形式的簇 ...1、DBSCAN概念
基于密度的带噪声的空间聚类应用算法,它是将簇定义为密度相连的点的大集合,能够把足够高密度的区域划分为簇,并且可在噪声的空间数据集中发现任意形状的聚类。2、密度聚类和距离聚类
密度聚类:只要临近区域的密度、对象、或者数据点的数目超过耨个阈值,就继续聚类,可以根据与周伟特点进行聚类
kmeans和分层聚类都是基于距离进行聚类,只能发现球状的簇,五发现其他形式的簇
3、其他概念
01密度:空间中任意一点的密度是以该点为圆形,以Eps为半径的圆区域内包含的点数目。
02 领域: 空间中任意一点的领域是以该点为圆心、以Eps为半径的圆区域内包含的点数目。
03 核心点:空间某一点的密度,如果大于某一给定阈值MInPts,则称为边界点。
04 噪声点:数据集中不属于核心点,也不属于边界点的点,也就是密度值为1的点
4、聚类方法
model=sklearn.cluster.DBSCAN(eps,min_samples)
eps 领域的大小,使用圆的半径表示
min_samples 点的个数的阈值model.fit_predict(data)
data 数据
训练模型并且进行预测的方法
5、案例
import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt data = pd.read_csv('D:\\DATA\\pycase\\number2\\7.2\\data.csv') plt.plot( data['x'], data['y'], '.', color='r' ) # 只能画出一种颜色,scatter可以根据标签类型区分绘画分类 # 导入DBSCN训练算法 from sklearn.cluster import DBSCAN eps=0.2 # 领域的大小,使用圆的半径表示 MinPts=5 # 领域内,点个数的阈值 model=DBSCAN(eps,MinPts) # 数据匹配 data['type']=model.fit_predict(data) # 绘图 plt.scatter( data['x'], data['y'], c=data['type'] # 表示颜色 )
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2021-01-28 21:18:17本文实例讲述了Python基于聚类算法实现密度聚类(DBSCAN)计算。分享给大家供大家参考,具体如下:算法思想基于密度的聚类算法从样本密度的角度考察样本之间的可连接性,并基于可连接样本不断扩展聚类簇得到最终结果。... -
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2018-12-05 10:26:26密度聚类数据,用于https://blog.csdn.net/zhenguipa8450/article/details/78938890#commentsedit文中提到的算法 -
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2018-03-05 11:13:12DBSCAN密度聚类的相关的知识内容可以参考 http://blog.csdn.net/luanpeng825485697/article/details/79438025 DBSCAN The DBSCAN 算法将聚类视为被低密度区域分隔的高密度区域。由于这个相当普遍的观点, ... -
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