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  • linux安装R3.5.0

    2018-11-07 18:28:58
    本文主要介绍在linux安装和卸载R3.5.0的方法,并给出我再安装过程中遇到问题的解决方法 安装方法:yum在线安装 和 源码编译安装 一:安装 第一种:yum在线安装 1.安装并启动EPEL(如果已经安装,可直接执行第...

    系统:linux CentOS7

    本文主要介绍在linux下安装和卸载R3.5.0的方法,并给出我再安装过程中遇到问题的解决方法

    安装方法:yum在线安装 和 源码编译安装

    一:安装

    第一种:yum在线安装

    1.安装并启动EPEL(如果已经安装,可直接执行第二步)

    yum install epel-release

    2. 安装R

    yum install R

    3. 安装完成后,直接在终端输入R然后回车之后出现类似如下的内容表示安装成功

    第二种:源码编译安装

    1. 首先从官网下载3.5.0版本(或从我的资源下载)

    2. 解压安装包

    一般我会我将文件解压在/usr/local/文件夹下

    tar -zxvf R-3.5.0.tar.gz

    3. 安装依赖环境

    yum install -y gcc

    yum install -y glibc-headers

    yum install -y libreadline6-dev gfortran

    yum install -y readline-devel

    yum install -y wget libXt-devel

    yum install -y fonts-chinese tcl tcl-devel tclx tk tk-devel

    yum install -y mesa-libGLU mesa-libGLU-devel

    yum install -y install bzip2-devel

    yum install -y install xz-devel.x86_64

    yum install -y install pcre-devel

    yum install -y install libcurl

    yum install -y install libcurl-devel

    yum install -y  texinfo.x86_64

    yum install -y texlive-pdftex-doc.noarch

    yum install -y texlive

    yum install gcc-gfortran

    4. 建立编译后的文件夹R

    比如我建立在/usr/local/R下

    mkdir /usr/local/R

    5. 开始编译安装

    进入R-3.5.0

    cd /usr/local/R-3.5.0

    /configure --enable-R-shlib=yes --with-tcltk --prefix=/usr/local/R

    make

    make install

    6. 安装完成后,配置环境变量

    vim /etc/profile

    R_HOME=/usr/local/R

    PATH=$PATH:$R_HOME/bin

    source /etc/profile

    二. 卸载

    一. 卸载通过yum安装的R

    1. 查看安装的R

    um list installed | grep R

    2. 删除文件

    使用yum remove 命令删除已安装的R相关文件(当删除一个文件时有时会删除与之相关的文件)

    yum remove R.x86_64

    yum remove R-core.x86_64

    yum remove R-java.x86_64

    yum remove R-java-devel.x86_64

    yum remove libRmath.x86_64

    二. 卸载通过源码编译安装的R

    第一,安装软件的时候如果使用 --prefix这个命令,如果有那就把你指定的文件给删除了就行了,
    第二,如果没有用这个指定就麻烦一点了,那就进入到软件解压后的目录,执行sudo make uninstall看能否成功

     

    源码安装时问题:

    1. configure: error: libcurl >= 7.22.0 library and headers are required with support for https

    问题解决参考:

    https://segmentfault.com/a/1190000007553604?from=singlemessage

    https://www.jianshu.com/p/edb234eed915

    2. libR.so:cannoet open shared object file:Nosuch file or directory

    如果安装的过程中,如果发现libRblas.so、libRlapack.so、libR.so等找不到,需要从$R_HOME/lib将这些library拷贝到/usr/lib64目录下:
        [root@Hadoop-NN-01 ~]# cp /usr/lib64/R/lib/libRblas.so /usr/lib64/
        [root@Hadoop-NN-01 ~]# cp /usr/lib64/R/lib/libRlapack.so /usr/lib64/
        [root@Hadoop-NN-01 ~]# cp /usr/lib64/R/lib/libR.so /usr/lib64/
        最终问题可以解决,完成rhbase的安装。

    如果在lib文件夹中找不到libR.so说明编译有问题,由于“编译缺少enable-R-shlib导致,需要重新编译R

    3. 安装R包时:Error: package or namespace load failed for ‘haven’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):

    在R命令行界面运行,安装haven,withr::with_makevars(c(PKG_LIBS = "-liconv"), install.packages("haven"), assignment = "+=")

    4. libiconv.so.2: cannot open shared object file: No such file or directory

    安装libiconv.so.2

    参考:https://blog.csdn.net/helonSY/article/details/7278437
               https://blog.csdn.net/jk110333/article/details/7556626

    5. package ‘birch’ is not available (for R version 3.5.0)

    下载birch包,birch_1.2-3.tar.gz     地址:https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/birch/
            安装依赖的ellipse包   install.packages('ellipse')
            安装birch              install.packages("/home/hadoop/upload/birch_1.2-3.tar.gz",repos=NULL)
        参考:http://bbs.pinggu.org/thread-3631842-1-1.html

    展开全文
  • linux系统安装R

    2015-08-22 20:47:01
    一、先通过ssh将R安装包R-3.2.2.tar.gz从本机拷贝到你的linux虚拟机上的/home下; 二、解压安装包 #tar -zxvf R-3.2.2.tar.gz 三、1)、进入到解压后的R-3.2.2目录下 执行./configure --prefix=/home/Rhome --...

    一、先通过ssh将R安装包R-3.2.2.tar.gz从本机拷贝到你的linux虚拟机上的/home下;

    二、解压安装包 #tar -zxvf R-3.2.2.tar.gz

    三、1)、进入到解压后的R-3.2.2目录下

    执行./configure --prefix=/home/Rhome --with-readline=no --with-libpng=yes --with-x=no

    如果出现configure: error: No F77 compiler found这种错误,执行yuminstall gcc-gfortran 即可解决

    2)、make

    3)、make install

    4)、配置R环境变量

    #vim /etc/profile

    在path中加入/home/Rhome/bin

    在执行 source /etc/profile使配置生效

    四、至此R安装结束


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  • Linux系统安装R语言

    2018-01-15 23:42:02
    其实,在ubuntu linux 系统下利用其提供的apt-get命令可以方便的安装R语言。工具/原料 ubuntu5.10 方法/步骤 进入系统,打开终端。输入命令:sudo -s。回车,输入用户密码,将权限提升为root权限。Lin

    R语言是一款开源、免费的用于绘图和统计分析的语言和集成环境。该语言使用起来十分方便,提供了许多扩展包供下载使用。目前网上一些linux安装R语言的教程太过繁琐。其实,在ubuntu linux 系统下利用其提供的apt-get命令可以方便的安装R语言。

    工具/原料
    ubuntu5.10
    方法/步骤
    进入系统,打开终端。输入命令:sudo -s。回车,输入用户密码,将权限提升为root权限。

    Linux系统安装R语言
    输入命令:apt-get update。获取最新软件包信息。

    Linux系统安装R语言
    使用命令:apt-get install r-base。自动安装R语言。

    Linux系统安装R语言
    安装过程中,若出现选择提示,一律选择允许。安装完成后,输入R,出现如图所示的画面,安装成功。

    Linux系统安装R语言
    安装扩展包(软件包)方法:首先输入命令R,进入R语言环境。然后输入命令install.packages(“软件包名称”),回车。在弹出的HTTPS CRAN中选择,China(Beijing4)[https]。选择后,会自动安装,静待即可。

    Linux系统安装R语言
    Linux系统安装R语言
    END
    注意事项
    apt-get命令自动安装时已经配置好了环境变量,请勿重新手动配置。

    展开全文
  • 更多R语言资讯,欢迎关注我的新浪微博:Jenny爱学习 微信公众号:R语言数据分析与实践 ...很多Linux系统已经预先安装好R,可以在UNIX或者BASH窗口中运行R,只要键入命令:  R 即可打开一个R的解...

    更多R语言资讯,欢迎关注我的新浪微博:Jenny爱学习

    微信公众号:R语言数据分析与实践

     

    关于Linux的配置及安装, 请点击链接查看 : 在Mac 上搭建Linux虚拟机--MacOS & VMware10 & CentOS 7

    很多Linux系统已经预先安装好R,可以在UNIX或者BASH窗口中运行R,只要键入命令:

               R

    即可打开一个R的解释器,接下来就可以运行R命令,并在完成工作之后,通过命令q()关闭解释器。但是你可能想要最新的版本。CRAN网站提供了适用于Debian、Redhat、SUSE和Ubuntu系统的R源代码文件,可以通过单击Download R for Linux获得。

     

    1. 登陆官网:

        https://www.r-project.org点击打开链接

        找到左侧Download下方CRAN

     

    进入CRAN,会出现如下镜像位置的下载链接:

     

     

    拖动网页,找到China的下载链接,选择离自己地理位置最近的镜像文件链接进行安装,(几个链接位置分别是清华大学、中国科学与技术大学、浙江大学)

          将会打开如下网页:选择第一个Download R for Linux

    不同的Liunx系统,安装过程会略有不同,CRAN针对不同的源代码版本提供了对应的文档手册或者README文件以解释不同版本的具体安装方法。

     

     

    如果本篇文章对您有帮助,

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